Speciální metody analýzy
mikroorganizmů I
doc. RNDr. Milan Bartoš, Ph.D.
Přírodovědecká fakulta MU, 2013
bartosm@vfu.cz
Obsah přednášky
1) Základní postupy při analýze mikroorganismů
2) Izolace a základní analýza nukleových kyselin.
Spektrofotometrická analýza nukleových kyselin, fluorometrie
3) Fragmentace molekul DNA, restrikční enzymy
4) Analýza nukleových kyselin pomocí elektromigračních metod
5) Využití chromatografických metod při analýze nukleových
kyselin
6) Sekvenční analýza
7) Hybridizace
8) Polymerázová řetězová reakce (PCR)
9) Aplikace PCR v mikrobiologii
10) Metody analýzy proteinů. Chromatografické stanovení
mikrobiálních metabolitů a složek bakteriálních stěn
11) Využití internetových zdrojů při studiu mikroorganismů
12) Příklady a úlohy
Doporučená literatura
1) Persing et al. (1993): Diagnostic Molecular
Microbiology, ASM Press, Washington, D.C.
2) Persing (2011): Molecular Microbiology second
edition, ASM Press , Washington, D.C.
3) Šmarda et al. (2005): Metody molekulární
biologie, MU Brno
4) Rolfs et al. (1992): PCR: Clinical Diagnostics
and Research, Sringer-Verlag Berlin
5) www.farmakogenomika.cz
Kde najdete studijní materiály?
Jako vždy na IS Masarykovy univerzity!
Podmínky ke zkoušce
Zápočet ze cvičení
Písemný test, zisk alespoň 60% bodů
Ústní rozprava
Ptejte se mne na přednáškách,
u zkoušky se budu ptát já !
Obsah praktických cvičení
1) Charakteristika bakterií z izolovaných
kolonií metodou PCR a sekvenováním
(3 cvičení)
2) Izolace bakteriální DNA z tekuté kultury,
charakteristika izolátu (1 cvičení)
3) Detekce bakteriální DNA metodami PCR
a real-time PCR v biologickém materiálu
(2 cvičení)
4) Izolace DNA z kvasinek, identifikace
metodou PCR-REA (2 cvičení)
Podmínky zápočtu ze cvičení
Absolvovat všechna cvičení
Vypracovat protokoly k jednotlivým úlohám
Literatura ke cvičením
1) Obdržíte speciální materiály
2) Biotechnologie a farmakogenetika pro
farmaceuty – Bartoš a kol., 2009
A sledujte novinky !
www.osel.cz
http://www.plospathogens.org/home.action
http://www.the-scientist.com/