NMR Strukturní analýza – seminář
Zápočtová písemka 2018
1A. K určení přesné koncentrace studované látky před titračním experimentem pomocí NMR se
používá přídavek standardní látky. Popište, jak se určuje přesné množství sloučeniny v NMR
vzorku. Jaký musí být relaxační čas při takovém měření?
2A. K uvedeným obrázkům 1
H-15
N HSQC titračního experimentu doplňte popis “pomalá, střední a
rychlá výměna”. Odhadněte rychlostní konstantu středně rychlé výměny, je-li pracovní frekvence
použitého přístroje ω(1
H)=600MHz.
3A. Pro snažší interpretace NOESY experimentů se u systémů protein(izotopicky označený)-ligand
používají 15
N/13
C editované verze. Vysvětlete rozdíl mezi H-X-filtrovaným a H-X-editovaným
experimentem. Jak taková úprava může napomoci k analýze NOE dat?
Na obrázku je ukázka čistícího elementu používaného v H-X-filtrovaném NOESY pulzní frekvenci.
Pomocí vektorového modelu znázorněte vývoj 1
H magnetizace pro 1
H-14
N a 1
H-15
H pár. PFG
označuje z-gradient. Určete hodnotu J-interakční konstanty, pro kterou byla sekvence
optimalizována.
4A. Vysvětlete pojem T1 relaxace, jak je ovlivněn velikostí molekuly? Jaký je nejvhodnější směr
přenosu polarizace během editovaného/filtrovaného-NOESY experimentu v komplexu protein malý
ligand pro slabě vázaný systém a proč.
1B. Při studiu reakčního mechanismu konjugované adice aldehydu na nitrostyren byl pomocí NMR
identifikován intermediát 5a, který je v rovnováze se strukturou 6. Přiřaďte v EXSY spektru signály
1’, 3’ a 4’ z 5a a 6. Jaký je princip pulzní sekvence EXSY. Proč 5b derivát EXSY krospíky
neposkytuje?
2B. Z grafu časové změny intenzit NMR signálů určete přibližně termodynamický a kinetický
poměr mezi syn a anti produktem adice. Co způsobuje pozorovanou konverzi? Na jaké veličině
obecně závisí kinetická specificita reakce?
3B Reakční vzorek intermediátu na obrázku byl popsán sérií NMR
spekter naměřených při různé teplotě. Proč jsou ve spektru
pozorovány duplicitní signály. Jaká je přibližně teplota
koalescence? Uveďte obecný vztah pro výpočet aktivační energie.