Příprava datového souboru s lékařskými daty
ke statistickému zpracování
Při zpracování lékařských dat se často stává, že máme vypočítat rozdíl mezi dvěma daty, např.
potřebujeme znát:
- věk pacienta v době diagnózy či operace (v letech)
- dobu sledování (v měsících)
- dobu do návratu onemocnění (v měsících)
- dobu přežití (v měsících)
- apod.
Pro tyto výpočty slouží v EXCELu funce DATEDIF(Parametr1; Parametr2; Parametr3).
Parametr1 je počáteční datum.
Parametr2 je koncové datum.
Parametr3 specifikuje, v jakých jednotkách dostaneme výsledek. Píše se do uvozovek.
“D“ … počet dnů mezi dvěma daty.
“M“ … počet měsíců mezi dvěma daty.
“Y“ … počet roků mezi dvěma daty.
Upozornění: Pro bezproblémovou práci s daty se v EXCELu doporučuje zadávat datum
pomocí funkce DATUM(rok; měsíc; den).
Příklad:
datumnarození
datumdg./op.
věk
datumposl.kontroly
dobasledování
10.11.1945 17.3.2009 63 15.7.2010 15
19.2.1963 25.8.2008 45 30.11.2010 27
23.4.1952 19.9.2009 57 13.3.2011 17
V1. sloupci máme datum narození, ve 2. sloupci datum diagnózy či operace.
Do 3. sloupce umístíme věk pacienta (v letech):
=DATEDIF(A2;B2;“Y“)
Tento vzorec pak zkopírujeme do ostatních řádků ve 3. sloupci.
Ve 4. sloupci je datum poslední kontroly.
Do 5. sloupce umístíme dobu sledování (v měsících):
=DATEDIF(B2;D2;“M“)
Tento vzorec pak zkopírujeme do ostatních řádků v 5. sloupci.
Samostatný úkol
Načtěte do EXCELu datový soubor nadory_zaludku.xls. Obsahuje údaje o 47 pacientech
léčených v MOÚ s nádorem žaludku. Hlavním záměrem bude zkoumání akutní a chronické
toxicity radioterapie.
Úkoly pro EXCEL:
1. Vypočtěte věk pacientů v době diagnózy (v letech). Věk umístěte do sloupce AX.
2. Do sloupce AY, který nazvete smrt, dejte 1, když pacient zemřel a 0, když pacient žije.
Nápověda: použijte funkci KDYŽ.
3. Vypočtěte dobu sledování pacientů (v měsících) od data diagnózy buď do data úmrtí (pro
zemřelé pacienty) nebo do data poslední kontroly (pro žijící pacienty). Dobu sledování
umístěte do sloupce AZ. Nápověda: použijte funkci KDYŽ.
4. Vypočtěte dobu od operace do jakéhokoliv relapsu (v měsících) resp. do poslední kontroly.
Výsledek patří do sloupce BA.
5. Do sloupce BB, který nazvete výskyt relapsu, dejte 1, když měl pacient relaps a 0 jinak.
6. Takto upravený soubor uložte a načtěte do STATISTIKY.
Úkoly pro STATISTIKU:
1. Sloupce AG až AO se týkají akutní toxicity radioterapie (AP obsahuje 1 pro smrt
způsobenou akutní toxicitou léčby, 0 jinak) a sloupce AQ až AV se týkají chronické toxicity
radioterapie (AW obsahuje 1 pro smrt způsobenou chronickou toxicitou léčby, 0 jinak).
V těchto sloupcích jsou chyby, vedle označení G0, G1, G2, G3 se vyskytují 0 a 1. Správně by
tam měly být textové hodnoty G0, G1, G2, G3 podle stupně závažnosti toxicity. Chyby
opravte a textovým hodnotám G0, G1, G2, G3 přiřaďte postupně čísla 0, 1, 2, 3.
2. Proměnnou stadium překódujte tak, že stadium 1 a 2 bude považováno za nižší stadium a
stadium 3 a 4 za vyšší stadium. Tuto novou proměnnou nazvěte r_stadium a umístěte ji
za proměnnou výskyt relapsu.
3. Za proměnnou r_stadium vložte 16 dalších proměnných, a to nauzea a/n, zvracení a/n,
bolest a/n, váh. úbytek a/n, insekt a/n, hematotoxicita a/n, průjem a/n, nechutenství a/n, břišní
dyskomfort a/n, stenoza a/n, jícen a/n, píštěl a/n, ulcerace a/n, pyroza a/n, slizniční změny –
gastritida a/n. Příslušné proměnné překódujte do těchto nových proměnných tak, aby
v případě výskytu toxicity (bez ohledu na intenzitu) se v nové proměnné ocitla 1 (textová
hodnota „ano“), v opačném případě 0 (textová hodnota „ne“).