Jednoduchá úloha pro stanovení velikosti amplikonu



Závislost velikosti DNA na elektroforetické pohyblivosti není lineární. V určitém zjednodušení může
být vyjádřena logaritmickou funkcí. Stanovte délku amplifikačního produktu z obrázku výsledné
elektroforézy.


Mleko020702

Standard  A    B   C     D    E


START



















Velikost standardů                  Elektroforetická pohyblivost

A = 500 bp                              29,0 mm

B = 400 bp                              32,5 mm

C = 300 bp                              35,5 mm

D = 200 bp                              38,0 mm

E = 100 bp                              45,0 mm


Návod řešení:

Vyneste hodnoty přirozeného logaritmu velikosti standardů a elektroforetické pohyblivosti do grafu
a z něho pak odečtěte velikost amplikonu.


                                             N = ln X

kde

N = elektroforetická pohyblivost v cm

X = velikost DNA fragmentu v bp