1.      Evoluce a evoluční biologie
co je a co není evoluce; vymezení disciplíny; historie evolučního myšlení; alternativní teorie,
Moderní syntéza; lze evoluci dokázat?

2.      Genetická a fenotypová proměnlivost
populace; Hardyho-Weinbergův princip; genetická proměnlivost v populacích; polymorfismus a
polytypie; proměnlivost na více lokusech

3.      Vznik genetické proměnlivosti
mikroevoluce a makroevoluce; mikroevoluční mechanismy; mutace; problém náhodnosti a adaptivnosti
mutací; rekombinace a její důsledky; tok genů a jeho důsledky; inbreeding a jeho důsledky;
asortativní páření

4.      Přírodní výběr (selekce)
reprodukční zdatnost; selekční koeficient; studium selekce; vztah fenotypu a fitness; vztah selekce
a mutace; vztah selekce a migrace; balancující selekce (superdominance, selekce v proměnlivém
prostředí, antagonistická a frekvenčně-závislá selekce), alternativní rovnováhy

5.      Náhodný genetický posun (drift)
náhodný výběr a jeho chyba; drift a jeho důsledky; efektivní velikost populace; koalescence; efekt
hrdla láhve a efekt zakladatele; vztah driftu a migrace; vztah driftu a selekce – teorie posunující
se rovnováhy

6.      Molekulární evoluce
substituční zátěž a selekční náklady; neutrální teorie; mírně škodlivé mutace; molekulární hodiny a
jejich význam; spřažená evoluce a molekulární tah

7.      Adaptace a přírodní výběr
co jsou adaptace?; koadaptace a preadaptace; jsou adaptace dokonalé? metody studia adaptací; je
každý znak adaptivní?

8.      Konflikt a kooperace I.
skupinová a příbuzenská selekce; intragenomový konflikt („sobecký gen“ a ultrasobecká DNA,
meiotický tah, SD geny a t haplotyp, transpozony); „rozšířený fenotyp“; jednotka a cíl selekce

9.      Konflikt a kooperace II.
teorie her a evolučně stabilní strategie; model holubice a jestřába; asymetrické strategie;
reciproční altruismus; vězňovo dilema; tit-for-tat; hry s nulovým a nenulovým součtem; pohlavní
výběr a jeho podstata u samců a samic; intrasexuální a intersexuální selekce; mimopárové kopulace

10.  Vznik života na Zemi
hypotézy vzniku života; RNA jako enzym; „prebiotická pizza“; vznik biomembrán a kompartmentace;
vznik chromozomů; vznik eukaryot; strom života; klíčové evoluční momenty; vznik genů a genomů;
vznik pohlavního rozmnožování a jeho důsledky; evoluce poměru pohlaví

11.  Druh a speciace
definice druhu; biologický koncept druhu (BSC); reprodukční bariéry; Haldaneovo pravidlo; problémy
BSC a alternativní pojetí; alopatrická, parapatrická a sympatrická speciace, teorie zesíleníů
primární a sekundární hybridní zóny; tenzní zóna; paralelní speciace

12.  Makroevoluce
rychlosti evoluce; gradualismus a teorie přerušovaných rovnováh; heterochronie; Hox geny a
evo-devo; ekologická dimenze evoluce (life-history parametry, růst populace, koevoluce)

13.  Historie života na Zemi
historie od počátku po recent; kontinentální drift; masové extinkce; evoluce biodiversity

14.  Evoluce člověka a kulturní evoluce