Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 1 Sacharidy - 1  Přehled strukturních forem sacharidů.  Glykoproteiny a glykosylace.  Transportéry glukosy přes plasmatickou membránu.  Glykolýza. Regulace glykolýzy.  Glukoneogeneze.  Regulace glykolýzy a glukoneogeneze.  Substrátové cykly.  Coriho cyklus.  Pentosafosfátová dráha. Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 2 Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 3 Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 4 6. Sacharidy Sacharidy jsou aldehydy nebo ketony s hydroxylovými skupinami. Tvoří většinu organické hmoty na Zemi, hrají značnou roli u všech forem života. Kapitola 4: Koncept 6.1 Monosacharidy jsou aldehydy nebo ketony s hydroxylovými skupinami 6.2 Složené sacharidy jsou formovány spojením monosacharidů 6.3 Sacharidy mohou být vázány s proteiny jako tzv. glykoproteiny 6.4 Lektiny jsou specifické, cukry vázající proteiny Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 5 Charakter - funkce sacharidů 1. Sacharidy slouží jako zdroj energie a metabolických meziproduktů 2. Ribóza a deoxyribóza tvoří strukturu RNA a DNA 3. Polysacharidy jsou strukturní elementy v buněčných stěnách bakterií a rostlin. Celulóza představuje nejhojnější organickou sloučeninu v biosféře. 4. Cukry jsou spojeny s mnoha proteiny a lipidy, mají roli ve zprostředkování interakcí mezi buňkami – je to umožněno jejich obrovskou strukturální rozmanitostí Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 6 Monosacharidy Nejjednodušší sacharidy, aldehydy nebo ketony se dvěma nebo více hydroxylovými skupinami Empirický vzorec, (C-H2O)n, doslova “carbon hydrate” Nejmenší monosacharidy jsou triózy (n = 3) Glyceraldehyd má 1 asymetrický C, a tak 2 stereoisomery (D- & L-), jsou enantiomery, k sobě navzájem zrcadlové obrazy Keto skupina (ketosa)Aldehydická skupina (aldosa) Ch438_Lec_18: Carbohydrates. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://users.humboldt.edu/rpaselk/C438.S06/C438Notes/C438nLec18.htm Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 7 Dihydroxyaceton Keto skupina Žádný asymetrický uhlík Ch438_Lec_18: Carbohydrates. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://users.humboldt.edu/rpaselk/C438.S06/C438Notes/C438nLec18.htm Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 8 D-Glyceraldehyd Aldehydová skupina Asymetrický uhlík Ch438_Lec_18: Carbohydrates. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://users.humboldt.edu/rpaselk/C438.S06/C438Notes/C438nLec18.htm Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 9 L-Glyceraldehyd Ch438_Lec_18: Carbohydrates. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://users.humboldt.edu/rpaselk/C438.S06/C438Notes/C438nLec18.htm Aldehydová skupina Asymetrický uhlík Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 10 Fischerova projekce Horizontální vazby; před rovinou Vertikální vazby; za rovinou Stereochemické vztahy: Sacharidy. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://biomikro.vscht.cz/vyuka/bc/prednaska9.pdf Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 11 D-Aldosy (3,4,5, & 6 uhlíků) Manual. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://www.science.fau.edu/chemistry/mari/biochemlab/manual.html Aldehyd. skupina Vzdálené asymetr. centrum Počet Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 12 Triosy & tetrosy Aldehyd. skupina Vzdálené asymetr. centrum Počet Manual. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://www.science.fau.edu/chemistry/mari/biochemlab/manual.html Aldehyd. skupina Vzdálené asymetr. centrum Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 13 Tetrosy & Pentosy Manual. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://www.science.fau.edu/chemistry/mari/biochemlab/manual.html Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 14 Tetrosy & Pentosy Manual. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://www.science.fau.edu/chemistry/mari/biochemlab/manual.html Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 15 Pentosy & Hexosy Manual. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://www.science.fau.edu/chemistry/mari/biochemlab/manual.html Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 16 Pentosy & Hexosy Manual. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://www.science.fau.edu/chemistry/mari/biochemlab/manual.html Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 17 D-Ketosy (3,4,5, & 6 uhlíků) Počet keto skupina Vzdálené asymetrické centrum ketotriosy ketotetrosy ketopentosy ketohexosy Manual. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://www.science.fau.edu/chemistry/mari/biochemlab/manual.html Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 18 Triosy & tetrosy Manual. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://www.science.fau.edu/chemistry/mari/biochemlab/manual.html Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 19 Tetrosy & Pentosy Manual. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://www.science.fau.edu/chemistry/mari/biochemlab/manual.html Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 20 Pentosy & Hexosy Manual. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://www.science.fau.edu/chemistry/mari/biochemlab/manual.html Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 21 Cyklizace aldehydů (pentosy & hexosy) Aldehyd může reagovat s alkoholem, vytváří se hemiacetal Sacharidy. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://biomikro.vscht.cz/vyuka/bc/prednaska9.pdf Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 22 Cyklizace ketonů (pentosy & hexosy) Keton může reagovat s alkoholem, vytváří se hemiketal Sacharidy. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://biomikro.vscht.cz/vyuka/bc/prednaska9.pdf Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 23 5 & 6 členné kruhy Furanosa Pyranosa Sacharidy. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://biomikro.vscht.cz/vyuka/bc/prednaska9.pdf Převládajícími formami monosacharidů v roztoku jsou cyklické. Aldehydy tvoří poloacetalové, ketony poloketalové. Podle heterocyklů furanu – furanosy, pyranu – pyranosy. O O Furan Pyran Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 25 Proč právě glukosa je univerzálním zdrojem energie ??  1. Pravděpodobně první sacharid tvořený z formaldehydových jednotek za prebiotických podmínek.  2. Glukosa má nízkou tendenci neenzymově glykosylovat proteiny díky preferenci cyklické formy.  3. K relativně vysoké stabilitě glukosy přispívá to, že všechny hydroxylové skupiny v b-D-glukose jsou v ekvatoriální poloze. Formy D-glukosy. Uzavřením poloacetalového kruhu vzniká nové chirální centrum na uhlíku C1. Existují dva anomery D-glukosy – a a b. C C C C C CH2OH H OH OH H OH H HO OH H C C CC C O H H H OH OH H OH H HOH2C OH = D-Glukosa (otevřená forma) O OH H H H OH OH H OH H HOH2C a-D-Glukopyranosa O H H H H OH OH H OH OH HOH2C b-D-Glukopyranosa Cyklická forma D-fruktosy O CH2OH OH H OH OH H HOH2C H C C C C CH2OH O OH H H OH H CH2OH OH = C CH2OH C C C H H OH OH H O HOH2C OH D-Fruktosa (otevřená forma) b-D-Glukopyranosa (cyklická forma) b-D-Fruktofuranosa Cyklická forma sacharosy O CH2OH H H OH OH H HOH2C O H H H OH OH H OH H HOH2C O Sacharosa (a-D-Glukopyranosyl-(1 2)-b-D-fruktofuranosa) 1 2 a b Cyklická forma laktosy Obsahuje galaktosu a glukosu spojené (1→4) glykosidovou vazbou. Laktosa (b-D-Galaktopyranosyl-(1 4)-a-D-glukopyranosa) 1 4b a O H H OH H OH H OH HOH2C H O O OH H H H OH H OH H HOH2C Cyklická forma maltosy Obsahuje dvě molekuly glukosy spojené (1→4) glykosidovou vazbou. Maltosa (a-D-Glukopyranosyl-(1 4)-a-D-glukopyranosa) 1 4a a O O OH H H H OH H OH H HOH2C O H H H OH OH H OH HOH2C H Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 31 Redukující cukry Roztok měďnatých iontů, Cu2+ (Fehlingův roztok), test na redukující cukry jako třeba glukosa Volná aldehyd. skupina je oxidována Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 32 Glykosidická vazba Monosacharidy mohou reagovat s alkoholy & aminy D-glukosa + methanol (katalýza kyselinou), dva produkty, a & b Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 33 Modifikované monosacharidy Často produkované na povrh buňky Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 34 Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 35 Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 36 Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 37 Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 38 Spojení monosacharidů: Maltosa, disacharid 2 glukosové molekuly jsou spojeny a-1,4-glykosidickou vazbou Maltose molecule with chemical formula: Royalty Free Stock Image. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://www.dreamstime.com/royalty-free-stock-image-maltose-molecule-chemical-formula-image22818626 1 4 Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 39 Běžné disacharidy Běžné složky potravy Sacharidy. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://biomikro.vscht.cz/vyuka/bc/prednaska9.pdf Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 40 Sacharosa (stolní cukr ze třtiny nebo řepy) Hydrolýza sacharázou α-D-glukopyranosyl-(1→2)-β-D-fruktofuranosa Sacharidy. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://biomikro.vscht.cz/vyuka/bc/prednaska9.pdf Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 41 Laktosa (z mléka) Hydrolýza laktázou u lidí, b-galaktosidázou u bakterií Sacharidy. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://biomikro.vscht.cz/vyuka/bc/prednaska9.pdf β-D-galaktopyranosyl-(1→4)-α-D-glukopyranosa Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 42 Maltosa (ze škrobové hydrolýzy) Hydrolýza maltázou α-D-glukopyranosyl-(1 →4)-α-D-glukopyranosa Sacharidy. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://biomikro.vscht.cz/vyuka/bc/prednaska9.pdf Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 43 EM mikrovilů (v tenkém střevu) Sacharáza, laktáza, maltáza, přítomná na mikrovilech (průřez vnější stranou plasmatické membrány střevních epiteliálních buněk) Microvilli Dr. Jastrow´s EM: Atlas. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://www.uni- mainz.de/FB/Medizin/Anatomie/workshop/EM/EMMvilliE.html Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 44 Sacharidy. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://biomikro.vscht.cz/vyuka/bc/prednaska9.pdf Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 45 Sacharidy. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://biomikro.vscht.cz/vyuka/bc/prednaska9.pdf Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 46 Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 47 Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 48 Polysacharidy: Glykogen (větvení) Větvení přibližně každých 10 glukosových jednotek Glykogen je vysoce větvený Zásoby glukosy Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 49 Glykosidické vazby určují strukturu Rovný řětězec, dobrý pro stavbuOhnutý řětězec, dobrý pro uskladnění Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 50 Celulosa Hlavní strukturní polymer rostlin, Jedna z nejhojnějších organických sloučenin v biosféře Rovný řetězcový polymer glukosy, Vlákna tvořeny paralelními řetězci, spojeny vodíkovými vazbami Nedostatek celulázy u savců, nejsou schopny trávit dřevo, rostlinná vlákna Bakterie ji hydrolyzují v bachoru Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 51 Škrob & glykogen (homopolymery) Otevřený helix, dostupné zásoby cukru, Škrob u rostlin, glykogen u živočichů Glykogen, vysoce větvený, (každých 10 glukosových jednotek) Škrob, dvě formy Amylosa - nevětvená, Amylopektin - větvený (každých 30 glukózových jednotek) Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 52 Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 53 Glykosaminoglykany, aniontové polysacharidy Tvořené opakováním disacharidových jednotek, obsahujících derivát aminocukru, glukosaminu nebo galaktosaminu Nejméně 1 z cukrů má nabitou karboxylovou nebo sulfátovou skupinu Obvykle jsou spojeny k proteinům, vytváří proteoglykan (95% sach.) Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Proteoglykanové funkce Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 54 • Lubrikují mukózní membrány & pojivové tkáně • Strukturní komponenty pojivových tkání • Zprostředkovávají adhezi buněk k extracelární matrix • Váží faktory, co stimulují buněčnou proliferaci Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 55 Chondroitin 6-sulfát Nachází se v chrupavce Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 56 Keratan sulfát Nachází se ve vlasech, nehtech apod. Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 57 Heparin Antikoagulant používaný k prevenci krevního srážení Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 58 Dermatan sulfát Nachází se v kůži Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 59 Hyaluronát Nachází se v pojivových tkáních & slouží jako lubrikant Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 60 Syntéza oligosacharidů: Glykosyltransferasy Katalyzují tvorbu glykosidických vazeb, Pro cukr je každý enzym specifický Proto je potřeba mnoho enzymů Na rozdíl od biosyntézy nukleových kyselin nebo proteinů, není potřeba templát Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 61 Aktivovaný cukerný nukleotid Důležité meziprodukty v mnoha procesech Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 62 Tvorba glykosidické vazby Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 63 A, B, & O oligosacharidové antigeny (krevní skupiny) Založení oligos. (frameshift mutantní gen), 1 od každého rodiče Specifiké glykosyltransferasy přidávají skupiny na O antigen Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 64 Glykoproteiny (malé % sach.), glykosidické vazby N-vazba, Asn u ER & Golgi. O-vazba, Ser, Thr pouze u Golgi. Komponenty buněčných membrán, adhese, vazba spermie a vajíčka Také některé rozpustné proteiny Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 65 N-vázané oligos., manózový typ Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 66 N-vazba oligos., komplexní typ Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Glykosylace  Glykosylace proteinů probíhá v lumen endoplasmatického retikula (ER) a v Golgiho komplexu.  Příkladem je pankreatická elestasa [ 3. 4. 21. 36] katalyzující hydrolýzu proteinů (elastin) na místě Ala – Xaa.  Pankreatická elastasa– je uvolňována z pankreatu ve formě zymogenu. Je syntetizována ribosomy na cytoplasmatické straně membrány ER. Signální sekvence 29 aminokyselin navede proelastasu do lumen a poté se odštěpí. Volný zymogen je glykosylován a poté, k dokončení glykosylace, putuje do Gogiho komplexu.  Obecně: N-glykosylace začíná v ER a pokračuje v Golgiho komplexu.  O-Glykosylace probíhá pouze v Golgiho komplexu. Elastasa – vylučovaný glykoprotein s hydrolytickými vlastnostmi. Nachází se v krevním séru. Oligosacharidové řetězce zaujímají podstatnou část molekuly. Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 69 Elastasa, sekretovaný glykoprotein v séru Většina proteinů v krevním séru jsou glykoproteiny Wikipedia: Elastase. [online]. 26.7.2013 [cit. 2014-07-20]. Dostupné z: http://nl.wikipedia.org/wiki/Elastase Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 70 ER & Golgiho komplex Elektron. mikrofotografie Proteinová glykosylace následuje syntézu na ribosomech N-vazba v ER O-vazba v Golgi. Černé tečky v ER jsou ribosomy The Golgi Complex. [online]. [cit. 2014-07-20]. Dostupné z: http://www.cytochemistry.net/cell- biology/golgi.htm Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 71 Transport do ER Glykosylace začíná v lumen ER The Golgi (8.2b). [online]. [cit. 2014-07-20]. Dostupné z: http://urei.bio.uci.edu/~hudel/bs99a/lecture27/lecture8_2b.html Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 72 Opakující se jednotky dolichol fosfátu (v membráně ER) DP, specializovaný lipid v membráně ER - až 20 isoprenů Wikipedia Commons: File:Isoprene-Structure.png. [online]. 6.4.2012 [cit. 2014-07-20]. Dostupné z: http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Isoprene-Structure.png Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 73 Dolichol fosfát V membráně ER, fosfátová skupina na cytoplasmatické straně Lipidová molekula, na kterou jsou oligosacharidy shromážděny před proteinovou glykosylací Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecneLARKIN, Angelyn a Michelle M CHANG. Biochemical evidence for an alternate pathway in N-linked glycoprotein biosynthesis. [online]. [cit. 2014-07-20]. Dostupné z: http://www.nature.com/nchembio/journal/v9/n6/full/nchembio.1249.html 74 Shromáždění N-vázaných oligos. na dol-P 3 stádia: cytoplasmatické, převrácení, ER lumen Biochemie-6-1-sacharidy-obecne Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 75 Golgiho komplex, centrum třídění Transport proteinů do lysozomů, sekretorních váčků, plazmatické membrány. Golgi aparatus, Proteins, Transport: Learn Science at Scitable. [online]. [cit. 2014-07-20]. Dostupné z: http://www.nature.com/scitable/topicpage/how-do-proteins-move-through-the-golgi-14397318 Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 76 Manosa 6-fosfátový marker Modifikace zbytků manosy oligosach. jako marker pro lysozomy Děláno v cis Golgi. kompartmentu Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 77 Krok 1 Fosfo-N-acetylglukosamin Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 78 Krok 2 Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 79 Kvalita kontroly proteinového sbalení v ER Kalnexin, & (kalretikulin) Chaperonové proteiny Sacharidy nesou informaci 细胞生物学(英语): Chapter 7 Endomembrane system, Protein Sortingand membrane trafficking. [online]. [cit. 2014-07-20]. Dostupné z: http://cc.scu.edu.cn/G2S/Template/View.aspx?courseType=1&courseId =17&topMenuId=113302&menuType=1&action=view&type=&name= &linkpageID=113473 Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 80 Oligos. struktura – hmotnostní spektrometrie Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 81 Rostlinné lektiny, vazebná selektivita Tři rostlinné lektiny vážící rozdílné oligos., slouží jako insekticidy Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 82 Lektiny jsou velká skupina proteinů neimunitního původu, které dokáží s vysokou mírou specifity rozpoznávat a vázat cukry, ať už volné nebo vázané na glykoproteinech nebo glykolipidech. Na rozdíl od glykosyltransferáz lektiny nekatalyzují žádnou chemickou reakci, tedy nevykazují enzymatickou aktivitu. Lektiny se účastní mnoha dějů, ve kterých je nutné specifické rozpoznávání (imunologické reakce, kontakt buněk ve tkáních, interakce patogenů s hostitelem atd.). První objevené lektiny byly pro jejich schopnost aglutinovat (shlukovat, srážet) červené krvinky pojmenovány aglutininy (WGA – wheat germ agglutinin, RCA – Ricinus communis agglutinin). Funkce •třídění proteinů v Golgiho aparátu: enzymy patřící do lysozomu jsou glykosylovány manózou-6-fosfátem a pomocí P-lektinů zachytávány a zakoncentrovávány v určité části Golgiho aparátu, která po odštěpení dá vzniknout lysozomu • kalnexin – chaperon, který je schopen rozpoznat špatně sbalené N-glykoproteiny v endoplasmatickém retikulu a zadržet je tam. Jsou buď znovu sbaleny nebo degradovány • E-selektin – je exprimován endoteliálními buňkami v oblasti zánětu. Rozpoznávají určité sialované sacharidy na povrchu některých leukocytů a zpomalují jejich pohyb kapilárou (tzv. rolling – kutálení) leukocyty tak mají čas protáhnout se z kapiláry ven a vcestovat do místa zánětu • bakterie Helicobacter pylori je spojována s mnoha žaludečními chorobami (např. žaludeční vředy). Adhezi (přichycení) na žaludeční epitel ji umožňují lektiny, které rozpoznávají sialové kyseliny a L-fukózu • bakterie Pseudomonas aeruginosa (rezistentní proti řadě antibiotik), nebezpečná pro pacienty trpící cystickou fibrózou, využívá specifické interakce lektinů PA-IIL a PA-IL s povrchovými sacharidy plicního epitelu při kolonizaci plic Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 83 Živočišné lektiny, C-typ uhlík-vazebná doména Živočišné buněčné lektiny umožňují buňka-buňka kontakt Lektinová vazebná místa na povrchu jedné buňky interagují s uhlíky vystavenými na povrchu jiné buňky (jako suchý zip) V živočišných buňkách jsou C-typ lektiny, Ca2+ ionty představují most mezi proteinem a cukerným zbytkem oligos. Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 84 Chřipkový hemaglutinin Váže se zbytky kyseliny sialové na buněčný povrch, Uvnitř buňky, virový protein, neuraminidasa, štěpí glykosidickou vazbu; Slibný cíl pro protichřipková činidla Je glykoprotein na povrchu viru chřipky. Je zodpovědný za vazbu viru sialovou kyselinou na membrány, jako jsou buňky v horním respiračním traktu a erytrocyty. Je také odpovědný za fůzi virové obalové membrány s endosomovou membránou při snížení pH. Název "hemaglutinin“ vychází ze schopnosti proteinů způsobovat shlukování erytrocytů ("aglutinace") in vitro. Bat-Derived Influenza Hemagglutinin H17 Does Not Bind Canonical Avian or Human Receptors and Most Likely Uses a Unique Entry Mechanism: Cell Reports. [online]. [cit. 2014-07-20]. Dostupné z: http://www.cell.com/cell-reports/abstract/S2211- 1247%2813%2900032-6 Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 85 Selektiny, C-typ lektinů Lymfocyty vázající se do výstelky mízních uzlin Vazba buněk imun. systému, L- na lymfatické uzliny cév, E- na endotel, P- na trombocyty SECONDARY LYMPHOID ORGANS. [online]. [cit. 2014-07-20]. Dostupné z: http://artnscience.us/peripheral-lt.html Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 86 STRUKTURA MONOSACHARIDŮ Monosacharidy Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 87 Wikipedie: Mutarotace. [online]. 4.4.2013 [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://cs.wikipedia.org/wiki/Mutarotace Wikipedie: Galaktóza. [online]. 10.2.2014 [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://cs.wikipedia.org/wiki/Galakt%C3%B3za α-D-galaktosa (galaktopyranosa) Wikipedia: Manosa. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://gl.wikipedia.org/wiki/Manosa α-D-manosa (manopyranosa) Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 88 Sacharidy. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://biomikro.vscht.cz/vyuka/bc/prednaska9.pdf Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 89 Tvorba pyranos Fischerova projekce Haworthova projekce All about sugars (Carbohydrates). [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://www.natuurlijkerwijs.com/english/sugars.htm D & L enantiomery na C5 Intramolekulární hemiacetal, 2 anomery, a & b na C1 Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 90 Tvorba furanos(z hexos) Fischerova projekce D & L enantiomery na C5 Intramolekulární hemiketal, 2 anomery, a & b na C2 Haworthova projekce All about sugars (Carbohydrates). [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://www.natuurlijkerwijs.com/english/sugars.htm Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 91 Tvorba furanos(z pentos) D & L enantiomery na C4 C-1 je anomerní uhlík, a-anomer, OH pod rovinou kruhu b-anomer, OH nad rovinou Nucleic Acids. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://chemistry2.csudh.edu/rpendarvis/NuclAcids.html Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 92 Fruktosa – cyklické struktury C5 se váže na C2 C6 se váže na C2 Fruchtzucker. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://www.onlineenzyklopaedie.de/f/fr/fruchtzucker.html Wikipedia: Fruktos. [online]. 13.9.2013 [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://sv.wikipedia.org/wiki/Fruktos α-D-fruktopyranosa Wikipedia commons: File:Beta-D-Fructopyranose.svg. [online]. 23.5.2014 [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Beta-D-Fructopyranose.svg β-D-fruktopyranosa Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 93 C5, D C2,a a-D-Fruktofuranosa OChemPal: Anomers. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://science.uvu.edu/ochem/index.php/alphabetical/a-b/anomers/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 94 b-D-Fruktofuranosa C2, b OChemPal: Anomers. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://science.uvu.edu/ochem/index.php/alphabetical/a-b/anomers/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 95 a-D-Fruktopyranosa C5, D C2, a Wikipedia: Fruktos. [online]. 13.9.2013 [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://sv.wikipedia.org/wiki/Fruktos Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 96 b-D-Fruktopyranosa C5, D C2, b-anomer Wikipedia commons: File:Beta-D-Fructopyranose.svg. [online]. 23.5.2014 [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Beta-D-Fructopyranose.svg Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 97 Pyranosový kruh není v rovině Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 98 Židličková & vaničková konformace Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Biochemie-6-1-sacharidy-obecne 99 Konformace obálky b-D-ribosy Biochem lecture 11 flashcards: Quizlet. [online]. [cit. 2014-07-19]. Dostupné z: http://quizlet.com/35638193/biochem-lecture-11-flash-cards/ Furanosový kruh není v rovině