BIOINFORMATIKA V PRAXI – CVIČENÍ 7


                                   PREDIKCE VLASTNOSTÍ PROTEINŮ

                       ZÁKLADNÍ FYZIKÁLNĚ-CHEMICKÁ CHARAKTERISTIKA PROTEINŮ



STUDIJNÍ MATERIÁLY

The ExPASy (Expert Protein Analysis System) proteomics server of the Swiss Institute
of Bioinformatics (SIB), http://www.expasy.org/.


ÚKOL 1

Pomocí programu ProtParam určete základní fyzikálně-chemické parametry následujícího proteinu:


???


ÚKOL 2

Porovnejte extinkční koeficient u následujících proteinů:


Protein 1

???


Protein 2

???


ÚKOL 3

Porovnejte in vivo „životnost“ následujících proteinů:


Protein 1

???


Protein 2

???


ÚKOL 4

Porovnejte stabilitu následujících proteinů:


Protein 1

???


Protein 2

???


ÚKOL 5:

Porovnejte „aliphatic index“ a parametr „GRAVY“ u následujících proteinů:


Protein 1

???



Protein 2
???

ÚKOL 6:

Pomocí programu ProtParam určete základní fyzikálně-chemické parametry následujícího proteinu:

???

SAMOSTATNÝ PROJEKT
Pomocí programu ProtParam určete u vašeho proteinu základní fyzikálně-chemické parametry.