Jetel luční (Trifolium pratense L.) Aplikovaná genetika a šlechtění rostlin Mgr. Jana Dluhošová 12. 5. 2015 OSNOVA  Taxonomie  Rod Trifolium  Významní zástupci  Jetel luční  Květní biologie a rozmnožování  Genom jetele lučního  Šlechtění jetele v ČR  Cíle šlechtění  Klasické metody šlechtění  Mezidruhová hybridizace  Nové genomické přístupy TAXONOMICKÉ ZAŘAZENÍ A KLASIFIKACE  Čeleď bobovité (Fabaceae)  třetí nejpočetnější mezi krytosemennými rostlinami (745 rodů a 19 500 druhů)  druhá ekonomicky nejvýznamnější  3 hlavní podčeledi  stáří 59 milionů let  Rod jetel (Trifolium)  podčeleď Papilionoideae, skupina IRLC  jeden z největších rodů (245 druhů)  podrody Chronosemium a Trifolium  podrod Trifolium celkem 8 sekcí podčeleď Papilionoideaerod Trifolium ROD TRIFOLIUM  V ČR celkem 23 druhů  Byliny, většinou trojčetné listy, květy v hlávkovitých květenstvích  Kosmopolitní rozšíření, největší diverzita v mírném pásu severní polokoule  Centra původu  kolem Středozemního moře – hlavní – větší počet druhů i diverzita počtu chromozomů  západní část Severní Ameriky  V ČR i celé Evropě původní  U 131 druhů fixace vzdušného dusíku v hlízkách – symbióza s bakteriemi Rhizobium leguminosarum biovar trifolii  Využití jako pícniny, rostliny pro luční a travní porosty, medonosné rostliny a také v lidovém léčitelství  pro zemědělské účely od 16. století VÝZNAMNÍ ZÁSTUPCI  Jetel luční (T. pratense) – 49 odrůd  Jetel plazivý (T. repens) – 13 odrůd  pastva, součást porostů, medonosná a okrasná rostlina, vysoký podíl proteinů, lidové léčitelství  Jetel zvrhlý (T. hybridum) – 3 odrůdy  pícnina chladnějších oblastí (sever Evropy)  Jetel nachový (T. incarnatum) – 2 odrůdy  pícnina, luční porosty, zelené hnojení, spíše teplejší oblasti, medonosná rostlina  Jetel zvrácený (T. resupinatum) – 1 odrůda  pícnina, zelené hnojení, okrasná rostlina, spíše Blízký východ  Jetel egyptský (T. alexandrinum) – 1 odrůda  pícnina v subtropických oblastech, medonosná rostlina  Uvedené odrůdy jsou zapsané ve Státní odrůdové knize JETEL LUČNÍ  Podrod Trifolium, sekce Trifolium  Ve formě monokultury nebo jetelotravách  Jedna z hlavních pícnin v ČR  kvalitní objemná píce s vysokým obsahem bílkovin  kvalitnější než vojtěška – vyšší množství dusíkatých látek, lépe stravitelná  Vysoká předplodinová hodnota  součást Norfolského čtyřhonného osevního postupu  hlavní jetelovina v bramborářské a obilnářské oblasti a na stanovištích s vyšší hladinou podzemní vody  Medonosná rostlina  Léčivá bylina  Desinfekční účinky – léčba průjmů, zvracení, ekzémů a drobných poranění  Léčba kašle, rýmy, nachlazení, bronchitidy  Vysoký obsah fytoestrogenů – léčba potíží spojených s menopauzou NEDOSTATKY  Kvůli horizontálnímu uložení pupenů často mechanicky poškozena  Náchylnost na holomrazy kvůli nadzemnímu umístění kořenového krčku  Choroby  houby způsobující krčkové a kořenové hniloby (Macrophonina phasealina, Fusarium sp.)  rakovina jetele (Sclerotinia trifoliorum)  padlí (Erysiphe trifolii)  anthraknóza (Kabatiella caulivora)  listová skvrnitost (Stemphlium sarcinaeforme)  rez jetelová (Uromyces trifolii) KVĚTNÍ BIOLOGIE A ROZMNOŽOVÁNÍ  Květy oboupohlavné, osově souměrné  Stavba květu typická pro čeleď Fabaceae  Květy dlouze trubkovité s klapkovým systémem opylení  Hmyzosnubné – převážně čmeláci, ale také včely a motýli  Cizosprašnost - blizna výše než tyčinky -> přednostní opylení cizím pylem  Plodem lusk – většinou jedno semeno, velikost 1,5 – 2,5 mm v závislosti na ploidii GENOM JETELE LUČNÍHO  Velikost haploidního genomu 418 Mbp  Základní chromozomové číslo x = 7  Diploidní (2n = 14) nebo autotetraploidní (2n = 28)  Velmi variabilní genom a vysoká míra heterozygotnosti kvůli cizosprašnosti a silné gametofytické inkompatibilitě ŠLECHTĚNÍ JETELE V ČR - HISTORIE  Počátky už v 18. století, zlomové založení první šlechtitelské stanice r. 1893 v Měšicích u Tábora  Kolem r. 1925 první specializovaný pícninář prof. Dr. Karel Holý  Vyšlechtěny první výkonné české diploidní odrůdy  Od r. 1962 polyploidizace – šlechtitelská stanice v Hladkých Životicích – Ing. Antonín Fojtík, CSc.  Vznikl mezinárodní šlechtitelský tým – Československo, Polsko a NDR -> odtud většina dnešních tetraploidních odrůd  V tomto období započato první rezistentní šlechtění vůči rakovině jetelové a houbovým onemocněním ŠLECHTĚNÍ JETELE V ČR - SOUČASNOST  Ve Státní odrůdové knize zapsáno 49 odrůd  26 diploidních odrůd  23 tetraploidních odrůd  Tetraploidní odrůdy  větší květy i listy  vyšší výnos zelené i suché píce  vyšší obsah vodorozpustných cukrů a dusíkatých látek  vyšší vytrvalost  menší množství semen  České odrůdy se používají v Rakousku, Slovensku, Švýcarsku, Německu, Francii, Itálii, Švédsku, Litvě, Lotyšsku, Ukrajině, ale také v Kanadě a na severu USA CÍLE ŠLECHTĚNÍ  Šlechtěny na výnos a kvalitu píce, vyšší výnos semene, vyšší vytrvalost, vyšší fixaci vzdušného dusíku, různé stupně ranosti a pozdnosti, odolnost k virovým i houbovým chorobám, odolnost k různým klimatickým podmínkám, odolnost proti poléhání, rychlost obrůstání po sečích  Vyšlechtěné odrůdy  odolnost k viru žluté mozaiky fazolu (BYMV) – Rezista  vyšší schopnost fixovat vzdušný dusík – Nodula  pozdnost nebo ranost – Radegast a Vesna  odolnost vůči listovým i kořenovým chorobám, větší výnos - Amos  větší vytrvalost, větší odolnost k padlí – Dolina  odolnost k fuzáriím – Fresko  odolnost k mykózám odumírání kořenů, listové skvrnitosti a spále, velmi vysoký výnos a rychlost obrůstání – Zefyr (2014) KLASICKÉ METODY ŠLECHTĚNÍ  Cizosprašnost, autoinkompatibilita – není nutná kastrace, ale překážka konvenčních metod šlechtění  V praktickém šlechtění se většinou kombinuje několik metod  Metody šlechtění  Hromadná selekce  Rekurentní selekce  Polycross  Strain building  Zpětné křížení  Jednoduché a dvojité hybridy METODY ŠLECHTĚNÍ  Hromadná selekce  z volného opylení, směs semen, pozitivní nebo negativní selekce, snadné  Rekurentní selekce  kvantitativní znaky, vybraní rodiče - počet > 100, cykly selekce, nemíchá se osivo  Polycross  klony s nejlepší kombinační schopností, komplexní znaky, časově a finančně náročné  Strain building  rodiče ve formě osiva, kombinační schopnost, časově velmi náročné, aditivní znaky  Zpětné křížení  zlepšení chybějících znaků, bez nutnosti zkoušek výkonu, moc se nepoužívá  Jednoduché a dvojité hybridy  ovlivnění autoinkompatibility, pouze jedna generace, v praxi se zatím nepoužívají MEZIDRUHOVÁ HYBRIDIZACE  Zvýšení vytrvalosti (introdukce znaku pro kořenové výběžky) a odolnosti k patogenům  Problematické – nekompatibilní základní chromozomové číslo blízce příbuzných druhů  Překonání bariér křižitelnosti – metody in vitro  Odrůda Pramedi: T. pratense x T. medium - světově unikátní NOVÉ GENOMICKÉ PŘÍSTUPY  Vzniklo několik genetických map (Isobe et al., 2003; Sato et al., 2005; Herrmann et al., 2006) včetně konsenzuální (Isobe et al., 2009)  1 cM ≈ 526 kbp  7262 SSR a 228 RFLP markerů  GenBank 38 353 EST sekvencí  Využito pro genetické mapování – QTL spojené s vytrvalostí, rezistencí vůči patogenům, odolností vůči nízkým teplotám, výnosem semen atd.  Cizosprašnost a vysoká variabilita genomu způsobují problémy s přenositelností vytvořených markerů mezi populacemi NOVÉ GENOMICKÉ PŘÍSTUPY  Sekvenace genomu 2013 – metoda Illumina  314,6 Mbp draft sekvence  charakterizace repetitivních sekvencí (> 45 % genomu)  predikováno 86 434 SSR markerů  predikováno 64 761 genů, 47 398 genů plně anotováno  srovnávací analýza genových rodin s M. truncatula, L. japonicus a C. arietinum  predikováno 687 genů rezistence  vyvinuty také SNP markery  Markery SNP – tvorba čipu – využití na mnohonásobnou selekci šlechtitelského materiálu Děkuji za pozornost