VYBRANÉ PROBLÉMY ELEKTROCHEMIE RNDr. Mgr. Iveta Třísková, Ph. D. 2 Elektroneutralita a iontová síla • Elektrostatické interakce iontů – vliv na stabilitu a prostorové uspořádání biologicky významných struktur • Elektrická vodivost roztoků • Změny koligativních vlastností (jejich velikost závisí na počtu částic v roztoku) – snížení bodu tuhnutí, zvýšení bodu varu nebo osmotického tlaku v důsledku snížení chemického potenciálu µ • Silné elektrolyty – úplná disociace na ionty; silné kyseliny a silné zásady • Slabé elektrolyty – částečná disociace • Analytická koncentrace elektrolytu = součet koncentrací všech jeho forem přítomných v roztoku • Pro dvojsytnou slabou kyselinu (H2A) platí: c = [H2A]+[HA-]+[A2 -] 2 21 r QQ F   3 Elektroneutralita a iontová síla  Podmínka elektroneutrality - základní vztah pro roztoky elektrolytů → kladné a záporné náboje se navzájem kompenzují • Iontová síla – „koncentrace“ náboje v roztoku, dána vztahem Př.: Jaká je iontová síla roztoku Al2(SO4)3 o c = 0,2 mol·dm-3 ? I = ½ (2·0,2·32+3·0,2·22) = 3 mol·dm-3 ci molární koncentrace iontů i s nábojem zi  i 2 ii zc 2 1 I   i ii 0zc ci molární koncentrace iontů i s nábojem zi 4 Aktivita elektrolytů • Odchylka od ideálního chování je způsobena elektrostatickými interakcemi mezi ionty roztoku, proto pro přesnější výpočty lépe uvažovat aktivitu iontů : • Střední aktivitní koeficient iii ca   v vv       ci je koncentrace iontů i; γi je aktivitní koeficient (nejčastěji molární nebo molální) Geometrický průměr aktivitního koeficientu aniontu a kationtu !!!!Musí platit podmínka elektroneutrality!!!! Aktivitní koeficient 5 Z klasické termodynamiky: Pro reálný roztok kationtu M+ a aniontu X- při téže molalitě platí: Gm = µ++µ- = µ+ ideal+ µideal+RTlnγ++RTlnγ-= Gm ideal+RTlnγ+ γγ± = (γ+ γ-)1/2 Střední aktivitní koeficient Obecně pro sloučeniny MpXq platí: Gm = pµ++qµ- = Gm ideal+pRTlnγ+ + qRTlnγγ± = (γp + γq -)1/s s = p+q Definice středního aktivitního koeficientu 6 Debye-Hűckelova teorie iontových roztoků Podkladem D. – H. teorie je tendence aniontů shromažďovat se kolem kationtů a naopak (jeden takový lokální shluk je znázorněn kruhem). Ionty jsou v neustálém pohybu. 1923 – Peter Debye a Erich Hückel Iontová atmosféra 2/1 AIzzlog   Pro velmi nízké koncentrace: Debye – Hückelův limitní zákon kde A = 0,509 pro vodné roztoky při 25 °C a I je bezrozměrná iontová síla roztoku Debye-Hűckelova teorie iontových roztoků 7   i i 2 i b/bz 2 1 I ѳ definice iontové síly Pro velmi vysoké koncentrace lze aktivitní koeficient odhadnout z rozšířeného Debye – Hückelova zákona:              CI BI1 IzzA log 2/1 2/1  Rozšířený Debye-Hückelův zákon Kde B a C jsou bezrozměrné konstanty a lze je považovat za nastavitelný empirický parametr Solvatace v roztocích elektrolytů 8 A Rozpouštění iontových sloučenin - pochod, při kterém jsou pozitivně a negativně nabité ionty, vyskytující se v mřížce od sebe vzájemně oddalovány v důsledku silného elektrostatického přitahování s dipóly vody – vznik hydratovaných iontů Hydratace i jako chemická reakce mezi iontem a vodou vedoucí ke vzniku koordinační sloučeniny Při hydrataci iontů jsou v hydratační sféře předpokládány tři oblasti: 1) Vnitřní vrstva – molekuly vody jsou vzájemně pevně orientovány na povrchu iontu (jejich struktura je uspořádanější než v samotné vodě) 2) Další vrstva – ion ruší vodíkové vazby mezi molekulami vody – porušení struktury 3) Vnější vrstva – struktura „vázané“ vody přechází na strukturu „volné“ vody Water dissolves many crystalline salts by hydrating their component ions. The NaCl crystal lattice is disrupted as water molecules cluster about the Cl and Na ions. The ionic charges are partially neutralized, and the electrostatic attractions necessary for lattice formation are weakened 2 21 r QQ F   Síla iontových interakcí Solvatace v roztocích elektrolytů 9 Rozdílná působnost iontů v hydratačních vrstvách •Ionty Li+, Na+, H3O+, Ca2+, Mg2+, OH-, F- - uplatňují se v první vrstvě a působí ve smyslu zpevnění struktury vody •Ionty K+, NH4 +, Cs+, Br-, I-, IO3 - - uplatňují se především ve druhé vrstvě a působí ve smyslu rušení struktury vody B Rozpouštění nenabitých polárních molekul (anorganické i organické sloučeniny) tvorba vodíkových můstků s polárními funkčními skupinami (hydroxylové skupiny cukrů a alkoholů, karboxylové skupiny aldehydů a ketonů…) C Sloučeniny obsahující pouze nepolární hydrofobní skupiny se ve vodě nerozpouštějí D Amfipatické látky – obsahují v molekule polární (hydrofilní) i nepolární (hydrofobní) skupiny. Př.: mastné kyseliny a polární lipidy  Tvorba micel Voda jako rozpouštědlo D Amfipatické látky – bílkoviny a nukleové kyseliny Bílkoviny: důležitá role (polárních) nabitých skupin –COO-, NH3 + imidazolium při vazbě vody na bílkovinu Nukleové kyseliny: fosfátové skupiny jsou primárním místem hydratace 10 Hydratace bílkovin • Na povrchu molekuly bílkovin v bezprostředním kontaktu s rozpouštědlem jsou a) nabité funkční skupiny; b) nenabité struktury→ různé části povrchu biopolymeru jsou solvatovány/ hydratovány odlišným způsobem • Hydratační obal bílkovin – existuje vždy; část této vody vázána mimořádně pevně – nelze ji odstranit bez nevratné destrukce nativní struktury bílkoviny; další podíl vody vázán méně pevně; všechna vázaná voda má však charakteristiky, kterými se liší od čistého rozpouštědla – dvojrozměrná síť molekul vody propojených vodíkovými vazbami, která obepíná molekulu bílkoviny a začleňuje do sebe i klastry vody v některých oblastech. Vodíkové vazby v síti jsou pevnější a mají delší dobu života než tyto vazby ve vzdálenějším okolí • Hydratační obal je klíčový pro biologickou funkci bílkovin (konformační flexibilita) • Voda v krystalech bílkovin – 30 až 50% hmotnosti krystalu; nezbytná pro udržení struktury; chová se jako kapalná → difuze malých molekul do dutin krystalů bílkovin 11 Vsolování a vysolování bílkovin 12 • Rozpustnost bílkovin ve vodě lze ovlivnit přídavkem rozpustné soli • Závislost rozpustnosti bílkovin na koncentraci přídavné soli prochází maximem • Vsolování – první vzestupná větev, kdy se bílkovina více rozpouští • Vysolování - když křivka dosáhne maxima, začíná s dalšími přídavky soli rozpustnost bílkoviny klesat a při vysoké koncentraci soli → bílkovina z roztoku vypadne; používá se pro frakcionaci lidského séra, isolaci bílkovin I rozpustnost vsolování vysolování Vsolování a vysolování bílkovin 13 • Na začátku bílkovina v čisté vodě → navázání iontů přidávané soli → změna náboje molekuly bílkoviny a změna hydratačního obalu → hydrofilisace molekuly bílkoviny → roste rozpustnost až do té doby, než je v roztoku tak velké množství volné soli, že začíná kompetice mezi jejími ionty a bílkovinou o molekuly vody pro hydratační obal → částečná ztráta hydratačního obalu ve prospěch anorganických iontů, zesílení interakcí bílkovina – bílkovina → precipitace (vysolení bílkoviny) Vsolování - - - - - + + + + + H2O H2O H2O H2O H2O H2O H2O Vysolování Vsolování a vysolování bílkovin 14 • Vsolování – náboj bílkoviny z+ kompensován anionty X-; v roztoku se ustavuje rovnováha PXz↔Pz+ + zX-; • termodynamická rovnovážná konstanta: • Součin rozpustnosti: Sbílk = apz+(ax-)z • Vysolování – lze použít semiempirický vztah: log cs = logcs 0 – KsI • Franz Hofmeister (konec 19.stol.) – sestavení řady aniontů a kationtů dle jejich vysolovacího účinku: • Anionty se stejným kationtem: SO4 2- > F- > IO3 - > NO2 - > Br- > NO3 - > I- > CNS• Kationty se stejným aniontem: Li+ > Na+ > K+ > NH4 + > Rb+ > Cs+ • Vysolovací účinek soli závisí více na aniontu než kationtu • Pro vysolování bílkovin: Na2SO4 > (NH4)2SO4 > NaCl > CaCl2 • Nejběžnější vysolovací činidlo pro srážení bílkovin →síran amonný zpx z xpz r a )a(a K   15 Kyselost roztoků • Druhá pol. 19. stol. →kyselost roztoků způsobena hydroxoniovými ionty H3O+; jejich koncentrace souvisí s autoprotolýzou vody dle rovnice: • Rovnovážná konstanta autoprotolýzy: • Iontový součin vody Kw: Kw =[H3O+][OH-]= 1,008·10-14 mol2·dm-6 • V neutrálním roztoku: [H3O+] = [OH-] = 1,004·10-7 mol ·dm-3 • pH (Sørensenův vodíkový exponent): -log [H+]   OHOHOH2 32   O2H 2 OHO3H aO2H a aa K       7 OH 10.1KOHH 2   16 Měření pH kde pH2 je parciální tlak plynného vodíku ve vodíkové elektrodě, pro níž je Ev 0 = 0 V dle definice •Pro vysvětlení podstaty techniky měření pH je vhodné vycházet z klasického způsobu měření, kdy se používá článek složený z vodíkové jako indikační a kalomelové jako referenční elektrody •Pt|H2(g)|roztok X|KCl(nas)|Hg2Cl2(s)|Hg(l)|Pt •Reakce: ½ H2(g)+ ½ Hg2Cl2(s)↔Hg(l)+H+(aq, X)+Cl-(aq) •Elektrodové potenciály: 2 O3H 23v pH a ln F RT )H/OH(EE    Vodíková elektroda  Cl 0 k22k aln F RT E)Hg/ClHg(EE Kalomelová elektroda Měření pH 17 •Elektromotorické napětí Ex = Epravá - Elevá Nutno zvýšit o kapalinový potenciál ΦL,X na rozhraní roztok X a nasycený KCl; ustavuje se na každém rozhraní, kde se stýkají dva roztoky              2HClxO3H k 0 X,Lx pln 2 1 alnaln F RT EE               2HClSO3H k 0 S,LS pln 2 1 alnaln F RT EE  Odečteme rovnice              SO3HXO3HS,LX,LSX )aln(aln F RT EE  Přirozené logaritmy převedeme na dekadické a po dalších úpravách   RT303,2 EE )S(pH)X(pH SX   Základ měření pH 18   RT303,2 EE )S(pH)X(pH SX   Standardní roztok, má jednoznačně přiřazenou jistou hodnotu pH; nejčastěji pufry Praktická škála pH 19 Skleněná elektroda • Iontově selektivní elektroda s membránou ze speciálního druhu skla • Vnitřním elektrolyt: octanový nebo fosforečnanový pufr s přídavkem chloridu • Referentní elektroda: argentchloridová nebo kalomelová elektroda ponořená do vnitřního roztoku elektrolytu • Základní fce skleněné elektrody: výměnná reakce iontů mezi sklem a roztokem, jehož pH je měřené (na základě této reakce se na povrchu elektrody ustavuje Donnanův potenciál – potenciálový rozdíl mezi povrchem membrány a okolním roztokem). • Membránový potenciál: rozdíl Donnanových potenciálů na vnější a vnitřní straně skleněné membrány 20 Skleněná elektroda           j jz/iz jjii i )ak(aln Fz RT KE Nicolsky-Eisenmanova rovnice • Alkalická (pozitivní) chyba skleněné elektrody - pH > 10, způsobena rušivým účinkem sodných iontů •Kyselá (negativní) chyba skleněné elektrody – pH = 1 a nižší, nasycení protony v povrchu skleněné membrány→ elektroda přestane být k dalšímu snižování pH citlivá •Nernstovská odezva elektrody je rovna 59,12 mV (t = 25 °C) K … standardní potenciál ISE [V] zi … nábojové číslo sledovaného iontu i ai … aktivita sledovaného iontu i v měřeném roztoku R … molární plynová konstanta (8,314 J·K-1·mol-1) T … termodynamická teplota [K] F … Faradayova konstanta (96 485,33 C·mol-1) zj … nábojové číslo interferujícího iontu j aj … aktivita interferujícího iontu j kij … konstanta selektivity (vyjadřuje velikost vlivu interferujícího iontu na potenciál elektrody) 21 Měření pH - přístroje • Potenciálový rozdíl je odváděn vnitřní elektrodou (Ag/AgCl) a měří se proti referenční argentchloridové nebo kalomelové elektrodě • Potenciometr s vysokým vstupním odporem a digitální indikací; škála v jednotkách mV nebo pH • pH metry se skleněnou elektrodou – standardizace na dva základní roztoky pufrů o pH 4 a 7 pH metr CyberScan 5500 22 Závislost pH na teplotě Elektrolyty typu 1-1; jejich molalita je vyšší než 10-6 mol·kg-1  Silné kyseliny a zásady – závislost paH (zde záporný logaritmus aktivity H3O+ iontů) na teplotě se omezuje na teplotní závislost aktivitního koeficientu γ  paH silných kyselin s teplotou mírně roste  paH silných zásad s teplotou výrazně klesá m,pm,p H T log T pa                 m,pp w m,p H T log T Klog T pa                         velmi malá hodnota Při 25 °C je rovno -0,033 23 Závislost pH na teplotě • Pufry • Rozhodující vliv na průběh pH pufru s teplotou má teplotní závislost disociační konstanty slabého elektrolytu → závislosti paH na teplotě mají stejný tvar jako závislost pK na teplotě • S rostoucí teplotou pH kyselých pufrů roste, zásaditých klesá Teplotní závislost pH acetátového pufru tvořeného 0,05 M kyselinou octovou a 0,05 M octanem sodným (25 C, pH 4,65) 24 Obecná teorie kyselin a zásad • Arrheniova teorie (1889)  Kyselina – sloučenina odštěpující kation H+  Zásada – sloučenina odštěpující anion OH• Brønstedova teorie (1923) – Obecná teorie kyselin a zásad• kyselé nebo zásadité vlastnosti sloučeniny se projevují po její reakci s rozpouštědlem  Kyselina – látka schopná odštěpovat proton  Zásada – látka vázající proton • V roztoku musí být přítomni současně oba partneři - konjugované páry • Lewisova teorie – velký význam pro výklad mechanismu organických reakcí  Kyselina – akceptor elektronového páru  Zásada – donor elektronového páru 25 Disociace slabých kyselin a zásad • Slabá jednosytná kyselina HA: HA ↔H+ + A Disociační konstanta:  Stupeň disociace: • Slabá zásada BOH: BOH ↔B+ + OH          1 c HA AH K 2 A          AHA A  )clogpK( 2 1 pH A  )clogpK( 2 1 14pH B  c je celková koncentrace kyseliny; α je stupeň disociace 26 Pufry pH se nemění pH pufru 27 Pufry A - vztah pH a složení roztoku pro kyselý a basický pufr, které vycházejí ze slabých elektrolytů s hodnotami pKA = 4 (křivka 1) a pKB = 4 (křivka 2). Koncentrace obou pufrů je 0.1 M. Na svislé ose je vynesena koncentrace c silné zásady přidané k slabé kyselině, resp. silné kyseliny přidané k slabé basi. Maximum pufrační kapacity je pro oba pufry označeno čárkovaně; pro kyselý je to pH odpovídající číselně pKA; pro basický odpovídající hodnotě (14-pKB). B – závislost pufrační kapacity na pH pro kyselý pufr znázorněný na panelu A křivkou 1 Pufr má maximální pufrační kapacitu, když je jeho pH rovno pKA použité slabé kyseliny 28 Amfolyty • Sloučeniny schopné vystupovat jako kyseliny nebo jako zásady • Dle klasické Arrheniovy teorie: HXOH ↔H+ + XOHHXOH ↔HX+ + OH Reakce amfolytu s vodou: HXOH + H2O↔H3O+ + XOHHXOH +H2O↔ H2XOH+ + OH Tyto úvahy platí pro neutrální molekuly; v biologických soustavách jsou typické amfolyty aminokyseliny  Vnitřní ionizace aminokyselin: NH2RCOOH ↔NH3 +RCOO- HXOH XOHOH A c cc K 3   HXOH OHXOHH B c cc K 2   29 Amfolyty • Protolytické rovnováhy aminokyselin: NH3 +RCOO- + H2O ↔ H3O+ + NH2RCOO- , [K1] NH3 +RCOO- + H2O ↔ NH3 +RCOOH + OH- [K2] • K1 – schopnost aminoskupiny NH3 + odštěpovat proton; míra kyselosti této skupiny • K2 – míra bazicity karboxylátového aniontu  Pro vyjádření bazicity aminoskupiny a kyselosti karboxylu platí rovnováhy: NH2RCOO- + H2O ↔ NH3 +RCOOH + OH- [K3] NH3 +RCOO- + H2O ↔ H3O+ + NH3 +RCOO- [K4] • Hodnoty bazických konstant lze získat pomocí iontového součinu vody ze vztahů: Kw = K1K3 = K2K4; tedy pK3 = 14 – pK1 apK2 = 14 - pK4 30 Amfolyty • Isoelektrický bod – charakteristický parametr, významný hlavně u aminokyselin (AMK) a bílkovin; je to takové pH při němž daná sloučenina neputuje v elektrickém poli; u AMK splněna podmínka: • S využitím K1 a K4 (viz. slide 30) získáme: • Hodnotu isoelektrického pH lze vypočíst:   RCOONHRCOOHNH 23 cc RCOOHNHRCOOHNH RCOONHRCOONH 3 2 41 33 22 c c OHaKK       )pKpK( 2 1 )alog(pI 41 2 OH3   31 Aminokyseliny jako pufry • Titrační křivka Titrační křivka histidindihydrochloridu (–) a jeho pufrační kapacita (-----) Disociace neutrální α-karboxylové skupiny Disociace imidazolové a αaminové skupiny 32 pH tělních tekutin • Nekontrolované hromadění metabolických produktů organismu → pokles pH extracelulární tekutiny → narušení až znemožnění životních dějů • „Fyziologické pH“ (pH 7,4) – pH krevní plazmy • Pufrovací (nárazníkové) systémy – umožňují čelit výchylkám pH mimo referenční interval (7,36 – 7,44) • Acidémie – pokles pod dolní mez • Alkalémie – vzestup nad horní hranici referenčního rozmezí 33 Krevní pufry • A) Fosfátový (HPO4 2-/ H2PO4 -) – podílí se na udržování intracelulární hodnoty pH; fosfáty jsou hlavní pufrační systém moči, v krevní plazmě pouze 1% pufrační kapacity (v krvi dominuje hydrogenuhličitanový systém) • B) Hydrogenuhličitanový (HCO3 -/H2CO3 -) – klíčový pro udržování pH krevní plazmy • H2CO3 ↔H++HCO3 - (pK1 = 3,8 při 37 C), daleko od fyziologického pH – nedostatečná pufrační kapacita • Otevřený pufrační systém – prostřednictvím CO2 komunikuje s okolím    32 3 COH HCO log8,34,7pH   3981 cH2CO3 = 5·10-6 mol·dm-3 cHCO3 - = 20·10-3 mol·dm-3 34 Krevní pufry CO2(rozp.)+H2O Kr H2CO3 H2CO3 KA H++HCO3    .)rozp(CO COH K 2 32 r  [H2CO3] = Kr[CO2(rozp.)]     32 3 A COH HCOH K       .)rozp(COK HCOH K 2r 3 A       .)rozp(CO HCOH KK 2 3 rA   = Kcelk pKcelk = 6,31 Plynný CO2 doplňuje ztráty H2CO3 v důsledku její disociace, a tím udržuje pH krve CO2(g)↔CO2(rozp.) cCO2(rozp) = 1,6·10-3 mol·dm-3 Koncentrace HCO3 - v krevní plazmě = 20·10-3mol·dm-3 a pH 7,4 35 Krevní pufry C) Bílkovinné pufrující systémy Bohrův efekt – v plicích uvolňuje HbO2 ionty H+, a tím porušuje rovnováhu mezi rozpuštěným HCO3 - a CO2 ve prospěch vzniku CO2, jenž je vydechován; v tkáních se naopak hemoglobin stává po uvolnění kyslíku akceptorem protonů a pufruje kyselinu uhličitou vznikající metabolickými procesy Hemoglobin H2CO3 H++HCO3 HbO2 + H+ (Hb)H+ + O2 36 Hondoty pH některých tělních tekutin dospělého člověka Tělní tekutina pH Tělní tekutina pH Krevní plasma 7,34-7,43 Střevní šťáva 6,1-7,3 Lymfa 7,2-7,6 Slzy 7,35 Moč 4,8-7,5 Pot 3,8-6,8 Sliny 5,8-7,1 Sperma 6,9-7,4 Žaludeční šťáva ≈ 2,0 Mateřské mléko 6,6-7,0 Duodenální šťáva 7,5-8,8 Cytoplasma jaterních buněk 6,4-6,5 Žluč 6,2-8,5 Cytoplazma centrálního nervstva 6,7-6,9 37 Metody studia proteolytických rovnovah v roztoku 38 Potenciometrie • Elektrochemická metoda – měří se rovnovážné napětí E galvanického článku • Skleněná elektroda – měrná elektroda • Argentchloridová a kalomelová elektroda – referenční elektrody • Nernstova rovnice: ox red0 ox/red a a ln nF RT EE  39 Přímá potenciometrie  Využívá se ke stanovení obsahu sloučenin, kde máme k dispozici příslušné indikační elektrody  Srovnání napětí měrného článku ve vzorku s napětím téhož článku, ponořeného do standardního roztoku analytu 40 Potenciometrická titrace • Nepřímá potenciometrie • Sledování závislosti napětí článku na objemu přidávaného titračního činidla • Acidobazické titrace – skleněná elektroda • Srážecí titrace – stříbrná elektroda, ISE • Komplexometrické titrace – ISE • Redoxní titrace – platinová redoxní elektroda • Grafické vyjádření: titrační křivka esovitého tvaru • Určení bodu ekvivalence: a) druhá derivace titrační křivky • b) Granova transformace • c) Samsonkova metoda 41 Potenciometrická titrace • Potenciometrická titrační křivka Titrace 0,1M HCl 0,1M NaOH -400 -300 -200 -100 0 100 200 300 0 2 4 6 8 10 12 V [ml] E[mV] 42 Granova transformace • Titrace silné kyseliny silnou bazí • Podmínka ekvivalence: 0 0,1 0,2 0,3 0,4 0,5 0,6 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 V [ml] F 0oBe cVcV    VV cV VV cV H 0 B 0 00       43 Granova transformace • Granova funkce před bodem ekvivalence • Pro linearizaci části titrační křivky před bodem ekvivalence lze použít transformaci:   VV )VV(c H o eB    )VV(c)VV(10 eBo pH  pH o1 10)VV(F   F1 F1 44 Granova transformace • Granova funkce za bodem ekvivalence   VV )VV(c OH o eB    )VV(c)VV(10 eBo )14pH(  • Pro linearizaci části titrační křivky za bodem ekvivalence lze použít transformaci: )14pH( o2 10)VV(F   F2 45 Aplikace potenciometrické titrace • Studium protonačních rovnovah NK a jeho složek (purinové a pyrimidinové báze) a derivátů purinů (cytokininy) ve vodných i směsných roztocích (% (v/v)CH3OH – H2O) a stanovení disociační konstanty pKa s využitím stupně ztitrování z  Závislost disociační konstanty na teplotě umožňuje stanovit termodynamické parametry ΔH a ΔS  Lze stanovit i konstanty stability komplexů β uvedených ligandů s biogenními dvojmocnými kovy Cu2+, Zn2+            z1 z logHlogpKa1            z z1 logHlogpKa2  MK K´K    K - zdánlivá protonační konstanta (ligand + kov) K – protonační konstanta ligandu [M] – koncentrace kovu 46 Aplikace potenciometrické titrace • Purinové báze: adenin a guanin • Pyrimidinové báze: cytosin, thymin, uracil N NH NH N NH2 O adenin guanin N NH NH2 O NH NH O O CH3 NH NH O O cytosin thymin uracil 5 4 6 N 3 N 1 2 NH 9 8 N 7 NH2 47 Potenciometrická titrace - instrumentace • Automatický titrátor Titrando 835, Metrohm • Různé objemy byret (1 - 20 ml) • Možnost titrace ve vodných i vodně- alkoholických prostředích • Software Tiamo 1.2 • Možnost vytvoření vlastní titrační metody (MET U – monotonic endpoint titrations) • Možnost nastavení vlastního titračního módu vybrané metody (OPTIMAL) • Volitelný přídavek titračního činidla • LL Ecotrode plus • Inertní argonová atmosféra; temperace 48 byreta nádoba s odměrným roztokem kapilárka přívod argonu LL Ecotrode plus hlava byrety magnetická míchačka temperovaná nádobkaAutomatický titrátor Polarografie •1922 – Jaroslav Heyrovský •Elektrolýza elektroaktivní látky v roztoku základního elektrolytu •Potenciál se vkládá mezi pracovní (Hg) a referenční elektrodu (Ag/AgCl/3M KCl) •Polarografická vlna •Polarizace elektrody Polarografické (voltametrické) proudy Nabíjecí proud (Ic) • Důležitý při nabíjení elektrodové dvojvrstvy • Nefaradayický charakter Migrační proud • Spojený s transportem elektroaktivní látky k povrchu elektrody • Eliminován přídavkem nadbytku základního elektrolytu Difúzní proud (Id) • Pro reakce, kde je rychlost určujícím krokem (rate determining step; rds) difúze • 1934 – Dionýz Ilkovič x c zFAD dt dn zFId    cmkzFDI 6/13/22/1 D  Illkovičova rovnice Cyklická voltametrie a voltametrie s lineárně se měnicím potenciálem • Elektrolýza elektroaktivní látky v nadbytku základního elektrolytu • Tří-elektrodové zapojení •dE/dt (rychlost polarizace) • Voltametrické signály mají tvar píku • Studium redoxních reakcí – mechanismus elektrodové reakce a reversibilita Cyklická voltametrie •Reversibilní procesy: Randles – Ševčíkova rovnice 2/10 ox 2/12/35 p vcADn1069,2I  kde Ip je proud píku(A); n počet elektronů; A efektivní plocha elektrody (cm2); D je difúzní koeficient (cm2/s); cox koncentrace elektroaktivní látky(mol/cm3) a v je rychlost polarizace (V/s). •Ireversibilní procesy: Delahayova rovnice   2/1v0 oxc2/1DA2/1 ann51099,2pI   kde α je koeficient přenosu náboje; na je počet přenesených elektronů v rychlost určujícím kroku(rds) 53 Eliminační voltametrická procedura (EVP) • Eliminační voltametrická procedura (EVP) – rozvíjela se současně s eliminační polarografií (EP), však ve srovnání s EP je EVP snadnější, rychlejší a lze ji aplikovat i na pevné elektrody • EVP – matematická procedura eliminující/zachovávající některý z dílčích voltametrických proudů (difúzní, nabíjecí, kinetický) z naměřených LSV nebo CV křivek • Eliminační funkce jako lineární kombinace celkových proudů měřených při různých rychlostech polarizace 54 2. podmínka    vWEYI jjj    k j jII 1 I = Id + Ik + Ic + ...… 1. podmínka 0 ν)E(YI kk  1 ν)E(YI cc  21 ν)E(YI dd Id …difúzní proud Ik …kinetický proud Ic …nabíjecí proud xx νconst.νY(E)I  -1.45 -1.35 -1.25 25 50 100 200 300 400 500 600 800 1000 f (I) = - 11,657 I1/2 + 17,485 I - 5,8284 I2 Ik + Ic = 0 Id ≠ 0EVP E4 Dvě základní podmínky EVP d ref c ref k ref vrefv I v v I v v I v v I 2110                            Adsorptivní přenosová rozpouštěcí voltametrie (AdTSV) DNA nebo RNA adsorpce FA pufr Oplach v MILI Q vodě pH 1.8, 5.8 nebo 12.8 ta = 120 s Voltametrická analýza v FA pufru; pH 5.8 55 Diferenční pulsní voltametrie doba kapky I1 I2 Potenciál,V čas, t Potenciál, VI2-I1,A ΔI = I2 – I1 Square-wave voltametrie •Ramaley a Krause PotenciálE Ei 0 Forward sample ΔEs ΔEp tp Backward sample Čas ΔI = If - Ib Itotal Iforward Ibackward 58 Přístrojové vybavení • Elektrochemické analyzátory:  AUTOLAB PGSTAT 20 (Eco Chemie, Utrecht, The Netherland)  μAUTOLAB TYPE III (Metrohm, Switzerland) • GPES Manager 4.9 • Visící rtuťová kapková elektroda (HMDE) • Polymerní pentelková grafitová elektroda (pPeGE) Elektrody • Visící rtuťová kapková elektroda (HMDE) •Grafitové elektrody „Basal plane“ pyrolytická grafitová elektroda Polymerní pentelková grafitová elektroda Elektrody z pyrolytického grafitu „Edge plane“ pyrolytická grafitová elektroda Vnitřní struktura EPPG a BPPG elektrod Elektrody z uhlíkových vláken Elektrody ze skelného uhlíku • Grafitové elektrody Uhlíkové pastové elektrody Borem dopované diamantové elektrody • Tištěné elektrody Nukleové kyseliny Nukleové kyseliny a jejich složky N NH2 O R NNH N O O R CH3 N N N NH2 R N N N N O R NH NH2 3’5’ purine bases thymine (T) pyrimidine bases cytosine (C) adenine (A) guanine (G) DNA double helix base pairs sugar- phosphate backbone major groove minor groove Basepairs C•G T•A A B C D O O P-O O O baseCH2 2-deoxyribose phosphate nucleotide minor groove major groove 1953: James Watson, Francis Crick, Rosalind Franklin, Maurice Wilkins: DNA double helix 1962: Nobel prize (JW, FC, MW) Explanation of the basic principles of preservation, transmission and expression of genetic information 64 Vlásenky LOOP STEM A G A C G G C 5' 3' Tm DNA heptameru = 76 °C (0.1 M NaCl) Nejkratší a termodynamicky nejstabilnější vlásenka - DNA heptamer d(GCGAAGC) – replikční počátky fága ФX 174 and herpes simplex viru, promotorové oblasti heat – shock genů bakterie E. coli a rRNA genů 64 65 Vlásenky • Vlásenky jsou spojeny s rozvojem opakujících se tripletových sekvencí v DNA řetězci, které jsou spojeny s mnoha neurodegenerativními chorobami (syndrom fragilního chromozomu, Huntingtonova choroba, Friedriechova ataxie) Analýza vlásenek: d(GCGAAGC): UV, Tm (Hirao 1989, Yoshizawa 1994, 1997), NMR (Hirao 1994, Yoshizawa 1997, Padrta 2002, Sychrovský 2002), Ramanova spektroskopie (Chraibi 2000), elektroforéza (Hirao 1989, Yoshizawa 1994, 1997), CD (Hirao 1989), rtg analýza (Sunami 2004), molekulová dynamika (Nakamura 1999, Padrta 2002), elektrochemie (Trnková 2004) 65 66 G - kvadruplexy • Stabilizovány G - kvartety (4 molekuly guaninu vázané Hoogsteenovými vodíkovými vazbami) • Tvoří se především v přítomnosti Na+ a K+ iontů • Strukturní polymorfismus N N N N N O H H H R N N N N N O H H H R N N N N N O H H H R N N NN N O H H H R M+ N N N N N O H H H R N N N N N O H H H R N N N N N O H H H R N N NN N O H H H R M+ 66 a) Čtyřřetězcový tetraplex b) Dvouřetězcový intramolekulární tetraplex c) Jednořetězcový intramolekulární tetraplex 67 I - motivy • Hemiprotonizované C – C+ páry jako základní strukturní jednotka • Tvoří se v slabě kyselém nebo neutrálním pH • Diabetes mellitus a opakujícíc se tripletové sekvence spojené s mnoha neurodegenerativními chorobami • Strukturní polymorfismus N + N N O H H H R N N N O HH R C+ C N + N N O H H H R N N N O HH R C+ C 67 a) Dvouřetězcová struktura b) Čtyřřetězcová struktura c) Čtyřřetězcová struktura se značenými konci Před více než 55 lety, Emil Paleček: DNA polarografie (1960) Oscillopolarografie • Hg elektroda: redoxní procesy A,C a G bází • Uhlíkové elektrody: oxidace purinových a pyrimidinových bází • Cu elektroda: oxidace cukerných zbytků v NA Singhal, P.; Kuhr, W. G.: Anal. Chem. 1997, 69, 3552-3557; Anal. Chem. 1997, 69, 4828-4832. Nukleové kyseliny jsou elektroaktivní Elektrochemie NA a ODNs Paleček, E., Bartošík, M.: Electrochemistry of Nucleic Acids. Chem. Rew., 2012 d(GCGAAGC) DNA Elektrochemie purinu a purinových derivátů • Typické elektroaktivní látky • 1962 - Smith a Elving – první studie elektrochemické redukce purinu a adeninu pomocí polarografie a coulometrie na Hg elektrodě (DME). • Dvoukroková dvouelektronová redukce 71 N 1 2 6 N 3 5 4 8 N 7 N H 9 +2H+ + 2e- N N N N H H H H +2H+ + 2e- N N N N H H H H H H H purin 1,6 -dihydropurin 1,2,3,6 -tetrahydropurin N 1 2 6 N 3 5 4 8 N 7 N H 9 +2H+ + 2e- N N N N H H H H +2H+ + 2e- N N N N H H H H H H H purin 1,6 -dihydropurin 1,2,3,6 -tetrahydropurin Elektrochemická redukce adeninu 2,3 – dihydropurin (IV) N N NH2 N N H +2H+ + 2e- N N NH2 N N H H H +2H+ + 2e- N N H NH2 N N H H H H H -NH3 N N H N N H H H +2H+ + 2e- N N H N N H H H H H H H2ON N N N H H H H H OH H 6-aminopurin (I) 1,6 – dihydro – 6 – aminopurin (II) 1,2,3,6 – tetrahydro – 6 – aminopurin (III) 1,2,3,6 – tetrahydropurin (V)(VI) 2,3 – dihydropurin (IV) N N NH2 N N H +2H+ + 2e- N N NH2 N N H H H +2H+ + 2e- N N H NH2 N N H H H H H -NH3 N N H N N H H H +2H+ + 2e- N N H N N H H H H H H H2ON N N N H H H H H OH H 6-aminopurin (I) 1,6 – dihydro – 6 – aminopurin (II) 1,2,3,6 – tetrahydro – 6 – aminopurin (III) 1,2,3,6 – tetrahydropurin (V)(VI) •Smith a Elving (1962) •6 e- redukční proces je doprovázen deaminačním procesem (př. coulometrie) • Polarografická redukce je ukončena v bodě III (tvorba 1,2,3,6-tetrahydro-6- aminopurinu) •Problém redukce adeninu při pH> 6 Elektrochemická redukce guaninu guanine 7, 8 - dihydrogenguanine d(GCGAAGC) Cathodic part Anodic part N NH NH2 O +H+ -H+ N + NH NH2 O H +2e- -2e- NH NH NH2 O +H+ NH NH NH2 O H -NH3N NHO +H+ -H+ N + NHO H +e- -e- N NHO H +H+ +e- 1/2 N NHO H H N NH O H H N NHO H H H (I) (II) (III) (IV)(V) (IX) (VI) (VII) (VIII) N NH NH2 O +H+ -H+ N + NH NH2 O H +2e- -2e- NH NH NH2 O +H+ NH NH NH2 O H -NH3N NHO +H+ -H+ N + NHO H +e- -e- N NHO H +H+ +e- 1/2 N NHO H H N NH O H H N NHO H H H (I) (II) (III) (IV)(V) (IX) (VI) (VII) (VIII) Elektrochemická redukce cytosinu •Elving (1972) •Redukce je započatá rychlou protonizací cytosinu (I) v N-3 poloze na elektroaktivní formu (II). Dvouelektronová redukce N-3=C-4 následuje a tvoří se karbanion (III) •Redukce v polarografii a voltametrii je ukončena tvorbou 4-amino-3,4-dihydrogenpyrimidine-2-on (IV) •Jiné meziprodukty lze získat s využitím elektrolýzy nebo coulometrie -2.00 -1.80 -1.60 -1.40 -1.20 -1.00 -0.80 -0.60 -0.40 -0.20 0.00 -1500 -1400 -1300 -1200 -1100 -1000 I/mA E /mV pH 1.55 pH 1.84 pH 2.15 pH 2.72 pH 3.22 pH 4.24 pH 4.85 pH 5.61 pH 6.14 pH 7.2 Elektrochemická oxidace adeninu N N N N H NH2 +H2O -2H+ - 2e- N N H N N H NH2 O +H2O -2H+ - 2e- N N H NH N H NH2 O O N N H N N NH2 O O -2H+ - 2eadenin 2 – oxyadenin 2,8 – dioxyadenindiimin N N N N H NH2 +H2O -2H+ - 2e- N N H N N H NH2 O +H2O -2H+ - 2e- N N H NH N H NH2 O O N N H N N NH2 O O -2H+ - 2eadenin 2 – oxyadenin 2,8 – dioxyadenindiimin 0 10 20 30 40 50 60 700 800 900 1000 1100 1200 1300 I/µA E/mV 3,14 3,29 3,67 4,16 4,55 5,10 5,35 5,80 6,80 7,54 •Dryhurst, Compton •6e- and 6 H+ elektrodový proces 76 (V.Sharma, F. Jelen and L. Trnkova: Sensors, 2015, 15(1), 1564-1600) 77 The complex formation and its oxidation can be described by the following scheme: 1. Cu(II) + e- → Cu(I) (at a deposition potential of 0.15 V) 2. Cu(I) + purine → [Cu(I)-purine] (in the reaction layer on PeGE surface) 3. [Cu(I)-purine] → [Cu(I)-purine]ads (adsorption of the complex) 4. [Cu(I)-purine]ads – e- → [Cu(II)-purine]ads (oxidative stripping, peak OxCom) 5. [Cu(II)-purine]ads – e- → purineox + Cu(II) (oxidative stripping, peak Ox) Figure 6: Concentration dependence of 1-mXan in the solution with constant concentration of Cu(II) ions, cCu = 20 µM , reference scan rate 400 mV/s; phosphate-acetatebuffer pH 5.1 0 20 40 60 80 100 120 140 160 180 200 0 200 400 600 800 1000 1200 1400 I[µA] E[mV] Formation of the complex Cu(I)-1-mXan 0 µM 0.5 µM 1 µM 2 µM 3 µM 5 µM 7.5 µM 10 µM 15 µM 20 µM 40 µM 0 40 80 120 160 0 10 20 30 40 I[µA] c[μM] Elektrochemická oxidace guaninu NH NNH2 O N N H +H2O -2H+ - 2e- NH NNH2 O NH N H O -2H+ - 2e- 2H+ + 2e- NH NNH2 O N N O guanin 8 – oxyguanin diimin NH NNH2 O N N H +H2O -2H+ - 2e- NH NNH2 O NH N H O -2H+ - 2e- 2H+ + 2e- NH NNH2 O N N O guanin 8 – oxyguanin diimin • Dryhurst •4e- a 4 H+ elektrodový proces 0 10 20 30 40 50 60 70 500 700 900 1100 1300 I/µA E/mV G pH 3.12 G pH 3.3 G pH 3.71 G pH 4.12 G pH 4.64 G pH 5.06 G pH 5.35 G pH 5.7 G pH 6.81 G pH 7.54 Proteiny Proteiny jsou elektroaktivní • První biomakromolekuly studované pomocí elektrochemických metod • Herles a Vančura – polarografická studie lidských tělních tekutin (krevní sérum, moč). „Prenatriová vlna“ – Katodická vlna vyskytující se při potenciálu pozitivnějším (300 mV) než je potenciál redukce sodných iontů. Předběžně je tato vlna přiřazována proteinům • Heyrovský a Babička – albumin v přítomnosti amonných iontů tvoří v dc polarografii tzv. „prenatriovou vlnu“ (H peak), způsobenou katalytickým vylučováním vodíku • „Prenatriová vlna“ není vhodná pro analytické účely Polarographic catalytic waves of human serum. (2) the “presodium” catalytic wave in 0.1 M ammonia/ammonium chloride Brdičkova katalytická reakce (BCR) •1933 – Brdičkova katalytická reakce – polarografická dvojvlna proteinů obsahujících Cys zbytky v pufrovaných roztocích kobaltu (Brdičkova soluce – amonný pufr NH4OH + NH4Cl a komplex kobaltu [Co(NH3)6]Cl3) •Původně navržená pro detekci látek bohatých na síru, jako jsou organické látky (2- mercaptopropionic acid, 2-diethylaminoethanethiol hydrochloridum), aminokyseliny (cystein, cystin) a bílkoviny (albumin) •Aplikace Brdičkovy katalytické reakce v klinické medicíně a farmakologii (diagnostika rakoviny) •Mechanismus elektrodového procesu Brdičkovy reakce není detailně znám, ale předpokládá se, že komplex Co(II) s –NH2 and –SH skupinami hraje klíčovou roli Polarographic catalytic waves of human serum. (4) the catalytic double-wave in Brdička solution Co je katalytické vylučování vodíku (CHER)? 2PH(surf) + 2e- → 2P(surf) + H2(g) P(surf) + BH(aq)↔ PH(surf) + B-(aq) PH a P-: protonizovaná/deprotonizovaná forma AMK zbytků v molekule proteinu BH je kyselá složka pufru; B- je její konjugovaná báze • Reakce naznačují, že katalyzátorem je protein ukotvený na povrchu elektrody • Cys, Lys, Arg a His zbytky v molekule proteinu jsou schopny katalyzovat vylučování vodíku na Hg elektrodě •Elektrochemický jev způsobený katalyzátorem, v jehož přítomnosti se vodík vyvíjí na katodě polarizované do méně negativních potenciálů, než v nepřítomnosti katalyzátoru •Vyvíjení vodíku je produkováno katodickým katalytickým proudem •Intenzita proudu závisí na koncentraci katalyzátoru a na jeho kinetické katalytické účinnosti H pík • V posledních letech – tzv. „prenatriová vlna“ (J. Heyrovský) v kombinaci s CPSA (chronopotenciometrická stripping analýza) na stacionární a chemicky modifikované Hg elektrodě (zahrnuty amalgámové elektrody) – vhodný nástroj pro analýzu proteinů • Katalytický signál - H pík (objevený díky CHER; pojmenovaný podle J. Heyrovského) – je citlivý na strukturní a konformační změny proteinů • H pík (pro proteiny) využitý pro sledování denaturace, agregace, interakce s nízkomolekulárními ligandy DNA; strukturní změny jako výsledek mutace a redoxního stavu CPSA – chronopotenciometrická stripping analýza )(Ef dt dE  Elektrochemická oxidace proteinů • Volné AMK (Cys, His, Met, Tyr a Trp) se oxidují na uhlíkových elektrodách • Proteiny jsou oxidovány na uhlíkových elektrodách (CPSA) • Tyr a Trp zbytky v molekule proteinu poskytují oxidační signál na uhlíkových elektrodách→ studium DNA-protein interakce, rozlišení fosforylované a nefosforylované formy, membránové Na/K pumpy, stanovení inzulinu a α-synukleinu (důležité pro Parkinsonovu chorobu) OH NH2 O OH -2e, -2H+ NH2 O OH O Tyrosin -2e, -2H+ N H NH2 OH O N NH2 OH O Tryptofan Tyr Trp Bartošík M., Paleček E., Vojtěšek B.: Klin Onkol, 2014, 27 (Suppl 1), S53-S60 Proteiny jsou elektroaktivní •Externí značení proteinů (citlivá detekce specifických proteinů ve směsi jiných molekul) Immunoassays (ELISA) •Nanotechnologie – nanočástice, nanotrubičky •Aptamery Bartošík M., Paleček E., Vojtěšek B.: Klin Onkol, 2014, 27 (Suppl 1), S53-S60 Bartošík M., Paleček E., Vojtěšek B.: Klin Onkol, 2014, 27 (Suppl 1), S53-S60