PhD-studium problematiky regulace buněčného cyklu
Studium fyziologické úlohy DNA damage signálních drah v savčích oocytech.
ŠkolitekProf. MVDr. Jan Motlík, DrSc (e-mail: motlik@iapg.cas.cz) Ústav živočišné fyziologie a genetiky, AV ČR Rumburská 89, 277 21 Liběchov u Prahy tel.: 315 639 560
U proliferujících somatických buněk dochází po detekci poškození DNA (např. UV, IR zářením) k aktivaci tzv. DNA damage odpovědi, která zahrnuje několik signálních drah. Mezi molekuly které se účastní této odpovědi patří např. ATM, ATR, Chkl/2, CDC25A, CDC6. Mnohé z těchto molekul jsou též exprimovány v savčích oocytech, ale jejich funkce v oocytech není neznámá. Aktivace Chkl a následná degradace CDC25A během meiotické maturace oocytů jasně ukazují, že se tyto dráhy mohou aktivovat v samicích zárodečných buňkách i za fyziologické situace, což kontrastuje s údaji získanými na somatických buňkách, kde např. k silné aktivaci Chkl dochází v důsledku poškození DNA. Výše popsané údaje naznačují, že molekuly, zahrnuté u somatických buněk v DNA damage odpovědi, plní v oocytech ještě další, do této doby neznámé fyziologické funkce.
Cílem PhD-projektu by mělo být jasně charakterizovat expresi a aktivaci vybraných molekul DNA damage odpovědi a následně objasnit jejich funkci v průběhu meiózy jak v podmínkách in vitro, tak in vivo po indukci zrání gonadotropíny. Získané znalosti budou důležité nejen pro detailnější pochopení molekulárních mechanismů meiózy, ale také mohou poskytnout obecně užitečné informace o funkci těchto signálních drah, které hrají klíčovou roli v ochraně integrity genomu, a tudíž přestavují ochranu před nádorovou transformací. Studium výše zmíněné problematiky bude obsahovat především použití metod jako jsou realtime qPCR, imunoflurescence, in vitro příprava mRNA a jejich následná mikroinjekce do oocytů, RNA interference za použití long dsRNA a použití transgenních modelů založených naZP3-Cre systému (oocytárně specifický knock-out).
Tento projekt by byl součástí vědeckého zaměření Laboratoře biochemie a molekulární genetiky zárodečných buněk. Byl by tedy realizován jako týmová práce, aby předpokládané výsledky a následné publikace byly získány v optimálním čase. Tento projekt bude také připraven jako grantová aplikace jak ke GAČR, tak ke GA AVČR.
Případní zájemci se mohou přihlásit na výše uvedeném kontaktu.