strana 1 Ústav chemie a biochemie Témata pro pregraduální studium §Více než 80 zaměstnanců §Více než 350 m2 laboratoří §Přístrojové vybavení na světové úrovni §Součástí Středoevropského Technologického Institutu (CEITEC) http://www.af.mendelu.cz/rs/obrazek.pl?id=6910 •Ústav chemie a biochemie Ústav chemie a biochemie C:\Users\PC-Student03\Desktop\fotky_ÚCB\IMG_5185.jpg §Zařízení pro chov zvířat a kultivaci buněk §In vivo zobrazovací systém §Hmotnostní spektrometry §Kapilární elektroforéza s UV-Vis a laserem indukovanou fluorescenční detekcí §Gelová elektroforéza (1D a 2D systémy) §Fluorescenční a konfokální mikroskop §Vysokoúčinná kapalinová chromatografe s elektrochemickou, UV-Vis a hmotnostní detekcí §Automatický pipetovací robot §Stacionární elektrochemické analyzátory a elektrodová pole §Zařízení pro klinickou biochemii •Ústav chemie a biochemie – Vybavení Ústav chemie a biochemie - vybavení strana 4 Představení hlavních výzkumných směrů a témat strana 5 Laboratoř bioanalýzy a zobrazování Mgr. Markéta Vaculovičová, Ph.D. (marketa.vaculovicova@mendelu.cz) C:\Users\PC-Student03\Desktop\fotky_ÚCB\IMG_5232.jpg •Laboratoř sensorů a zobrazování Zaměření: bioanalytická chemie elektromigrační separační techniky vývoj miniaturizované instrumentace (lab on chip) fluorescenční zobrazování Vývoj miniaturizovaného stavebnicového systému pro elektroforetickou analýzu biomolekul Laboratoř bioanalýzy a zobrazování Video: ex vivo fluoresccenční zobrazování tlukoucího srdce potkana Zobrazení prsního nádoru pomocí štěpitelné fluorescenční sondy, poskytující signál po štěpení specifickými proteiny pouze v nádoru nádor Video: Využití fluorescenčních nanomateriálů (kvantových teček) o různých vlastnostech ve zobrazování D:\Marketa\granty\Excelence -Postdok\LIF detector\IMG_5268.JPG •Téma: •Využití protilátkami modifikovaných magnetických částic pro on-line analýzu kapilární elektroforézou strana 7 Laboratoř bioanalýzy a zobrazování strana 8 Témata pro postgraduální studium Laboratoř nádorové biologie a nanomedicíny Mgr. Zbyněk Heger, Ph.D. (heger@mendelu.cz) C:\Users\PC-Student03\Desktop\fotky_ÚCB\IMG_5193.jpg •Laboratoř nádorové biologie a nanomedicíny §Mezinárodní tým laboratoře se zabývá studiem mechanismů účastnících se nádorových procesů, se zvláštní pozorností na nádory prostaty, prsu a neuroblastomů. §V laboratoři je dále studováno využití nanomateriálů v medicíně, a to zejména proteinových klecí v cílené protinádorové terapii. §Experimentálně je laboratoř zaměřena na in vitro práci s maligními i nemaligními buněčnými liniemi a přesahem do práce s in vivo experimentálními modely a klinickými vzorky. • • • • • • • Laboratoř nádorové biologie a nanomedicíny •Téma: §Vývoj artificiálního modelu hematoencefalické bariéry pro studium transcytózy nanomateriálů § strana 10 Laboratoř nádorové biologie a nanomedicíny Výsledek obrázku pro blood brain barrier strana 11 Laboratoř biomarkerů a průtokových technik RNDr. Ondřej Zítka, Ph.D. (zitkao@seznam.cz) C:\Users\PC-Student03\Desktop\fotky_ÚCB\IMG_5206.jpg •Laboratoř biomarkerů a průtokových technik •Laboratoř se zabývá bioanalytickou chemií v oblasti nízkomolekulárních sloučenin a proteinů pomocí moderních analytických metod. Studovány jsou zejména nízkomolekulární biomárkery a antioxidanty. Dále se nově zaměřujeme na implementaci senzorů do fluidních zařízení pro účely miniaturizace a automatizace. • •Výzkumné směry laboratoře: §Separace a detekce biomárkerů pro diagnostiku (antioxidanty, aminokyseliny) §Hmotnostní spektrometrie pro proteomiku a MALDI imaging §Průtokové a fluidní technologie s využitím magnetických částic pro automatizované analýzy s využitím elektrochemické detekce Laboratoř biomarkerů a průtokových technik • • • • • • • ü http://www.cell.com/cms/attachment/614879/4948742/gr2.jpg http://pathologyinnovations.com/Froz%20tech%202.jpg •Syringe Pump •waste •Switching valve •Detector •(CHI Cell) •(control) •Sample/rinsing buffer inlet •PC •MALDI imaging tkáňových řezů •Zachycení biomárkeru na magnetické částice a mikrofluidní detekce •Přístrojové vybavení •MALDI MS •Separace proteinů •Separace aminokyselin •HPLC-MS •(biomárkery) •HPLC-ED •(antioxidanty) http://svet-3d-tisku.cz/img/profi-3d-maker.jpg •3D tisk - technologie •Laboratoř biomarkerů a průtokových technik Laboratoř biomarkerů a průtokových technik •Témata: §Průtokové systémy s elektrochemickou detekcí pro analýzu biomolekul §Konstrkuce zařízení pro POCT využívající magnetickou separaci §Studium isoforem metallothioneinu ve vzorcích nádorové tkáně pomocí hmotnostní spektrometrie strana 14 Laboratoř biomarkerů a průtokových technik strana 15 Laboratoř metabolomiky a epigenetiky rostlin Ing. Dalibor Húska, Ph.D. (dalihus@gmail.com) Laboratoř rostlinné metabolomiky a epigenetiky Non-coding RNA - Crispr/Cas9 200 000 - známých/neznámých metabolitů budoucnost ve výživě, medicíně a energetice Sekundární metabolity zásadní význam ve studiu růstu, vývoji a interakci s prostředím salinita těžké kovy patogeny sucho Laboratoř metabolomiky a epigenetiky rostlin nanočástice •Téma: §Studium miRNA u jednobuněčných řas §Role miRNA v biosyntéze sekundárních metabolitů. §Crispr/Cas9 v metabolomice unicelulárních řas §Methylom jednobuněčných řas. §Role fenylalanin amoniak lyázy při stresových reakcích rostlin. §Vliv nanočástic na metabolom a transkriptom jednobuněčných řas §Vliv nanočástic na metabolom a transkriptom vyšších rostlin §Biofertilizační účinky nanočástic strana 17 Laboratoř metabolomiky a epigenetiky rostlin strana 18 Základní informace o studiu §atraktivní vědecká témata §přístup k nejmodernějšímu vybavení, možnosti jeho využívání §práce v mladém kolektivu §participace na tvorbě vědeckých publikací §aktivní účast na národních i mezinárodních konferencích §podpora publikační, výzkumné i projektové činnosti §možnost zapojení v národních i mezinárodních projektech § Podpora studentů doktorských studijních programů Ústav chemie a biochemie – co nabízíme •Ústav chemie a biochemie – Co požadujeme §proaktivní přístup §časová adaptabilita §schopnost učit se novým věcem a postupům §schopnost práce v mezinárodním vědeckém kolektivu Ústav chemie a biochemie – co požadujeme strana 21 C:\Users\PC-Student03\Desktop\fotky_ÚCB\Spol_foto_pano.jpg Děkujeme za pozornost