C0-HD-TOP.png C0-HD-BTM.png
MANUÁLNÍ ANOTACE MAKROMOLEKULÁRNÍCH KOMPLEXŮ
EMBL-EBI
Daniel Pokorný

C0-HD-TOP.png
CO?
•protein-protein
•protein-DNA(RNA)
•protein-malá molekula

C0-HD-TOP.png
ODKUD?
•PDBe
•Odborná literatura
•Experimentální data: IntAct, MINT

C0-HD-TOP.png
PROČ?
•Integrace izolovaných dat na jedno místo
•Zvýraznění důležitých vlastností komplexu
•Propojení s ostatními bioinf. databázemi (UniProt, InterPRO, IntEnz, Reactome, etc.)
Zpřístupnění (nejen) strukturně-biologických dat širšímu okruhu uživatelů

C0-HD-TOP.png
JAK?
•Čtení, čtení, čtení, čtení, čtení
•Dvojstupňová kontrola – snížení možnosti lidské chyby

C0-HD-TOP.png
•Research units:
•Cell biology and biophysics
•Developmental biology
•Genome biology
•Structural and computational biology
•Sites:
•Grenoble (FR)
•Heidelberg, Hamburg (DE)
•Monterotondo (IT)
•Hinxton (UK)
•Barcelona (ES)

C0-HD-TOP.png
•European Bioinformatics Institute
•Wellcome Trust Genome Campus

C0-HD-TOP.png



C0-HD-TOP.png



C0-HD-TOP.png
•


C0-HD-TOP.png
JAK NA TO