Preimplantační genetická diagnostika Oddělení lékařské genetiky FN Brno Gynekologicko - porodnická klinika Masarykovy univerzity v Brně PGD • alternativa k prenatální diagnostice • alternativní prevence potratů indikovaných po amniocentéze • preventivní a cílená diagnostika dané geneticky dědičné nemoci • selekce embryí pro IVF u párů s rizikem transmitující genetické choroby Co předchází provedení PGD ? • Genetické poradenství před cyklem IVF - konzultace s párem včetně genetického vyšetření • Poradenství s gynekologem a embryologem • Informovaný souhlas pacientky Genetická analýza • oocyt/zygota (polární tělísko) • blastomera (embryo) • blastocysta Biopsie polárního tělíska (PB biopsie) • původně preferováno z etických důvodů (manipulace s oocyty , genetický materiál použitý k analýze není částí vyvíjejíciho se embrya) • komplikace: možnost rekombinace genotyp paternální alely zůstává neznámý • možnosti PB analýzy : detekce numerických chromozomálních abnormalit maternálního původu – “age related” aneuploidie – žena nositelka translokace • většina center PGD toto vyšetření nepreferuje Biopsie blastocyst • blastocysta: – opouzdřená struktura obsahující přibližně 100 buněk – vyvíjí se 5-6 den po inseminaci – trofoektodermální buňky - odvozeny z placenty a jiných extra-embryonálních tkání – odběr 10 buněk nepostihuje časný vývoj embryí, ale neví se jaký efekt ná na pozdější vývoj fetu – pouze asi 40-50% preimplantovaných embryí se vyvine do tohoto stádia in vitro • výhoda: – menší technická náročnost biopsie – možnost více buněk k analýze Biopsie blastomer • 3.den fertilizované embryo: 6-8 totipotentních buněk • hlavní nevýhoda: – limitované množství materiálu, doporučována biopsie a analýza dvou blastomer z každého embrya • většina center PGD preferuje biopsii blastomer Princip biopsie blastomer • Odběr blastomery z rýhujícího se embrya • Testování blastomery metodami molekulární biologie • Eliminace embryí se specifikovanou genetickou vadou Technika provedení biopsie blastomer • Fertilizace metodou ICSI • Biopsie po 72 hod. kultivace • Narušení zona pellucida • Odběr blastomer v EB mediu • Fixace blastomery na podložní sklo • Kultivace embryí po biopsii (48 hod.) • Oplach a transport blastomer v dest. vodě pro PCR vyšetření Diagnostika PGD • chromozomální abnormality: – aneuploidie chromozomů X,Y, 13, 18, 21 – určení pohlaví – FISH metoda • nevýhoda: častý výskyt chromosomálního mozaicismu • monogenní choroby – pro jakoukoli genetickou chorobu u které je dostatečná sekvenční informace – PCR • fenomén: allelic drop out (ADO) PGD chromozomálních abnormalit • chromozomy v interfázním jádře buňky • první PGD : FISH na X-vázané choroby (stanovení pohlaví) • většina chromozomálních abnormalit je maternálního původu - častá aplikace biopsie pólového tělíska (PB) • limitace: – starší ženy nebo ženy s opakovaným IVF: limitovaný počet kvalitních embryí/oocytů (aneuplodie!) – maximální počet chromozomů analyzovaných z jedné buňky je 7 - 9 – chybné stanovení aneuploidie dosahuje až 15%, nejčastější příčinou chyb: • „background“ fluorescence, slabý signál, ztráta jádra při aplikaci blastomery na podložní sklíčko • nyní zavádění CGH v PGD PGD monogenních chorob • genotypování jedné buňky založeno na metodě PCR – komplikace : • možná kontaminace vzorku – cumulus buňky, obklopující oocyt/maternální původ kontaminace – spermie, zapuštěná do zony pelucidy pro fertilizaci/paternální kontaminace • ADO (alelic drop out) - amplifikace jedné alely pod úrovní detekovatelnosti – optimalizace PCR (výskyt ADO <10%) – příčina ADO: obecně neznámá, avšak je ovlivněna : » metodou buněčné lyse před PCR » PCR podmínkami » sekvencí cílové DNA » velikostí PCR produktu Minimalizace ADO • protokol monitorující výskyt ADO: – multiplex PCR (dva a více lokusů vztažených ke genotypu) – SSCP nebo DGGE analýzy ( detekující obě alely současně, potvrdí genotyp) – fluorescenční PCR - redukuje výskyt ADO, detekce DNA fragmentu je až 1000x citlivější ve srovnání s konvenční PCR technikou Nevýhody PGD • Limitovaný počet buněk dostupných genetické analýze • Možné riziko narušení vývoje vyšetřovaného embrya • Není vyloučená jiná genetická vada • Doplnění PGD amniocentézou PGD u Cystické fibrózy • CF představuje nejčastější žádost o PGD – incidence 1/4000 novorozenců • minoritní forma CF je způsobena kongenitální bilaterální absencí vas deferens (CBAVD) – CBAVD nepostihuje spermatogenezi IVF + intracytoplasmická injekce testikulárních spermií (ICSI) – jestliže partnerka je také nositelkou některé z mutací CFTR genu, pak ICSI procedura je následována PGD • 70% mutací CFTR genu v Evropské populaci : F508del – oba partneři nositelé F508del (49%) – jeden partner :F508del a druhý jiná mutace (42%) (PGD zaměřena na eliminaci embryí nesoucích F508del – oba partneři nesou jinou mutaci než F508del (9%) (specifický test na detekci mutací nebo nepřímá DNA dignostika) Identifikace alel • nepřímá DNA diagnostika: užití polymorfních míst v genu (haplotyp) – jednoduchý a universální test pro všechny páry, jakmile je nalezena heterozygozyta polymorfního místa – interní kontrola kontaminace vzorku – dva a více polymorfních markerů snižuje riziko chybné interpretace (ADO) – vyhodnotí status ploidie testované blastomery Fragmentační analýza F508del z jedné buňky