Možné výsledky fylogeografických studií
                                           (Avise 2000)

Kategorie I:

•         zřetelně odděleníé alopatrické linie

•         bariéry toku genů nebo nízká disperze

•         rozdíly díky sortování linií nebo akumulaci
nových mutací



Kategorie II:

•         sympatrické, ale jasně hluboce oddělené linie Þ

•         sekundární kontakt dříve oddělených populací



Kategorie III:

•         alopatrické, málo oddělené linie

•         blízce příbuzné ale geograficky lokalizované haplotypy

•         populace v nedávném historickém kontaktu

•         ale: tok genů dostatečně nízký
→ drift a „lineage sorting“ → divergence populací

•         často:

–      na větší škále Kategorie I

–      na menší škále Kategorie III









Kategorie IV:

•         sympatrické, málo oddělené linie

•         silný tok genů

•         absence geografických bariér nebo

•         recentní expanze



Kategorie V:

•         kombinace III a IV

•         málo oddělené linie

•         některé linie značně rozšířeny (zřejmě ancestrální), jiné (nové) geograficky omezeny

•         jako vhodné znaky je nutné vybrat privátní haplotypy



                                  Genetické důsledky ledových dob

•         Refugia
(Iberské, Italské, Balkánské)



•         V refugiích malé populace relativně dlouhou dobu



•         Linneage sorting
(případně mutace)



•         Následné šíření → vnitrodruhové hybridní zóny



•         Ale některé druhy měly
i severská refugia!

Genealogické koncordance
Ryby JV USA

Genealogické
koncordance
(shody na různých úrovních)

•         Různé části sekvence genu



•         Více sekvencí (genů)
od stejného druhu



•         Více druhů ve stejné oblasti



•         Podpora biogeografických oblastí
(více druhů, více oblastí)

















?       Malá (15-20 kb), kruhová molekula



?       Bez intronů



?       Minimum nekódujících oblastí



?       Dědí se jen po jednom rodiči
(matce)



?       Nerekombinuje



?       V buňce jen jeden typ v mnoha kopiích



?       Neutralita
(různé varianty v populaci mají stejnou fitness)

                                 Problémy pro populační genetiku:

•         Neutralita



•         Mezidruhový přenos



•         Nukleární pseudogeny



•         Biparentální dědičnost



•         Rekombinace









Zbývá zodpovědět:

•         Frekvence biparentální dědičnosti



•         Frekvence rekombinací



•         Jen somatické tkáně?



•         Dědičnost rekombinantních molekul



•         Rekombinace s nukleárními pseudogeny?



•         Mechanismus biparentální dědičnosti a rekombinace



•         Výjimečné události u živočichů?