Regulace genové exprese u prokaryot a jejich virů Osnova přednášky: • konstitutivní, inducibilní a represibilní genová exprese • pozitivní a negativní regulace genové exprese • operóny: koordinovaně regulované jednotky genové exprese • laktózový operón u E. coli • tryptofanový operon u E. coli Regulační mechanismy u prokaryot • mechanismy, kterými dochází k rychlému zapnutí nebo vypnutí genové exprese v reakci na změny okolí – poskytují metabolismu plasticitu: dosažení maximálního růstu a reprodukce za nejrůznějších podmínek • předprogramované okruhy nebo kaskády genové exprese – podnět ovlivní expresi určitého genu, jehož produkt ovlivní expresi sady dalších genů, jejich produkty zase další, atd. cyklický AMP Organizace lac operónu v oblasti promotor-operátor CAP pozitivně reguluje lac operón, cAMP je efektorem • Za přítomnosti glukózy – adenylátcykláza je inaktivní – hladina cAMP je nízká – CAP se nemůže vázat na lac operón – strukturní geny lac operónu se neexprimují Take home message • lac operón E. coli je regulační systém obsahující tři strukturní geny, které se účinně transkribují pouze za přítomnosti laktózy a nepřítomnosti glukózy • za nepřítomnosti laktózy se lac represor váže na lac operátor a brání RNA polymeráze v iniciaci transkripce operónu • katabolická represe brání indukci operónů typu lac glukózou, tj. přednostním zdrojem energie Genová exprese u eukaryot Regulace transkripce • pre regulaci transkripce u eukaryot jsou důležité nitrobuněčné signály i mezibuněčné komunikace • pozitivní a negativní regulátorové proteiny zvané transkripční faktory se vážou do specifických oblastí DNA, aby zde stimulovaly nebo inhibovaly transkripci Alternativní sestřih RNA • umožňuje tvorbu několika polypeptidů z genetické informace jediného genu Alternativní sestřih transkriptu krysího genu pro Troponin T Cytoplazmatická kontrola stability mRNA • stabilitu mRNA ovlivňuje několik faktorů – koncový úsek poly(A) – sekvence 3’ UTR – chemické faktory (např. hormony) – malé RNA (siRNA) nebo microRNA (miRNA) Take home message • transkripční faktory jsou schopné vazby na DNA a ovlivňují transkripci eukaryotických genů • transkripty eukaryotických genů mohou podléhat alternativnímu sestřihu za vzniku mRNA kódující příbuzné, ale nestejné polypeptidy • účinnost proteosyntézy závisí na stabilitě eukaryotických mRNA