MASARYKOVA UNIVERZITA ˇ PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA
ODDĚLENÍ FUNKČNÍ GENOMIKY A PROTEOMIKY
KURZ ZÁKLADŮ PROTEOMIKY Bi8202c, jaro 2006
PROTOKOL: I. ANALÝZA PROTEOMU
Jméno
obor, ročník
e-mail
datum
_________________________________________________________________________________________
A VÝSLEDKY DVOUROZMĚRNÉ ELEKTROFORÉZY:
ˇ Přiložit obrázek gelu, popsat
ˇ Vyznačit proteiny, které byly vyřezány, enzymaticky štěpeny a analyzovány MS
ˇ Metoda identifikace proteinů: ....................
ˇ Výsledek identifikace proteinů, porovnat teoretické parametry proteinu (Mr, pI)
získané z databáze s polohou proteinu na gelu:
Experiment. hodnoty Teoretické hodnoty Identifikace proteinuČíslo
spotu
Mr (kDa) pI Mr (kDa) pI Název proteinu Score
1
2
2
4
5
6
Závěr:
B VÝSLEDKY LC-MS/MS analýzy
Digesce in-solution
ˇ Vypočtěte objem roztoku trypsinu, který je nutno smíchat s 1 l směsi proteinů,
abyste dosáhli předepsaného poměru enzym : substrát.
směs neznámých proteinů o celkové koncentraci proteinu .......mg/ml
trypsin (v 25 mmol/l uhličitanu amonného) ...............................5 g/ml
poměr enzym: substrát ..........................................................1 :
Digest: .........l trypsinu
l směsi proteinů
ˇ Metoda identifikace proteinů: ..........................
ˇ Výsledek identifikace směsi proteinů:
Identifikace proteinu
Název proteinu Score
1
2
2
4
5
6
Závěr:
PROTOKOL: II. TECHNOLOGIE REKOMBINANTNÍCH PROTEINŮ
Jméno
Obor, ročník
e-mail
datum
číslo skupiny, protein
A, VÝSLEDKY SEKVENAČNÍ ANALÝZY DNA
B, VÝSLEDKY EXPRESE A PURIFIKACE REKOMBINANTNÍCH
PROTEINŮ
C, STRUKTURNÍ A FUNKČNÍ ANALÝZA