Taxonomie, fylogenetika a zoologická nomenklatura

Program semestru, jaro 2017

Pokud neudáno jinak, koná se v úterky 8.00 – 10.50 v místnosti vertebratologických sbírek (A31-238,
                                 v koridoru kampusu v Bohunicích)


21. února          Systematika, taxonomie a stručný přehled jejich historického vývoje (I.
Malenovský).

28. února          Taxon, kategorie, koncepce druhu, taxonomický znak, vnitrodruhová variabilita
(I. Malenovský).

7. března          Fenetika, přehled a využití statistických metod v současné taxonomii.
Taxonomický znak z hlediska statistiky, klasická a geometrická morfometrika, shlukové analýzy,
ordinace, diskriminační analýza, umělé neuronové sítě, automatické určování druhů (I. Malenovský).

14. března        Úvod do kladistiky: podobnost a příbuznost, homologie, (syn)apomorfie a
(sym)plesiomorfie, princip maximální úspornosti (parsimonie), hypotéza v systematice, určení
polarity a kódování znaků (I. Malenovský).

21. března        Kvantitativní kladistika: konstrukce kladogramu, optimalizace a vážení znaků,
porovnávání a testování kladogramů, konsensus, kladistický software (I. Malenovský).

28. března        Metody aplikovatelné v molekulární taxonomii a fylogenetice: proteiny, nukleové
kyseliny a jejich extrakce, PCR, klonování a sekvencování DNA, hybridizace DNA, RAPD, restrikční
analýzy, mikrosatelity, DNA barcoding (A. Tóthová).

4. dubna           Rekonstrukce fylogenetických vztahů na základě molekulárních dat: zpracování
sekvenačních dat, maximální parsimonie, maximální věrohodnost, Bayesiánská analýza a distanční
metody (A. Tóthová).

11. dubna         Molekulární metody v praxi: návštěva laboratoře (L. Petráková).

18. dubna         Přednosti a omezení molekulárních a morfologických dat, zdroje chyb a konfliktů,
kombinace různých typů dat ve fylogenetické analýze. Aplikace fylogenetické analýzy: klasifikace,
historická biogeografie, testování koevoluce a evolučních scénářů (I. Malenovský).

25. dubna         Mezinárodní pravidla zoologické nomenklatury 1: základní principy, použitelnost,
platnost a tvoření jmen (P. Kment).

2. května          Práce s taxonomickým materiálem a literaturou: návštěva depozitáře
Entomologického oddělení Moravského zemského muzea v Brně-Slatině. Sbírky, taxonomická revize,
popis nových taxonů, určovací klíče, databáze biodiverzity, elektronická taxonomie (I. Malenovský).

9. května          Mezinárodní pravidla zoologické nomenklatury 2: homonymie a synonymie, princip
priority versus stabilita, pojem typu v nomenklatuře. Souhrn a procvičení (P. Kment).

16. května        Příklady, procvičení, diskuse.


Kontakty

Mgr. Igor Malenovský, Ph.D. – Ústav botaniky a zoologie, PřF MU, Univerzitní kampus Bohunice
(budova A31, kancelář 118), tel. 549 49 8094, e-mail: malenovsky@sci.muni.cz

RNDr. Andrea Tóthová, Ph.D. – Ústav botaniky a zoologie, PřF MU (část. rodičovská dovolená),
e-mail: tothova sci.muni.cz

Mgr. Petr Kment, Ph.D. – Entomologické oddělení, Národní muzeum, Kunratice 1, Praha, tel. 244 911
374, e-mail sigara@post.cz