Toxiny sinic (cyanotoxiny) jsou látky sekundárního metabolismu, tedy látky, které nejsou využívány organismem pro jeho primární metabolismus. Srovnáváme-li je s ostatními přírodními toxiny, jsou toxičtější než toxiny vyšších rostlin a hub, avšak jsou méně toxické než bakteriální toxiny (toto srovnání ukazuje tabulka).

• neurotoxiny,
• paralytické toxiny,
• hepatotoxiny,
• Tumor Promoting Factors (tyto stimulují 2. a 3. fázi kancerogeneze),
• cytotoxiny,
• prymneotoxiny,
• embryotoxiny,
• dermatotoxiny,
• genotoxiny a mutageny,
• imunotoxiny a imunomodulátory,
• řasy a sinice jako alergeny.

Jednotlivé toxiny mají často smíšenou biologickou aktivitu. Například hepatotoxický microcystin-LR patří mezi aktivní "tumor promoting factors", způsobuje chromozomové aberace a snižuje imunitní odezvy. Populace jednoho druhu může také produkovat souběžně několik druhů toxinů. Srovnáváme-li je s ostatními přírodními toxiny, jsou toxičtější než toxiny rostlin a hub a jsou méně toxické, než bakteriální toxiny (viz výše uvedená tabulka). Jiné dělení cyanotoxinů vychází z chemické struktury toxinů a někteří autoři dělí cyanotoxiny dle typů molekul na cyklické a lineární peptidy, alkaloidy a lipopolysacharidy.