ŠLECHTĚNÍ Cílevědomý výběr zvířat vedoucí ke genetické fixaci vlastností, které jsou součástí chovatelského cíle ŠLECHTĚNÍ ýZákon č. 154/2000 Sb ýNavazující vyhlášky CHOVATELSKÝ CÍL ýVlastnosti zdraví ýVlastnosti užitkové ZDRAVÍ ŠLECHTĚNÍ ýSelekce ýPlemenitba ŠLECHTĚNÍ ýSelekce ýPlemenitba Selekce ýpřírodní/umělá ýnegativní/pozitivní ýna jeden znak/na více znaků ýfenotypová/genotypová Selekce ýpřírodní/umělá ýnegativní/pozitivní ýna jeden znak/na více znaků ýfenotypová/genotypová Selekce ýpřírodní/umělá ýnegativní/pozitivní ýna jeden znak/na více znaků ýfenotypová/genotypová Selekce ýpřírodní/umělá ýnegativní/pozitivní ýna jeden znak/na více znaků ýfenotypová/genotypová Selekce na jeden znak ýDirekcionální ýStabilizační ýDisruptivní Selekce na více znaků ýTandemová ýNezávislé vyřazování ýSimultánní – selekční indexy Selekce ýpřírodní/umělá ýnegativní/pozitivní ýna jeden znak/na více znaků ýfenotypová/genotypová GENOTYPOVÁ SELEKCE Zdrojem genotypové selekce je DĚDIČNOST KVANTITATIVNÍHO ZNAKU Rozklad fenotypové variance: V[P] = V[G] + V[E ]V[G] = V[A] + V[D] + V[I ]V[E] = V[Ep] + V[Et ] DĚDIČNOST KVANTITATIVNÍHO ZNAKU Genetická variabilita V[G] = V[A] + V[D] + V[I ] DĚDIČNOST KVANTITATIVNÍHO ZNAKU Koeficient heritability: h^2 V[G]/V[P] DĚDIČNOST KVANTITATIVNÍHO ZNAKU Koeficient heritability: h^2 V[A]/V[P] Genotypová selekce Nutnost odhadu plemenné hodnoty ODHAD PLEMENNÉ HODNOTY ýPodle příbuzenstva ýPodle markerů ýPodle příbuzenstva ýPodle markerů PH podle příbuzenstva ýVlastní užitkovost ýPředkové a kolaterální příbuzní ýPotomci PH podle potomků ýMetoda vrstevnic ýSkupiny potomstva ODHAD PLEMENNÉ HODNOTY ýPodle potomků ýPodle markerů Identifikace genů - markerů pro zdraví a užitkovost ýObdobí redukcionismu ýObdobí holistické GENOMIKA A PROTEOMIKA Systematická a komplexní analýza genomu a proteomu Systematická a komplexní analýza genomu a proteomu METODY ANALÝZY GENOMU DOMÁCÍCH ZVÍŘAT ýIdentifikace a mapování genů ýFunkce genů Strukturální genomika domácích zvířat: genetické mapování ANALÝZA GENOMU ýAnalýza jednotlivých genů ýGenomový scan ANALÝZA GENOMU ýAnalýza jednotlivých genů ýGenomový scan Geny ovlivňující užitkovost ýZnaky exteriéru (barva) ýZnaky produkční (plodnost, maso, mléko, vejce) STRUKTURÁLNÍ GENOMIKA: METODY GENOVÉHO MAPOVÁNÍ ZVÍŘAT ýMapy genetické ýMapy cytologické ýMapy integrované Strukturální genomika ýGenetické mapování ýFyzické mapování STRUKTURÁLNÍ GENOMIKA: METODY GENOVÉHO MAPOVÁNÍ ZVÍŘAT Mapy genetické: ýVazebná analýza ýSingle sperm typing STRUKTURÁLNÍ GENOMIKA: METODY GENOVÉHO MAPOVÁNÍ ZVÍŘAT Mapy cytologické: ý FISH ý RH panel ý Mikrodisekce ý BACs, YACs ANALÝZA GENOMU ýAnalýza jednotlivých genů ýGenomový scan MARKERY A KANDIDÁTNÍ GENY ýNeexprimované (mikrosatelity) ýExprimované VÝSLEDKY: užitkové znaky Genové mapy zvířat http://locus.jouy.inra.fr http://www.ri-bbsrc.ac.uk http://www.genome.iastate.edu http://www.sol.marc.usda.gov Geny ovlivňující užitkovost - příklady QTLs ý prase: chr. 4, 6, 7, ý skot: chr. 6, 14, 20 QTLs and CGs for meat production in pigs QTLs identified for: • growth chrom.: 3, 4, 7, 8, 9, 12, 13, 14, 15, 16, X • meat quality chrom.: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 17, 18, • fat chrom.: 1, 5, 6, 7, 13, 14, 18, X Candidate genes for meat production: QTLs and candidate genes for reproduction traits in pigs Effect of CRC genotypes BIOINFORMATIKA Analýza dat získaných genomickými přístupy: Putative horse NRAMP1 protein analysis Analýza užitkových znaků STRATEGIE GENOVÉHO MAPOVÁNÍ ZVÍŘAT MAS Zpřesnění odhadu plemenné hodnoty GENOMIKA V MEDICÍNĚ Výsledky: analýza kandidátních genů přirozené imunity Asociační analýza: Lawsonia intracellularis mtDNA D-loop variations in zebras Potenciál bioinformatiky KOMPARATIVNÍ GENOMIKA ýVyužití mezidruhových homologií ýEvoluční aspekty KOMPARATIVNÍ GENOMIKA METODY ANALÝZY GENOMU ýIdentifikace a mapování genů ýFunkce genů Využití výsledků ý Negativní selekce ý Pozitivní selekce (MAS) ý AI, ET, klonování, transgenoze ý Produkce léčiv a vakcín ý Rekombinantní technologie ŠLECHTĚNÍ ýSelekce ýPlemenitba ŠLECHTĚNÍ ýŠlechtitelské programy ýHybridizační programy