DOMÁCÍ ÚKOL B2


Vyhledávání ekotoxikologických dat v databázi US-EPA ECOTOX Database


Cíl úkolu B2: Cílem úkolu je vytvořit soubor dat v MS Excel, který obsahuje relevanní
ekotoxikologická data extrahovaná z databáze US -PA  ECOTOX k látce  karbofuran, CAS 1563-66-2.
Tento soubor dat bude v následujícím bloku cvičení využit k tvorbě SSD modelu v softwaru ETX 2.0.


Vypracovat do: 3 vypracované tabulky v MS Excel (stejně jako ve vzorovém příkladu) pošlete do
neděle 5.4.2015 na zuzana.tousova@seznam.cz


Přesné zadání úkolu:


1.      Vytvořte databázi v Excelu pro KARBOFURAN (CAS 1563-66-2) tak, aby šla použít pro tvorbu
SSD modelu.


A.                  S využitím databáze US-EPA ECOTOX (http://cfpub.epa.gov/ecotox/ ) a  toho, co
jste se naučili ve cvičení, vytvořte takovou databázi pro karbofuran, která bude obsahovat pouze:

EC50/IC50/LD50/ED50/LC50 hodnoty z akutních testů toxicity (1-7 dní), pro efekty, které mají přímý
vliv na změnu abundance a složení společenství organismů (intoxikace, mortalita, efekty na
populaci, u primárních producentů i efekty na růst a fyziologické efekty jako změna fotosyntézy
nebo fixace dusíku; zvažte také vliv na reprodukci – konkrétně efekt „GREP“). Typ expozice musí být
environmentálně relevantní (tedy NE např. gavální nebo injekční apod.) a hodnoty MUSÍ pocházet
z testů prováděných s čistou látkou (čistota karbofuranu 90% a víc, NESMÍ se používat data získaná
testováním přípravků jako např. FURADAN apod.; naopak technický karbofuran použít lze).

Přehled kódů (zkratek) užívaných v databázi najdete na
http://cfpub.epa.gov/ecotox/blackbox/help/codelist.pdf .


-     Dejte pozor na hodnoty uvedené jako „<” či “ >” (např EC50 < 25 ug/l). Tyto hodnoty jsou „nic
neříkající“ a nepoužívají se!

-     Pokud je hodnota uvedena jako rozmezí (min-max), použijte průměr těchto dvou hodnot

-     Také nezapomeňte správně převést všechny hodnoty na správné jednotky na µg/l!

-     Pokud jsou některé z uvedených důležitých údajů neznámé („NR“), měli byste najít původní
článek a tyto údaje dohledat a do tabulky doplnit


B.                  Hodnoty ve vzniklé databázi zkontrolujte a do nového sloupce označte duplicitní
nebo podezřelé hodnoty, které nebudete pro SSD model používat.


DŮLEŽITÁ POZNÁMKA:

Celkově vytvořte dvě tabulky do dvou listů.

První tabulka bude obsahovat všechna původní data a pomocí filtru v ní budou odfiltrována data
nechtěná. V této tabulce jsou v nových sloupcích uvedeny všechny změny a poznámky (např. poznámka o
změně jednotek, poznámka o nalezené čistotě testované látky či poznámka o duplicitním údaji) pro
pozdější kontrolu a případně změnu finální databáze.

Druhá tabulka se vytvoří do nového listu zkopírováním odfiltrované první tabulky. Tím pádem už
obsahuje pouze zkopírovaná „chtěná data“, která budou použita pro tvorbu SSD.


2.      Vytvořte druhou tabulku v Excelu (v novém listu) pro KARBOFURAN (CAS 1563-66-2), ve které
již budou pouze tři sloupce:

1. sloupec: druhový název organismu (latinsky)

2. sloupec: Taxonomická skupina, do které patří

3. sloupec: Geometrický průměr z hodnot EC50(+LD50, IC50 atd.) pro tento organismus


Pro pomoc při tvorbě vašich tabulek můžete použít to, co jste vytvořili na cvičení a přiložený
vzorový Excel soubor: Domaci ukol B2_vzor_alachlor.xlsx

Pokud si s něčím nebudete úplně jistí, napište si poznámku do jednoho z nově vytvořených sloupců a
zeptejte se na dalším cvičení.