Laboratoř výpočetní chemie | ivo.kabelka@gmail.com Ivo Kabelka ivo.kabelka@gmail.com Bacteriophage tail tube http://vacha.ceitec.cz Národní centrum pro výzkum biomolekul Laboratoř výpočetní chemie Laboratoř výpočetní chemie | ivo.kabelka@gmail.com Antimikrobiální rezistence Chen, L. (2017). Notes from the Field: Pan-Resistant New Delhi Metallo-BetaLactamase-Producing Klebsiella pneumoniae—Washoe County, Nevada, 2016. MMWR. Morbidity and Mortality Weekly Report, 66. http://technet.idnes.cz Antibiotic Resistance Threats in the United States, 2013 https://www.cdc.gov/drugresistance/threat-report-2013/ The Review on Antimicrobial Resistance https://amr-review.org Laboratoř výpočetní chemie | ivo.kabelka@gmail.com Antimikrobiální peptidy ● Součást imunitního systému ● Cíleně zabíjí bakterie ● Narušují funkci nebo celistvost buněčných membrán Nguyen, L. T., Haney, E. F., & Vogel, H. J. (2011). The expanding scope of antimicrobial peptide structures and their modes of action. Trends in biotechnology, 29(9), 464-472. Laboratoř výpočetní chemie | ivo.kabelka@gmail.com Průchod peptidu přes membránu Laboratoř výpočetní chemie | ivo.kabelka@gmail.com Endocytóza virové částice 21 3 4 5 6 Laboratoř výpočetní chemie | ivo.kabelka@gmail.com Inhibitory Monovalentní Multivalentní (Janus) Multivalentní Laboratoř výpočetní chemie | ivo.kabelka@gmail.com Národní centrum pro výzkum biomolekul Laboratoř výpočetní chemie A4 2.13 http://vacha.ceitec.cz Laboratoř výpočetní chemie | ivo.kabelka@gmail.com Efekt inhibitorů na endocytózu Laboratoř výpočetní chemie | ivo.kabelka@gmail.com Modely peptidů a lipidů All-atom model Zhrubené (coarse-grained) modely Laboratoř výpočetní chemie | ivo.kabelka@gmail.com Endocytóza virové částice Virová částice