DNA marker 155‐970 coloured  (katalogové číslo C109, C111)    Popis  Odhad velikostí DNA fragmentů generovaných v PCR (PCR fragmentů) je obvykle založen na srovnání elektroforetické  pohyblivosti  těchto  fragmentů  s  fragmenty  DNA  o  známé  velikosti  (DNA  markerů).  PCR  fragmenty  jsou  obvykle  v  rozmezí  200  ‐  900  párů  bazí.  Tuto  oblast  pokrývají  fragmenty  DNA,  které  jsou  součástí  DNA  markeru  155‐970  coloured.  Tyto  fragmenty  vznikly  působením  restrikčního  enzymu  na  referenční    plasmid.  Tento  marker  navíc  obsahuje  tři  barvičky  [bromofenolovou  modř,  xylen  cyanol  a  inertní  barvivo  (Purple)].  Zvýšená  hustota  tohoto  markeru umožňuje jeho vkládání přímo do jamek gelu (bez nutnosti jeho smíchání s vkládacím pufrem). Tento marker  je zvláště vhodný v kombinaci s PCR produkty generovaných pomocí Taq‐Purple DNA polymerázy (kat. č. T107‐T109).    Technické údaje  Koncentrace  • 1 µg DNA/12 µl pufru (5 mM Tris‐HCl, 5 mM MgCl2,, 0,5 mM dithiothreitol, 50 mM NaCl a 50 mM EDTA).  Kontrola kvality  • přítomnost odpovídajících fragmentů je kontrolována elektroforézou v agarózovém gelu. Pouze fragmenty  uvedené v obr. jsou pozorovány.  Poměr A260/A280 je v rozmezí 1, 8 ‐ 2,0.  Balení  • 1 zkumavka, obsahující 25 µg restrikčních fragmentů ve 300 µl pufru. Jedno balení umožní přípravu 30 analýz.    Skladování  • při teplotě ‐20 ± 5o C. Materiál snáší opakované rozmrazování.    Protokol   Doporučený protokol pro určování velikosti PCR produktů  10 µl DNA markeru 155‐970 col. se nanáší přímo do jamek v gelu připraveném z 1,2% PCR agarózy (Kat. č. P 045)  Do vedlejších jamek nanášet vzorky připravené smícháním:  • 10 µl produktu PCR,  • 2 µl PCR vkládacího pufru.  Provést elektroforézu a odhadnout velikost PCR produktu na základě srovnání jeho pohyblivosti s DNA markerem.                      Obr. 1. Elektroforetická separace DNA markeru 155‐970 col.  10  µl  DNA  markeru  bylo  separováno  v  1,2%  agarózovém  gelu,  který  obsahoval  ethidium  bromid  (1  µg/ml)  a  1x  TBE  pufr.  Čísla  vyjadřují  počty  párů  bazí  v odpovídajících DNA fragmentech.            Kat. č.    Název výrobku a specifikace  Množství  ____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________  C 109    DNA marker 155‐970 col.    25 µg/300 µl  C 111    DNA marker 155‐970 col.    5x 25 µg/300 µl