1
Genetika
laboratorních zvířat
Zvířecí (animální) laboratorní modely
➢Nematoda
➢Dánio
➢Drosophila
➢Ptáci, hlodavci, domácí zvířata, lidoopi
Využití LZ (USA) Využití LZ (USA procedures)
1 2
3 4
2
Využití LZ (UK) Využití LZ (DE)
Netradiční laboratorní modely Zvířecí (animální) laboratorní modely
➢Nematoda
➢Dánio
➢Drosophila
➢Ptáci, hlodavci, domácí zvířata, lidoopi
5 6
7 8
3
Příklad nabídky v ČR
Potkani
✓ Outbrední kmeny (8)
✓ Inbrední kmeny (4)
✓ Speciální kmeny (18)
Myši
✓ Outbrední kmeny (7)
✓ Inbrední kmeny (9)
✓ Hybridní kmeny (4)
✓ Speciální kmeny (5)
✓ Imunodeficientní kmeny (9)
✓ JAX (1)
Ostatní druhy (křeček zlatý, morče, králík, pískomil)
https://www.greenpets.cz%2Fpotkan-
laboratorni%2F&psig=AOvVaw32ryX46oXhTas
MU2l6y9qR&ust=1646131607036000&source=
images&cd=vfe&ved=0CAsQjRxqFwoTCLjMw
NKcovYCFQAAAAAdAAAAABAD
Myší model
✓ Druhý sekvenovaný savčí genom (2002)
✓ Pravidla a nomenklatura
http://www.informatics.jax.org/
✓ Databáze
Zvířecí (animální) laboratorní modely
➢Nematoda
➢Dánio
➢Drosophila
➢Ptáci, hlodavci, domácí zvířata, lidoopi
9 10
11 12
4
Genetika LZ: myší kmeny
Petkov et al. 2021
Myš jako model lidských onemocnění
➢http://www.cmhd.ca/databases/index.html
➢http://www.informatics.jax.org/
➢http://www.mouseclinic.de/
Myš jako model lidských onemocnění
Myš jako model lidských onemocnění:
Downův syndrom
➢https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2893810/
13 14
15 16
5
Genetika LZ
Základní genetické rozdělení
➢Outbrední LZ
➢Inbrední LZ
Genetika LZ
Základní genetické rozdělení
➢Outbrední LZ
➢Inbrední LZ
Genetika LZ
Základní genetické rozdělení
➢Outbrední LZ
➢Inbrední LZ
Inbríding
Jev, který nastává po
páření příbuzných
jedinců
17 18
19 20
6
Inbríding
X
O
M
A
B
C
D
INBRÍDING
X
O
D
A
B
O
M
INBRÍDING
X
O
D
A
B
O
M
Inbríding
X
B
S
O
M
O
M
21 22
23 24
7
Inbríding
https://slideplayer.cz/slide/5645547/6/images/28/inbredn%C3%AD+
deprese+u+%C4%8Dlov%C4%9Bka%3A.jpg
Inbríding
➢Společný předek do 5.
generace
➢Homozygotnost
Inbríding
➢Účinky: genotyp/genofond
➢Účinky: fenotyp
Neinbrední kmeny myší
➢ Bez identifikovaného původu
➢ Definovaného původu
➢ Uzavřené populace
#
25 26
27 28
8
Inbrední kmeny myší
základní rozdělení
➢ Syngenní (isogenní)
➢ Rekombinantní
➢ Koisogenní
➢ Kongenní
➢ Mutantní
➢ Transgenní
➢ Knock-out, knock-in
Syngenní (isogenní) kmeny (IS)
AaBb
AABB AAbb aaBB aabb
➢ Vzniklé opakovaným pářením
bratr x sestra (>20 x)
➢ Geneticky identické - isogenní
➢ 100% (?) homozygotní
Syngenní (isogenní) kmeny (IS)
Rekombinantní kmeny (RI)
AABB x aabb
AaBb
AABB AAbb aaBB aabb
29 30
31 32
9
„Ko-“ kmeny
➢Ko-izogenní
➢Kongenní
➢Konsomický
➢ Konplastický
Kmeny
Rogner and Avner 2003
Kongenní kmeny
➢ Vzniklé zpětnými kříženími
➢ Odlišnost v jediné oblasti
(více lokusů)
Kongenní kmeny
A x B
AB x B
ABB x B
ABBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB
33 34
35 36
10
„Ko-“ kmeny
✓Ko-izogenní
✓Kongenní
✓Konsomický
✓Konplastický
Mutantní kmeny
➢ Mutant Strain (MSR)
➢ Mutant Stock (MSK)
Jiné kmeny
➢ Wild-Derived Inbred Strains
(WDS)
➢ Knock-out, knock-in, transgenní
(TG)
Kmeny/linie LZ (myší/LZ)
➢ Existující: >24.000
➢ Potenciál: 200.000
International Mouse Strain Resource Center
(IMSR)
http://www.findmice.org/
37 38
39 40
11
Transgenní zvířata
Hryhorowicz et al., 2020
Využití LZ (USA)
Etika pokusů na zvířatech
https://www.enviweb.cz/tmp/thumbnails/712/f2/f22419cca6ccefce6c
47498ed8c1b298.jpg
Využití kmenů LZ
✓Standardizace
✓Biomodely
✓Etika pokusů na zvířatech
41 42
43 44
12
Využití LZ (USA)
45