Cvičení 10.: Mnohonásobná lineární regrese Příklad: U 19 vzorků potravinářské pšenice byl zjišťován obsah zinku v zrnu (proměnná Y), v kořenech (proměnná X1), v otrubách (X2) a ve stonku a listech (X3). Data jsou v souboru zinek.sta Y X1 X2 X3 175 164 198 162 169 160 198 159 175 158 211 164 181 162 211 162 539 520 567 523 526 502 540 491 344 339 355 334 475 460 500 446 820 683 813 695 841 731 832 714 828 710 846 697 775 716 818 709 622 543 635 563 661 577 712 580 579 505 596 531 936 790 946 814 903 806 946 834 927 793 912 824 889 820 919 807 a) Normalitu proměnných Y, Xl, X2, X3 posuďte pomocí Lilieforsovým testem s hladinou významnosti 0,05. b) Závislost mezi dvojicemi proměnných (Y,X1), (Y,X2), (Y,X3) znázorněte dvourozměrnými tečkovými diagramy. c) Vypočtěte výběrovou korelační matici všech čtyř proměnných a pro α = 0,05 otestujte významnost jednotlivých korelačních koeficientů. d) Vypočtěte výběrové parciální korelační koeficienty ( )321 X,X.X,Yr , ( )312 X,X.X,Yr , ( )213 X,X.X,Yr a porovnejte je s výběrovými párovými korelačními koeficienty 1YXr , 2YXr , 3YXr . Na hladině významnosti a = 0,05 testujte hypotézy o nevýznamnosti parciálních korelačních koeficientu ( )321 X,X.X,Yρ , ( )312 X,X.X,Yρ , ( )213 X,X.X,Yρ . e) V první fázi zpracování předpokládejte, že je vhodný regresní model Y = β0+ β1x1 + β 2x2 + β3x3 + ε. Vypočtěte index determinace a interpretujte ho. Proveďte celkový F-test. Odhadněte parametry regresního modelu. Proveďte dílčí t-testy pro regresní koeficienty. Zjistěte odhad rozptylu. Vypočtěte parciální indexy determinace. (Hladinu významnosti volte α = 0,05.) f) Posuďte pomocí beta koeficientů vliv jednotlivých nezávisle proměnných veličin na regresní model. g) Z regresního modelu odstraňte ty proměnné, jejichž regresní koeficienty se neprokázaly významné pro α = 0,05. Sestavte nový regresní model a proveďte v něm tytéž úkoly jako v bodě e). h) Normalitu reziduí v tomto novém regresním modelu posuďte Lilieforsovým testem na hladině významnosti α = 0,05. i) V novém regresním modelu najděte 95% interval spolehlivosti pro teoretickou regresní funkci a 95% predikční interval. j) Proveďte regresi metodou STEPWISE, a to jak Forward, tak Backward. Řešení: Načteme datový soubor zinek.sta. ad a) Výsledky Lilieforsova testu normality proměnná testová statistika p-hodnota Y 0,15792 > 0,2 X1 0,15613 > 0,2 X2 0,18177 < 0,1 X3 0,16420 < 0,2 Na hladině významnosti 0,05 nelze ani v jednom případě zamítnout hypotézu o normalitě. ad b) Dvourozměrné tečkové diagramy dvojic (Y,X1), (Y,X2), (Y,X3) svědčí o existenci dosti silné přímé lineární závislosti. 100 200 300 400 500 600 700 800 900 X1 100 200 300 400 500 600 700 800 900 1000 Y 100 200 300 400 500 600 700 800 900 1000 X2 100 200 300 400 500 600 700 800 900 1000 Y 100 200 300 400 500 600 700 800 900 X3 100 200 300 400 500 600 700 800 900 1000 Y ad c) Výběrová korelační matice proměnných Y, X1, X2, X3 spolu s odpovídajícími p- hodnotami: Proměnná Y X1 X2 X3 Y X1 X2 X3 1,0000 ,9947 ,9981 ,9959 p= --- p=,000 p=0,00 p=0,00 ,9947 1,0000 ,9954 ,9980 p=,000 p= --- p=,000 p=0,00 ,9981 ,9954 1,0000 ,9962 p=0,00 p=,000 p= --- p=0,00 ,9959 ,9980 ,9962 1,0000 p=0,00 p=0,00 p=0,00 p= --- Na hladině významnosti 0,05 zamítáme hypotézu o nevýznamnosti jednotlivých korelačních koeficientů. ad d) Výběrový koeficient parciální korelace ( )321 X,X.X,Yr Proměnná Y X1 Y X1 1,0000 -,0390 p= --- p=,882 -,0390 1,0000 p=,882 p= --- Výběrový koeficient korelace 1YXr je 0,9947, zatímco ( )321 X,X.X,Yr je -0,039. Pokud eliminujeme vliv proměnných X2, X3, tak mezi proměnnými Y a X1 existuje velmi slabá nepřímá lineární závislost, která není na hladině 0,05 významná. Výběrový koeficient parciální korelace ( )312 X,X.X,Yr Proměnná Y X2 Y X2 1,0000 ,7515 p= --- p=,001 ,7515 1,0000 p=,001 p= --- Výběrový koeficient korelace 2YXr je 0,9981, zatímco ( )312 X,X.X,Yr poklesl na 0,7515. Pokud eliminujeme vliv proměnných X1, X3, tak mezi proměnnými Y a X2 existuje silná přímá lineární závislost, která je na hladině 0,05 významná. Výběrový koeficient parciální korelace ( )213 X,X.X,Yr Proměnná Y X3 Y X3 1,0000 ,2230 p= --- p=,390 ,2230 1,0000 p=,390 p= --- Výběrový koeficient korelace 3YXr je 0,99589, zatímco ( )213 X,X.X,Yr je pouze 0,223. Pokud eliminujeme vliv proměnných X1, X2, tak mezi proměnnými Y a X3 existuje slabá přímá lineární závislost, která není na hladině 0,05 významná. Vidíme, že existují značné rozdíly mezi párovými a parciálními výběrovými korelačními koeficienty. Lze tedy soudit na existenci multikolinearity. O tom svědčí i koeficienty VIF: Statistiky kolineace za daných podmínek (zinek.sta) Sigma-omezená parametrizace Efekt Toler. Rozptyl Infl fak R^2 Y Beta v Y Parciál. Y Semipar. Y t Y p X1 X2 X3 0,003802 262,9861 0,996198 -0,037425 -0,038960 -0,002308 -0,151006 0,881983 0,007214 138,6290 0,992786 0,793836 0,751501 0,067422 4,411716 0,000505 0,003120 320,5035 0,996880 0,242409 0,223005 0,013540 0,886006 0,389598 ad e) Výsledky pro regresní model Y = β0 + β1x1 + β 2x2 + β3x3 + ε Výsledky regrese se závislou proměnnou : Y (zinek.sta) R= ,99824679 R2= ,99649665 Upravené R2= ,99579598 F(3,15)=1422,2 p<,00000 Směrod. chyba odhadu : 18,094 N=19 Beta Sm.chyba beta B Sm.chyba B t(15) Úroveň p Abs.člen X1 X2 X3 -28,7607 10,60478 -2,71205 0,016066 -0,037425 0,247835 -0,0439 0,29089 -0,15101 0,881983 0,793836 0,179938 0,8079 0,18312 4,41172 0,000505 0,242409 0,273598 0,2802 0,31623 0,88601 0,389598 Adjustovaný index determinace je 0,9958, tedy zvolený regresní model s proměnnými X1, X2, X3 vysvětluje variabilitu proměnné Y z 99,58%. Testová statistika pro celkový F-test nabývá hodnoty 1422,2, odpovídající p-hodnota je velmi blízká 0, tedy model jako celek je významný na hladině 0,05. Odhad rozptylu získáme z tabulky analýzy rozptylu: Efekt Součet čtverců sv Průměr čtverců F Úroveň p Regres. Rezid. Celk. 1396846 3 465615,2 1422,205 0,000000 4911 15 327,4 1401757 s2 = 327,4 Odhadnutá regresní funkce má tvar: Y ) = -28,7607 – 0,0439x1 + 0,8079x2 + 0,2802x3. Dílčí t-testy pro jednotlivé regresní koeficienty: testová statistika pro test hypotézy H0: β0 = 0 je -2,71205, p-hodnota je 0,016066, tedy H0 zamítáme na hladině významnosti 0,05; testová statistika pro test hypotézy H0: β1 = 0 je -0,15101, p-hodnota je 0,881983, tedy H0 nezamítáme na hladině významnosti 0,05; testová statistika pro test hypotézy H0: β2 = 0 je 4,41172, p-hodnota je 0,000505, tedy H0 zamítáme na hladině významnosti 0,05; testová statistika pro test hypotézy H0: β3 = 0 je 0,88601, p-hodnota je 0,389598, tedy H0 nezamítáme na hladině významnosti 0,05. Výpočet parciálních indexů determinace: 9894,09947,0r 22 X,Y 1 == (Pokud do modelu Y = β0 + ε zařadíme veličinu X1, pak bude vysvětlovat variabilitu hodnot veličiny Y z 98,94%.) 6527,08079,0r 22 X.X,Y 12 == (Pokud do modelu Y = β0 + β 1x1 + ε zařadíme veličinu X2, pak bude vysvětlovat variabilitu hodnot veličiny Y z 65,27%.) ( ) 0497,0223,0r 22 X,X.X,Y 213 == (Pokud do modelu Y = β0 + β 1x1 + β 2x2 + ε zařadíme veličinu X3, pak bude vysvětlovat variabilitu hodnot veličiny Y z 4,97%.) ad f) Interpretace beta koeficientů: beta1 = -0,037425, beta2 = 0,793836, beta3 = 0,242409. V absolutní hodnotě je největší beta2, tedy obsah zinku v otrubách má největší vliv na obsah zinku v zrnu. ad g) Protože dílčí t-testy prokázaly, že na hladině 0,05 nejsou proměnné X1 a X3 významné, sestavíme nový regresní model Y = β0 + β2x2 + ε. Výsledky regrese se závislou proměnnou : Y (zinek.sta) R= ,99807615 R2= ,99615600 Upravené R2= ,99592988 F(1,17)=4405,5 p<0,0000 Směrod. chyba odhadu : 17,803 N=19 Beta Sm.chyba beta B Sm.chyba B t(17) Úroveň p Abs.člen X2 -30,2507 10,31117 -2,93378 0,009274 0,998076 0,015037 1,0157 0,01530 66,37372 0,000000 Adjustovaný index determinace je 0,9959, tedy zvolený regresní model s proměnnou X2 vysvětluje variabilitu proměnné Y z 99,59%. Testová statistika pro celkový F-test nabývá hodnoty 4405,5, odpovídající p-hodnota je velmi blízká 0, tedy model jako celek je významný na hladině 0,05. Vidíme, že Y ) = -30,2507 + 1,0157x2. Dílčí t-testy pro jednotlivé regresní koeficienty: testová statistika pro test hypotézy H0: β0 = 0 je -2,93378, p-hodnota je 0,009274, tedy H0 zamítáme na hladině významnosti 0,05; testová statistika pro test hypotézy H0: β2 = 0 je 66,37372, p-hodnota je 0,000000, tedy H0 zamítáme na hladině významnosti 0,05. ad h) Ověření normality reziduí Abychom mohli analyzovat rezidua, musíme je uložit. Ve výstupní tabulce zvolíme Rezidua/předpoklady/předpovědi – Reziduální analýza – Uložit – Uložit rezidua& předpovědi - OK. Testová statistika pro K-S test nabývá hodnoty 0,1163, odpovídající p-hodnota je větší než 0,20, tedy hypotézu o normalitě reziduí nezamítáme na hladině významnosti 0,05. Pro úplnost ještě posoudíme vzhled N-P plotu: -40 -30 -20 -10 0 10 20 30 40 Pozorovaná hodnota -2,0 -1,5 -1,0 -0,5 0,0 0,5 1,0 1,5 2,0Očekávanánormálníhodnota N-P plot svědčí o tom, že rozložení reziduí se příliš neliší od normálního rozložení. ad i) Intervaly spolehlivosti pro regresní funkci a pro predikci získáme pomocí dvourozměrných tečkových diagramů, kde v Detailech vybereme lineární proložení a zvolíme regresní pásy. 95% interval spolehlivosti pro regresní funkci 100 200 300 400 500 600 700 800 900 1000 X2 100 200 300 400 500 600 700 800 900 1000 Y 95% interval spolehlivosti pro predikci 100 200 300 400 500 600 700 800 900 1000 X2 100 200 300 400 500 600 700 800 900 1000 Y ad j) Nejprve aplikujeme metodu Forward: Statistiky – Vícerozměrná regrese – Proměnné – Závisle proměnná Y, Nezávisle proměnné X1, X2, X3 – OK – Detailní nastavení – zaškrtneme Další možnosti – OK – Metoda – zvolíme Kroková dopředná – na záložce Metoda zvolíme Zobrazit výsledky Po každém kroku – OK (V kroku 0 nejsou v regresní rovnici žádné proměnné.) Klikneme na Další – Výpočet:Výsledky regrese. Výsledky regrese se závislou proměnnou : Y (zinek.sta) R= ,99807615 R2= ,99615600 Upravené R2= ,99592988 F(1,17)=4405,5 p<0,0000 Směrod. chyba odhadu : 17,803 N=19 b* Sm.chyba z b* b Sm.chyba z b t(17) p-hodn. Abs.člen X2 -30,2507 10,31117 -2,93378 0,009274 0,998076 0,015037 1,0157 0,01530 66,37372 0,000000 V prvním kroku byla vybrána proměnná X2. Opět klikneme na Další a dostaneme výsledky kroku 2, který je již konečný: Výsledky regrese se závislou proměnnou : Y (zinek.sta) R= ,99824412 R2= ,99649132 Upravené R2= ,99605274 F(2,16)=2272,1 p<0,0000 Směrod. chyba odhadu : 17,533 N=19 b* Sm.chyba z b* b Sm.chyba z b t(16) p-hodn. Abs.člen X2 X3 -28,9426 10,20929 -2,83493 0,011948 0,788109 0,170440 0,8020 0,17345 4,62396 0,000282 0,210764 0,170440 0,2436 0,19700 1,23659 0,234086 Empirická regresní funkce má tvar Y ) = -28,9426 + 0,802x2 + 0,2436x3. Model jako celek je významný na hladině 0,05, avšak nezávisle proměnná X3 významná není. Přispívá však k vysvětlení variability hodnot závisle proměnné veličiny Y. Adjustovaný index determinace je 0,9961. V modelu s nezávisle proměnnou X2 byl 0,9959 a v modelu se všemi třemi nezávisle proměnnými byl 0,9958. Normalitu reziduí prozkoumáme pomocí N-P grafu a S-W testu: Normální p-graf z Rezidua Tabulka52 1v*19c Rezidua : SW-W = 0,9547; p = 0,4725 -40 -30 -20 -10 0 10 20 30 40 Pozorovaný kvantil -2,0 -1,5 -1,0 -0,5 0,0 0,5 1,0 1,5 2,0 Oček.normál.hodnoty Rezidua neporušují předpoklad normality. Nyní provedeme metodu Backward: Statistiky – Vícerozměrná regrese – Proměnné – Závisle proměnná Y, Nezávisle proměnné X1, X2, X3 – OK – Detailní nastavení – zaškrtneme Další možnosti – OK – Metoda – zvolíme Kroková zpětná – na záložce Metoda zvolíme Zobrazit výsledky Po každém kroku – OK – Výpočet:Výsledky regrese. Výsledky regrese se závislou proměnnou : Y (zinek.sta) R= ,99824679 R2= ,99649665 Upravené R2= ,99579598 F(3,15)=1422,2 p<,00000 Směrod. chyba odhadu : 18,094 N=19 b* Sm.chyba z b* b Sm.chyba z b t(15) p-hodn. Abs.člen X1 X2 X3 -28,7607 10,60478 -2,71205 0,016066 -0,037425 0,247835 -0,0439 0,29089 -0,15101 0,881983 0,793836 0,179938 0,8079 0,18312 4,41172 0,000505 0,242409 0,273598 0,2802 0,31623 0,88601 0,389598 V prvním kroku byly zařazeny všechny proměnné. Klikneme na Další – Výpočet: Výsledky regrese. Výsledky regrese se závislou proměnnou : Y (zinek.sta) R= ,99824412 R2= ,99649132 Upravené R2= ,99605274 F(2,16)=2272,1 p<0,0000 Směrod. chyba odhadu : 17,533 N=19 b* Sm.chyba z b* b Sm.chyba z b t(16) p-hodn. Abs.člen X2 X3 -28,9426 10,20929 -2,83493 0,011948 0,788109 0,170440 0,8020 0,17345 4,62396 0,000282 0,210764 0,170440 0,2436 0,19700 1,23659 0,234086 V tomto kroku byla vyloučena proměnná X1. Opět klikneme na Další – Výpočet: Výsledky regrese a dostaneme konečnou tabulku: Výsledky regrese se závislou proměnnou : Y (zinek.sta) R= ,99807615 R2= ,99615600 Upravené R2= ,99592988 F(1,17)=4405,5 p<0,0000 Směrod. chyba odhadu : 17,803 N=19 b* Sm.chyba z b* b Sm.chyba z b t(17) p-hodn. Abs.člen X2 -30,2507 10,31117 -2,93378 0,009274 0,998076 0,015037 1,0157 0,01530 66,37372 0,000000 Vidíme, že metoda STEPWISE, Backward poskytla stejné výsledky jako metoda ENTER. Příklad k samostatnému řešení: Byla změřena výška 20 osmnáctiletých chlapců (proměnná Y) a dále byly zjištěny výšky jejich příbuzných ve věku 18 let: X1 … výška matky, X2 … výška otce, X3 … výška babičky z matčiny strany, X4 … výška dědečka z otcovy strany, X5 … výška babičky z otcovy strany, X6 … výška dědečka z otcovy strany, X7 … výška chlapce při narození. Data jsou uložena v souboru vysky_pribuznych.sta. Nejprve proveďte korelační analýzu: vypočtěte koeficienty korelace proměnné Y se všemi nezávisle proměnnými. Korelace (vysky_pribuznych.sta) Označ. korelace jsou významné na hlad. p < ,05000 N=20 (Celé případy vynechány u ChD) Proměnná x1 x2 x3 x4 x5 x6 x7 y 0,395117 0,791297 -0,211974 -0,260861 0,193163 -0,230270 0,264300 Dále vypočtěte parciální korelační koeficienty proměnné Y s proměnnou X1 při vyloučení vlivu X3 a X4 a s proměnnou X2 při vyloučení vlivu X5 a X6. Parciální korelace (vysky_pribuznych.sta) S vyloučením vlivu:x3 a x4 Označ. korelace jsou významné na hlad. p < ,05000 N=20 (Celé případy vynechány u ChD) Proměnná y x1 y x1 1,0000 ,3600 p= --- p=,142 ,3600 1,0000 p=,142 p= --- Parciální korelace (vysky_pribuznych) S vyloučením vlivu:x5 a x6 Označ. korelace jsou významné na hlad. p < ,05000 N=20 (Celé případy vynechány u ChD) Proměnná y x2 y x2 1,000000 0,763265 0,763265 1,000000 Pomocí koeficientů VIF prověřte, zda v modelu, který vysvětluje proměnnou Y pomocí proměnných X1 až X7, mezi nezávisle proměnnými veličinami existuje multikolinearita. Statistiky kolineace za daných podmínek (vysky_pribuznych.sta) Sigma-omezená parametrizace Efekt Toler. Rozptyl Infl fak R^2 y Beta v y Parciál. y Semipar. y t y p "x1" "x2" "x3" "x4" "x5" "x6" "x7" 0,6093157 1,6411853 0,3906843 0,4091246 0,7398021 0,3193573 3,8089422 0,0024890 0,6095369 1,6405897 0,3904631 0,8272421 0,9120212 0,6458515 7,7030062 0,0000055 0,8091856 1,2358105 0,1908144 -0,0669916 -0,2031556 -0,0602621 -0,7187401 0,4860614 0,8192387 1,2206455 0,1807613 0,0509976 0,1569551 0,0461588 0,5505319 0,5920558 0,6902695 1,4487094 0,3097305 0,0569490 0,1607847 0,0473146 0,5643166 0,5829329 0,6513272 1,5353267 0,3486728 -0,0709651 -0,1934629 -0,0572722 -0,6830803 0,5075302 0,6796494 1,4713469 0,3203506 0,2692289 0,6071912 0,2219546 2,6472305 0,0212876 V uvedeném regresním modelu posuďte pomocí beta koeficientů vliv jednotlivých nezávisle proměnných na Y. Použijte také Paretův diagram. N=20 b* Abs.člen x1 x2 x3 x4 x5 x6 x7 0,409125 0,827242 -0,066992 0,050998 0,056949 -0,070965 0,269229 Paretův graf standardizovaných koeficientů Proměnná: y: výška chlapce v 18 letech Sigma-omezená parametrizace 0,0 0,1 0,2 0,3 0,4 0,5 0,6 0,7 0,8 0,9 1,0 Standardizované koeficienty (absolutní hodnota) "x4" "x5" "x3" "x6" "x7" "x1" "x2" ,0509976 ,056949 ,0669916 ,0709651 ,2692289 ,4091246 ,8272421 Nyní pro výstavbu modelu použijte dopřednou i zpětnou krokovou metodu a jejich výsledky porovnejte. Dopředná metoda: Výsledky regrese se závislou proměnnou : y (vysky_pribuznych.sta) R= ,95111334 R2= ,90461658 Upravené R2= ,88673219 F(3,16)=50,581 p<,00000 Směrod. chyba odhadu : 2,3719 N=20 b* Sm.chyba z b* b Sm.chyba z b t(16) p-hodn. Abs.člen x2 x1 x7 -199,722 33,79003 -5,91069 0,000022 0,873161 0,078496 1,106 0,09942 11,12369 0,000000 0,364507 0,085585 0,688 0,16156 4,25898 0,000600 0,263581 0,086598 1,373 0,45103 3,04372 0,007740 Zpětná metoda: Výsledky regrese se závislou proměnnou : y (vysky_pribuznych.sta) R= ,92162267 R2= ,84938835 Upravené R2= ,83166934 F(2,17)=47,937 p<,00000 Směrod. chyba odhadu : 2,8915 N=20 b* Sm.chyba z b* b Sm.chyba z b t(17) p-hodn. Abs.člen x1 x2 -156,313 37,34335 -4,18582 0,000620 0,474630 0,094553 0,896 0,17849 5,01972 0,000105 0,836417 0,094553 1,059 0,11976 8,84599 0,000000 Mezi těmito dvěma modely rozhodněte na základě reziduální analýzy a adjustovaného indexu determinace.