BIOINFORMATIKA V PRAXI – CVIČENÍ 7


                                   PREDIKCE VLASTNOSTÍ PROTEINŮ

                       ZÁKLADNÍ FYZIKÁLNĚ-CHEMICKÁ CHARAKTERISTIKA PROTEINŮ



STUDIJNÍ MATERIÁLY

The ExPASy (Expert Protein Analysis System) proteomics server of the Swiss Institute of
Bioinformatics (SIB), http://www.expasy.org/.


ÚKOL 1

Pomocí programu ProtParam určete základní fyzikálně-chemické parametry následujícího proteinu:


..................................


ÚKOL 2

Porovnejte extinkční koeficient u následujících proteinů:


Protein 1

..................................


Protein 2

..................................


ÚKOL 3

Porovnejte in vivo „životnost“ následujících proteinů:


Protein 1

..................................


Protein 2

..................................



ÚKOL 4

Porovnejte stabilitu následujících proteinů:


Protein 1

..................................


Protein 2

..................................



ÚKOL 5:

Porovnejte „aliphatic index“ a parametr „GRAVY“ u následujících proteinů:


Protein 1

..................................


Protein 2
..................................

SAMOSTATNÝ PROJEKT
Pomocí programu ProtParam určete u vašeho proteinu základní fyzikálně-chemické parametry.