Fylogeneze a diverzita živočichů 1. Bezobratlí (doc. Dipl.-Biol. Jiří Schlaghamerský, Ph.D.; doc. RNDr Jana Schenková, Ph.D.) 2. Strunatci (doc. Mgr. Tomáš Bartonička, Ph.D.) Osnova – pro část „bezobratlí“ 2018: 1) Úvod do zoologické systematiky; jednobuněčná Eukaryota (Amoebozoa, Rhizaria, Excavata, Chromalveolata) (19. 2.) 2) Porifera, Cnidaria, Ctenophora, Placozoa, Bryozoa = Ectoprocta, Rotifera, Acanthocephala (26. 2.) 3) Platyhelminthes, Annelida, Sipuncula, Nemertea (5. 3.) 4) Mollusca, Brachiozoa (12. 3.) 5) Nematoda, Nematomorpha, Tardigrada, Onychophora, Arthropoda: Chelicerata (19. 3.) 6) Arthropoda: Myriapoda, (Pan)Crustacea, Hexapoda (26. 3.) 7) Deuterostomia: Echinodermata, … (9. 4.) Doporučená literatura: Fylogeneze a diverzita živočichů Případně (seženete-li z druhé ruky): Edmund Sedlák: Zoologie bezobratlých (2002: 2. vydání), Masarykova univerzita (skripta) - především charakteristika jednotlivých kmenů a nižších taxonů; vyšší zařazení do systému je však zastaralé, resp. chybí). Základy biologie, ekologie a systému bezobratlých živočichů Jaroslav Smrž Karolinum 2015, brož., 194 str. ISBN 9788024622583 Fylogeneze živočišné říše Jan Zrzavý Scientia 2006, brož., 255 str. ISBN 8086960080, 9788086960081 Fylogeneze a diverzita živočichů Zakončení zkouškou: • Vzhledem k velkému počtu zapsaných studentů se bude v případě řádných i opravných termínů zpravidla jednat o písemnou zkoušku. • Předpokládáme tři termíny (1. řádný, 2. a 3. řádný a opravný) během zkouškového období. • Bude-li potřeba, bude vypsán další opravný termín v období prvních 13 dní výuky v následujícím (podzimním) semestru (viz SZŘ MU). • Jeho přesný termín bude možno stanovit a termín tudíž vypsat až poté, co bude známý rozvrh vyučujících tohoto předmětu a učeben s potřebnou kapacitou, tedy poměrně těsně před zahájením výuky. Podíl vyšších skupin organismů na celkovém počtu popsaných recentních druhů (cca 1,9 milionů) Fylogeneze a diverzita živočichů Střízlivý (!) odhad: + 6 milionů druhů (převážně hmyzu) Původcem prvního zachovalého „systému“ živočichů byl Aristoteles (384-322 př. n. l.) Τῶν περὶ τὰ ζῷα ἱστοριῶν (Ton peri ta zoia historion) Lat.: Historia animalium (obsažená klasifikace – roztřídění živočichů do různých skupin, historicky později jeden ze základů tzv. „scala naturae“) Fylogeneze a diverzita živočichů Biologická systematika σύστηµα – sýstema (starořecká výslovnost) – útvar, složenina συστηµατικός - systēmatikós - utříděné, seřazené • snaha třídit (klasifikovat, seskupovat) organismy podle podobnosti • později: snaha popsat fylogenetické (příbuzenské) vztahy mezi organismy Vědecké studium rozmanitosti životních forem (původu a organizace biologické diversity). Dnešní chápání pojmu systém: Systém je tvořen z jednotlivých částí, které jsou uspořádány tak, že tvoří jeden celek, který představuje víc než součet těchto částí. Základem dnešní zoologické systematiky je studium fylogeneze. Klasické hierarchické kategorie zoologického systému Regnum - říše Phylum - kmen Classis - třída Ordo - řád Familia - čeleď Genus - rod Species - druh Carl (von) Linné (Carolus Nilsson Linnaeus) (1707-1778) V 10. vydání 1. dílu knihy Systema Naturae z r. 1758 poprvé použil důsledně binominální nomenklaturu (rodové jméno a druhový přívlastek čili epithet) pro živočišné druhy. Pro rostliny ji použil již ve svém díle Species Plantarum (1753). Z hierarchických úrovní zavedl dále řád, třídu a říši, ostatní kategorie (viz výše) byly přidány později. Fylogeneze a diverzita živočichů Avšak když Linné zaváděl svůj systém přírody, vycházel z míry podobnosti organismů - o evoluci nevěděl! Taxonomie τάξις - taxis - řád, uspořádání νόµος - nomos – zákon, zvyk, věda/nauka • někdy užíváno jako synonymum pojmu systematika (biologická) • v užším významu metodika určování a pojmenování organismů, zahrnuje - klasifikaci (zde ve smyslu zařazení do systému) - nomenklatoriku (pravidla pojmenování) Fylogeneze a diverzita živočichů Biologická rozmanitost jako odraz evoluce: Fylogeneze druhů a jim nadřazených taxonů (příbuzenské vztahy mezi taxony!) Charles Darwin: „Vycházíme-li z této ideje, že přirozený systém bude – do té míry do které to bude možné – uspořádán genealogicky … tak chápeme pravidla, která musíme dodržovat při klasifikaci.“ Problém: nebyli jsme u toho! Problém: Konstantnost „systému“ jako orientační pomůcky oproti správnosti „systému“ z hlediska nových poznatků Charles Robert Darwin (1809-1882) Fylogeneze a diverzita živočichů Fylogeneze = vývoj taxonů (druhů, kmenů) v evolučním procesu (oproti tomu: ontogeneze = vývoj jedince od oplodnění vajíčka do dospělosti) ze starořeckého φυλογένεση - filojenesi φῦλον – filon = kmen, rod a γéνeση – jenesi = zrození, vznik „Monofyletický rodokmen organismů“ (Ernst Haeckel, 1866) Strana z notesů s poznámkami Ch. Darwina (Transmutation Notebooks) se znázorněným dendrogramem příbuzenských vztahů mezi taxony (1837). Fylogeneze a diverzita živočichů Ernst H. P. A. Haeckel (1834-1919) Problém: nejednotné pojetí jak tvořit systém a čemu má sloužit Různé taxonomické směry či systematické školy (myšlení): Fenetika: založena na podobnosti (vnější), původní přístup; v moderní podobě jako numerická taxonomie. Fylogenetická systematika (kladistika): snaží se o vytvoření „vskutku přirozeného“ systému, tedy takového, který bude pravdivě odrážet příbuznost taxonů; činí tak hodnocením znaků z hlediska jejich vzniku (společné odvozené znaky - synapomorfie); vychází z principu dichotomického dělení taxonů (bifurkace), neuznává anagenezi ve smyslu přerodu jednoho druhu v jiný, aniž by došlo k rozštěpení na druhy dva. Dnes převažující přístup. Evoluční taxonomie: kombinuje přístupy numerické a fylogenetické taxonomie; zdůrazňuje význam radiace oproti bifurkaci; uznává anagenezi ve smyslu změny jednoho druhu v jiný (aniž by došlo k rozštěpení na druhy dva); považuje výrazné změny v organizaci organismu za důvod pro vyčlenění do samostatného taxonu (takový taxon nazývá grád – angl. grade). Emil Hans Willi Hennig (1913-1976) zakladatel fylogenetické systematiky Fylogeneze a diverzita živočichů Průběh fylogeneze Kladogeneze: historické štěpení evolučních linií, vznik nových druhů a zánik starých. Anageneze: časový průběh změn v rámci jednotlivých linií, vznik evolučních novinek – čili změny organismů pod tlakem přírodního výběru (i bazální taxon „A“ může mít více odvozených znaků, nemusí tedy být primitivnější než např. taxon „B“ (fylogenetická systematika však samotnou anagenezi bez štěpení neuznává za příčinu vzniku nového druhu). kladogeneze anageneze - autapomorfie (evoluční novinka, odvozený znak) Fylogeneze a diverzita živočichů Základní pojmy (nejen) fylogenetické systematiky: Taxon: jednotka na různých úrovních systému organismů (představuje skupinu reálných organismů) • Monofyletický taxon (monofylum, angl. clade = klád, ze starořeckého κλάδος, klados = větev): Skupina druhů, které mají předka společného právě jen jim; obsahuje tohoto předka (výchozí druh) a všechny jeho potomky (druhy z něho vzešlé). Založen na synapomorfiích (společných znacích, které získal jejich společný předek, u něj se nazývají autapomorfie). (Ve stejném smyslu je zastánci evoluční systematiky používán pojem holofyletický taxon a to s argumentem, že monofyletické jsou všechny organismy se společným předkem.) • Parafyletický taxon (parafylum): Skupina druhů, která neobsahuje všechny potomky společného předka. Založen na symplesiomorfiích (příslušníci této skupiny mají jeden či vícero znaků, které měl jejich společný předek a které nezahrnutému potomkovi tohoto předka chybí). • Polyfyletický taxon (polyfylum): Skupina druhů, které nemají předka, který by byl společný právě jen jim. Založen na konvergentních znacích (chyběly společnému předkovi, vyvinuly se nezávisle). D EA B C monofylum autapomorfie synapomorfie Fylogenetická systematika uznává pouze monofyletické taxony! Monofyletický taxon (monofylum): Skupina druhů, které mají předka společného právě jen jim; obsahuje tohoto předka (výchozí druh) a všechny druhy z něho vzešlé. Založen na synapomorfiích, tzn. společných znacích, které získal jejich společný předek (jedná se o tzv. odvozené znaky); u něj se každá taková „evoluční novinka“ nazývá autapomorfie. Základní pojmy (nejen) fylogenetické systematiky: společný předek druhů A, B a C (zanikl vznikem druhu C a společného předka druhů A a B) D EA B C parafylum autapomorfie (zde redukce plesiomorfního znaku) autapomorfie (zde redukce plesiomorfního znaku) plesiomorfie Fylogenetická systematika uznává pouze monofyletické taxony! Parafyletický taxon (parafylum): Skupina druhů, která neobsahuje všechny potomky společného předka. Založen na symplesiomorfiích: Příslušníci této skupiny mají (aspoň jeden) znak, který měl jejich společný předek a který nezahrnutému potomkovi chybí. Základní pojmy (nejen) fylogenetické systematiky: autapomorfie (nerozpoznaná) symplesiomorfie D EA B C polyfylum konvergence Fylogenetická systematika uznává pouze monofyletické taxony! Základní pojmy (nejen) fylogenetické systematiky: Polyfyletický taxon (polyfylum): Skupina druhů, které nemají předka, který by byl společný právě jen jim. Založen na konvergentních znacích (tyto znaky chyběly společnému předkovi, vyvinuly se nezávisle). Rozpoznat, který znak je homologický a který konvergentní nemusí být vůbec jednoduché! autapomorfie (taxonu D) autapomorfie (taxonu C) D EA B C D EA B C D EA B C Monofylum Parafylum Polyfylum autapomorfie synapomorfie autapomorfieautapomorfie (redukce) plesiomorfie konvergence Fylogenetická systematika uznává pouze monofyletické taxony! autapomorfie (nerozpoznaná) symplesiomorfie Pokud je v rámci fylogenetického systému vědomě užíván taxon, který je (pravděpodobně) polyfyletický či parafyletický, zpravidla se jeho jméno uvádí v uvozovkách. Pro větší názornost příklad ze systému obratlovců: Pokud do plazů (Reptilia) nezahrneme i ptáky (Aves), jedná se o parafyletický taxon a z pohledu fylogenetické systematiky by se tedy vůbec neměl používat. Ptáci jsou sesterskou skupinou krokodýlů (Crocodylia), společně tvoří taxon Archosauria. Snaha vytvořit taxon teplokrevných obratlovců (ptáků a savců – Mammalia) by vedla k vytvoření polyfyletického taxonu, který by již vůbec neodpovídal průběhu fylogeneze. Fylogeneze a diverzita živočichů Velký počet hierarchických úrovní vede k tomu, že se fylogenetická systematika (kladistika) vyhýbá (či přímo odmítá) užívání tradičních (linnéovských) hierarchických úrovní systému pro taxony nadřazené rodu (ten vyžaduje mezinárodní kód zoologické nomenklatury). Není totiž jasné, které úrovně přiřadit kategoriím jako jsou třídá, řád či kmen; vzájemná pozice různých skupin (vývojových větví = „kládů“) je při použití tradičních úrovní nesouměrná a do značné míry libovolná. D EA B C taxon hierarchické úrovně 2 taxon hierarchické úrovně 3 taxon hierarchické úrovně 4 taxony hierarchické úrovně 1 Fylogeneze a diverzita živočichů