Adobe Systems Experimentální embryologie Bi1130 Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci Marie Šulcová Jarní semestr 2023 Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 2 Dnešní osnova 3. MODELOVÉ ORGANIZMY VE VÝVOJOVÉ BIOLOGII - OBRATLOVCI ̶ Danio rerio, ̶ Ambystoma mexicanum, ̶ Xenopus laevis, ̶ Reptilia, ̶ Galus gallus, ̶ Mus musculus, ̶Sus scrofa Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 3 Legislativa platná pro zásady práce s obratlovci Dodržování: ̶Neoficiálně: pravidlo 4R (reduction, refinement, replacement, responsibility) ̶Oficiálně: v ČR pro chov, práci a navrhování pokusů s obratlovci nutné dodržovat legislativu a absolvovat odborný kurz: Osvědčení o odborné způsobilosti k navrhování pokusů a projektů pokusů podle § 15d odst. 3 zákona č.246/1992 Sb., na ochranu zvířat proti týrání ̶Obsahem kurzu jsou informace o : -ustanovení zákona a právní předpisy ČR o chovu a péči zvířat a jejich používání pro vědecké účely -ustanovení předpisů EU proti týrání zvířat -etické otázky týkající se vztahu člověka a pokusných zvířat a pro a proti používání zvířat pro vědecké účely -základní biologie (anatomie, fyziologie, chov a genetika) a etologie pokusných zvířat -péče, hygiena a výživa pokusných zvířat, druhově specifické metody zacházení s pokusnými zvířaty -zásady humánního zacházení včetně metod snižujících bolest a usmrcování pokusných zvířat, pochopení druhově specifických strachů, bolestí a utrpení pokusných zvířat -návrh pokusů a projektů pokusů včetně vedení, evidence, statistiky a archivace údajů souvisejících s chovem a použitím pokusných zvířat -specifika pokusů na hospodářských a volně žijících zvířatech Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 4 Legislativa platná pro zásady práce s obratlovci A jak je to s embryi? Pokusným zvířetem se rozumí: 1.Živý obratlovec, včetně samostatně se živících larválních forem a plodů savců od poslední třetiny jejich běžného vývoje 2.(Též) živý hlavonožec ü Za pokusné zvíře se považuje také zvíře, které je v ranějším stadiu vývoje, než je stadium uvedené výše, pokud má být zvířeti umožněné žít nad rámec tohoto stadia vývoje a v důsledku prováděných pokusů je pravděpodobné, že po dosažení tohoto stadia vývoje je postihne bolest, utrpení, strach nebo trvalé poškození Welfare pokusných zvířat §Snaha o zvýšení kvality péče o zvířata v zajetí sociálním obohacením (možnost kontaktu s jedinci téhož druhu či s člověkem), obohacením náplně zvířat (možnost kontroly nad prostředím, či podněty podporujícími fyzickou aktivitu), obohacením prostředí (přidáním příslušenství), smyslovým obohacením (čichovými, taktilními či chuťovými podněty) či nutričním obohacením (nový druh krmiva, či jiný způsob podávání krmiva) tak, aby pokusné zvíře mohlo vyjádřit druhově typické chování §Obohacené welfare → spokojené zvíře → zkvalitnění výzkumných dat a poznatků Zdroj k Welfare pokusných zvířat: https://www.vfu.cz/files/2390_65_vystup.pdf Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 5 Obsah obrázku stůl Popis byl vytvořen automaticky Refinement – zjemnění = dobrá obživa, adekvátní zacházení školenými pracovníky, prostor pro život, pokusy v anestézii Reduction – zmenšení = počtu zvířat, délky pokusu, pokus se nesmí na stejném zvířeti znovu opakovat Replacement – nahrazení = pokus se provádí na zvířeti jen tehdy, nemáme-li k dispozici žádnou alternativu, jinak dáme přednost alternativě (tkáňové či buněčné kultuře atd.) Responsibility – dodržovat zákony, schválené protokoly a etický kodex Adobe Systems zápatí prezentace 6 Obsah obrázku text, skříňka Popis byl vytvořen automaticky Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 7 Dánio pruhované (Danio rerio) Zebřička, Zebrafish Dánio pruhované je nejčastějším zástupcem ryb coby modelových organizmů, který se pro výzkum využívá již od roku 1960. Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 8 Úvod ̶Třída: paprskoploutví (Actinopterygii) ̶Nadřád: kostnatí (Teleostei); řád: máloostí (Cypriniformes) Čeleď: kaprovití (Cyprinidae) ̶Původ: jižní Asie ̶Délka těla až 5 cm, podél 5 charakteristických pruhů pigmentových buněk ̶Pohlavní dimorfismus: samice plnější bříško, samci štíhlejší Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 9 Stovky vajíček vyvíjejících se mimo tělo samice Mnoho fyziologických a anatomických odlišností v porovnání s ostatními savčími modely vůči člověku Rychlý a snadno pozorovatelný vývoj (díky transparentnímu embryu) K dispozici velké množství různých mutantů; plně sekvenovaný genom Duplikace genomu Snadná aplikace chemikálií do chovných nádrží Dlouhá přítomnost chorionu (až 48 hpf) může ovlivnit působení aplikovaných chemikálií Snadný chov Zaškrtnutí Zavřít Výhody vs. Nevýhody zebřičky jako experimentálního modelu Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 10 Výhody vs. Nevýhody Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 11 Způsob chovu a manipulace ̶Chov v komerčně dostupných chovných systémech zajišťující stálou cirkulaci a filtraci vody ̶Světelný režim 14:10 (světlo:tma) ̶Ideální teplota v chovných tancích: 26-28,5°C ̶pH vody: 6,8-7,5 ̶Krmení: suchá i živá potrava, ad libitum ̶Pravidelné čištění chovných nádob a filtrů ̶ Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 12 Životní cyklus ̶Fertilizace mimo tělo samice při tření (brzo ráno „za úsvitu“), samice při něm vypouští jikry (ve stovkách), samec mlíčí ̶ ̶Z oplozených jiker se líhne po 72 hodinách plůdek (larva), ten po pěti dnech začíná přijímat potravu ̶Po dvou týdnech vývoje lze zařadit tank do systému s cirkulující vodou ̶Pohlavní zralost po cca 3 měsících života Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 13 Životní cyklus Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 14 Životní cyklus Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 15 Vývojová biologie I ̶Studium funkce genů (knock-out, knock-in genu Pou3f3) a jejich role při formování specifických tkání (skřelí) Barske et al., 2020 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32958671/ Fig. legend: Pou3f3 is required for formation of the opercular skeleton in zebrafish. (A) Micro-computed tomography of an adult zebrafish skull, with the opercle (Op) and subopercle (Sop) bones pseudocolored pink. (B and C) Reduction or loss (*) of Op and Sop bones exposes the gills (black arrow) in adult pou3f3b mutants. In C, dissected jaw skeletons were stained with Alcian blue (cartilage) and Alizarin red (bone), and the ceratohyal and branchiostegal ray series were removed for clarity. (D) In larval mutants, the Op and supporting hyomandibula cartilage (Hm) are progressively reduced (*) with decreasing Pou3f3 dosage. (E) Loss of the Op bone in double mutants is preceded by loss of RUNX2:mCherry^+ preosteoblasts in this domain (*) but not the branchiostegal ray (Br) bone domain at 3 dpf. (F) Double mutants show a reduction of sox9a expression in the Hm precartilage condensation but not the neighboring symplectic (Sy) or ceratohyal (Ch) domains. (G) Opercular outgrowth initiates but is not sustained in pou3f3a; pou3f3b mutants. Control pou3f3a^+/−; pou3f3b^Gal4ff/+ and mutant pou3f3a^−/−; pou3f3b^Gal4ff/− larvae carrying UAS:nlsGFP and sox10:DsRed (cartilage) transgenes were repeatedly imaged between 49 and 120 hpf. Compaction of mesenchyme around the forming opercle bone (outlined in Upper Right) was not evident in mutants. (H) Quantification of total dorsal hyoid arch area in individually tracked control and pou3f3a^−/−; pou3f3b^Gal4ff/− siblings (repeated-measures ANOVA: genotype P = 0.0069; time: P < 0.0001; genotype × time: P < 0.0001). (I) A trend toward moderately lower rates of proliferation in double mutants at 72 hpf becomes significant at 96 hpf (unpaired t test). Horizontal lines denote the mean. (J) Representative BrdU-labeled control and mutant samples, with the quantified opercular region outlined. (K) PEM markers shha, bmp7b, and fgf24 are expressed at normal levels in pou3f3a; pou3f3b double mutants at 48 hpf (white arrows). sox10:GFPCAAX labels arch mesenchyme. (L) Unilateral transplantation of fli1a:EGFP donor neural crest cells into a pou3f3a^+/−; pou3f3b^−/− host rescued Op formation. Images in G, J, and L are maximum-intensity projections; single optical sections are presented in K. (Scale bars: C, 500 μm; D and L, 50 μm; E–G, J, and K, 20 μm.) Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 16 Vývojová biologie II ̶Single-cell analýzy odhalující osud buněk neurální lišty a jednotlivé buněčné typy, které se z nich diferencují Fabian et al., 2022 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35013168/ Abstract: The cranial neural crest generates a huge diversity of derivatives, including the bulk of connective and skeletal tissues of the vertebrate head. How neural crest cells acquire such extraordinary lineage potential remains unresolved. By integrating single-cell transcriptome and chromatin accessibility profiles of cranial neural crest-derived cells across the zebrafish lifetime, we observe progressive and region-specific establishment of enhancer accessibility for distinct fates. Neural crest-derived cells rapidly diversify into specialized progenitors, including multipotent skeletal progenitors, stromal cells with a regenerative signature, fibroblasts with a unique metabolic signature linked to skeletal integrity, and gill-specific progenitors generating cell types for respiration. By retrogradely mapping the emergence of lineage-specific chromatin accessibility, we identify a wealth of candidate lineage-priming factors, including a Gata3 regulatory circuit for respiratory cell fates. Rather than multilineage potential being established during cranial neural crest specification, our findings support progressive and region-specific chromatin remodeling underlying acquisition of diverse potential. Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 17 Vývojová biologie III ̶Studium regeneračního potenciálu rozličných struktur (ploutví, srdce, mozku, retiny, ale třeba i interopekulárního mandibulárního kloubu) a popis doprovodných procesů Smeeton et al., 2022 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35127702/ Abstract: The poor intrinsic repair capacity of mammalian joint cartilage likely contributes to the high incidence of arthritis worldwide. Adult zebrafish can regenerate many structures that show limited or no healing capacity in mammals, including the jawbone. To test whether zebrafish can also regenerate damaged joints, we developed a surgical injury model in which the zebrafish jaw joint is destabilized via transection of the major jaw joint ligament, the interopercular–mandibular (IOM). Unilateral transection of the IOM ligament in 1-year-old fish resulted in an initial reduction of jaw joint cartilage by 14 days, with full regeneration of joint cartilage by 28 days. Joint cartilage regeneration involves the re-entry of articular chondrocytes into the cell cycle and the upregulated expression of sox10, a marker of developing chondrocytes in the embryo that becomes restricted to a subset of joint chondrocytes in adults. Genetic ablation of these sox10-expressing chondrocytes shows that they are essential for joint cartilage regeneration. To uncover the potential source of new chondrocytes during joint regeneration, we performed single-cell RNA sequencing of the uninjured adult jaw joint and identified multiple skeletal, connective tissue, and fibroblast subtypes. In particular, we uncovered a joint-specific periosteal population expressing coch and grem1a, with the jaw joint chondrocytes marked by grem1a expression during regeneration. Our findings demonstrate the capacity of zebrafish to regenerate adult joint cartilage and identify candidate cell types that can be tested for their roles in regenerative response. Fig. legend: Joint degeneration and recovery following ligament transection surgery. (A) Schematic of the bones of the zebrafish jaw relative to the jaw joint (purple) and the interopercular–mandibular (IOM) ligament (blue) that is surgically transected. (B,C) Reflected light images of the zebrafish jaw in ventral view show the IOM ligament (dotted red outline) before (B) and immediately after (C) transection. (D–F) Toluidine blue staining of uninjured adult jaw joint (D) and IOM-transected jaw joint at 14 days post-ligament transection (dplt) (E) and 28 dplt (F). The arrowheads point to the area of cartilage erosion and the arrow to the synovial hyperplasia. (G) Quantification of jaw joint degeneration after IOM transection using the zebrafish OARSI scoring method; n = 29 uninjured; n = 31 at 14 dplt; n = 13 at 28 dplt; n = 14 at 42 dplt. Individual data points, mean, and standard error of the mean are shown. The p-values are calculated by ANOVA and Tukey’s multiple-comparison test. AA, anguloarticular bone; IOP, interopercular bone; Q, quadrate bone; RA, retroarticular bone. Scale bar = 50 μm. Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 18 Vývojová biologie ̶Studium pigmentace (tvorba chromatoforů) ̶Toxikologické studie ̶Imunologické studie ̶Model pro studium: Duschenovy muskulární dystrofie, obezity, diabetu, melanomů, tuberkulózy, epilepsie Adobe Systems Další zástupci ryb využívaných v laboratořích ̶Medaka (Oryzias latipes), japonská rýžová ryba ̶Výhody oproti daniu: dvakrát menší genom než dánio (snadnější transgeneze) dokáží žít v teplotách v rozmezí 0°C - 40°C nenáročná na chov kratší generační doba dostupné velké množství inbredních linií ̶1994 – medaky byly první obratlovci pářící se v kosmu ̶ ̶Halančík (Nothobranchius furzeri) ̶Původem z periodických tůní Zimbabwe a Mozambiku ̶Nejrychlejší životní cyklus u obratlovců – pohlavní dospělosti dosahují 14 dnů po vylíhnutí ̶Žijí pouze 1-5 měsíců Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 19 Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 20 Další informace a zajímavosti ̶Příručky chovu Zebřiček v laboratorních podmínkách: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3916945/ https://www.aaalac.org/pub/?id=E9019693-90EC-FC4A-526E-E8236CC13B28 ̶Přehled veškerých molekulárně biologických informací, přes expresi genů, dostupné mutanty, protilátky, publikace a mnoho dalšího https://zfin.org/ ̶ Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 21 Axolotl mexický (Abystoma mexicanum) Nejdéle etablovaný laboratorní živočich, roku 1864 bylo přivezeno do pařížského muzea Jardin des Plantes 34 axolotlů, od té doby se intenzivně studovali, a to jak z pohledu evolučního (víc obojživelník, nebo plaz?), tak z fyziologického (neotenie, regenerace). Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 22 Úvod ̶Třída: obojživelníci (Amphibia) ̶Podtřída: ocasatí (Caudata); řád: axolotli (Ambystomatoidea) Čeleď: axolotlovití (Ambystomatoidea) ̶Původ: mexická jezera (Lago de Xochimilco a Lago de Chalco) ̶Délka těla až 30 cm, charakteristické externí keříčkovité žábry okolo hlavy, na ocase patrný kožní lem ̶Pohlavní dimorfismus: samice plnější bříško, samci štíhlejší s viditelnými boulemi v oblasti za zadními končetinami Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 23 Snadný chov druhu jako takového Náročný na chov co do prostoru Stovky vajíček vyvíjejících se mimo tělo samice Dlouhá generační doba (samci rok, samice až rok a půl) Obrovský regenerační potenciál Doba páření omezená jen na určitou část v roce Díky absenci pigmentu u některých kmenů možnost přímého pozorování buněk, které jsou díky enormnímu genomu dostatečně velké Genom až příliš velký (10x v porovnání s člověkem) díky namnoženým nekódujícím sekvencím, kódujících pak srovnatelně s jinými obratlovci Zaškrtnutí Zavřít Výhody vs. Nevýhody axolotla jako experimentálního modelu Nevýhody chovu podrobněji: 1) obrovský genom - 10x větší než lidský a jeden z největších u obratlovců vůbec (poprvé asemblovaný 2018), (největší mají bahníci, genom asemblovaný 2020), genom je zmnožen díky vysoké aktivitě transpozonů, které kopírují a namnožují nekódující sekvence (kódující sekvence mají srovnatelnou velikost s ostatními normálními obratlovci...) 2) dlouhá generační doba - uvádí se pro samce rok, pro samici rok a půl (v reálu je to často ale víc), z toho plyne, že jakoukoliv rozumnou genetiku (knockouti, reportéry, Cre-Lox) moc dělat nejde 3) zvířata jsou docela velká, čili chov je náročný na prostor 4) albíni byli vytvoření mezidruhovou hybridizací s jiným druhem axolotla, což dělá ne příliš čitelné genetické pozadí 5) spousta přístupů běžných u jiných modelových druhů ještě není u axolotla příliš používaných Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 24 Způsob chovu a manipulace ̶Chov v akváriu: ̶pro jednoho axolotla o velikosti 50x40 cm a objemu 40 l ̶dno nádrže vystláno štěrkem (štěrk větší než hlava zvířete – hrozí zadušení při pozření) ̶na nádrž nesmí dopadat slunce (stínomil) ̶Voda: ̶Sladká, tvrdá, bez chlóru, nutná filtrace, ale bez proudění ̶14-20°C, pH: 6,5-7,7 ̶ ̶Krmivo: ̶roupice, žížaly, slimáci, nitěnky, měkčí krmný hmyz ̶syrové maso teplokrevných zvířat nevhodné Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 25 Životní cyklus ̶samice pro oplodnění vajíček přijímá kloakou samcův spermatofor (vnitřní oplodnění), následně kladou až 300 vajec ̶Axolotlové celý život zůstávají v larválním stádiu, neprocházejí metamorfózou – neotenie ̶Způsobeno nedostatkem hormonu thyroxinu, pro jeho produkci totiž chybí v okolním prostředí základní stavební složka – jód ̶Umělou aplikací hormonu lze metamorfózu vyvolat ̶ ̶Pohlavní dospělosti dosaženo mezi 18 a 24 měsíci 18-24 months Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 26 Životní cyklus Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 27 Vývojová biologie I ̶Studium potenciálu regenerace různých částí těla (ocasu, míchy, končetin, CNS, očí, srdce, mozku) pomocí mnoha experimentálních postupů, včetně transplantací tkáně Wells et al., 2021 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34779399/ Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 28 Vývojová biologie II Soukup et al. 2008 ̶Transplantace tkání transgenních zvířat jako nástroj pro určení původu buněk (fate-mapping) https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18794902/ Abstract: The oral cavity of vertebrates is generally thought to arise as an ectodermal invagination^1^,^2. Consistent with this, oral teeth are proposed to arise exclusively from ectoderm, contributing to tooth enamel epithelium, and from neural crest derived mesenchyme, contributing to dentin and pulp^3^,^4^,^5. Yet in many vertebrate groups, teeth are not restricted only to the oral cavity^6^,^7^,^8^,^9, but extend posteriorly as pharyngeal teeth that could be derived either directly from the endodermal epithelium, or from the ectodermal epithelium that reached this location through the mouth or through the pharyngeal slits^6. However, when the oropharyngeal membrane, which forms a sharp ecto/endodermal border^10, is broken, the fate of these cells is poorly known. Here, using transgenic axolotls with a combination of fate-mapping approaches, we present reliable evidence of oral teeth derived from both the ectoderm and endoderm and, moreover, demonstrate teeth with a mixed ecto/endodermal origin. Despite the enamel epithelia having a different embryonic source, oral teeth in the axolotl display striking developmental uniformities and are otherwise identical. This suggests a dominant role for the neural crest mesenchyme over epithelia in tooth initiation and, from an evolutionary point of view, that an essential factor in teeth evolution was the odontogenic capacity of neural crest cells, regardless of possible ‘outside-in’^11 or ‘inside-out’^12 influx of the epithelium. Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 29 Vývojová biologie III Tesarova et al, 2022 ̶Studium evo-devo otázek (vývoj larvy macaráta bez očí vs. vývoj axolotla s plně vyvinutým zrakem) http://gigadb.org/dataset/102196 Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 30 Vývojová biologie III Obsah obrázku mlok Popis byl vytvořen automaticky Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 31 Další informace a zajímavosti ̶Cesta axolotla do světových laboratoří: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/jez.b.22617 ̶ ̶Z oficiální webu laboratoře Elly Tanaky: http://tanakalab.org/fun/axolotl-poems/ ̶Vše, co jste chtěli vědět o axolotlech, ale báli jste se zeptat: http://www.axolotl.org/tiger_salamander.htm Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 32 Drápatka vodní (Xenopus laevis) Žáby Xenopus patří opět mezi tradičně používané modelové organizmy, které jsou využívány již od roku 1802, jako modelový organizmus etablován v roce 1931 coby model pro ověření těhotenství – moc žen byla injikována samicím a pokud byla žena těhotná, hormon hCG (choriongonadotropní hormon) obsažený v jejich moči způsobil, že samice začala klást vajíčka, tohoto principu se v laboratorní praxi využívá dodnes. Adobe Systems zápatí prezentace 33 Obsah obrázku text Popis byl vytvořen automaticky Xenopus Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 34 Úvod ̶Třída: obojživelníci (Amphibia) ̶Řád: žáby (Anura) Čeleď: pipovití (Pipidae) ̶Původ: Afrika ̶výhradně akvatický druh, zadní nohy (s černými drápky) jsou proto posunuty až za tělo ̶pohlavní dimorfismus: samice větší (10 až 15 cm), samci až o třetinu menší, v době páření pak na předních nohách pářicí mozoly, samice pak viditelná kloaka ̶ ̶ Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 35 Snadný chov Tetraploidní Možnost uměle indukovat rozmnožování Pohlavní zralosti dosahují nejdříve po roce života Vývoj embryí mimo tělo samice a díky jejich velikosti (ø 1mm) snadná manipulace Kvalita kladených vajec s přibývajícím věkem samic klesá Rychlý vývoj a velký počet (1500-3000/ samice) Pro oplodnění samic v laboratorním prostředí nutné zabít samce Zaškrtnutí Zavřít Výhody vs. Nevýhody drápatky jako experimentálního modelu Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 36 Způsob chovu a manipulace ̶Chov v akváriu: ̶Pro chovný pár o velikosti 50x30 (x30) cm ̶Dno nádrže holé nebo s kameny pro úkryt ̶Akvárium je nutné dobře zakrýt – drápatky dobře skáčou ̶Voda: ̶Nedoporučuje se používat intenzivní filtrace (přílišné proudění zvířata ruší) ̶20-24°C, pH: 6-8 ̶Krmivo: ̶V přírodě se živí organickými zbytky a hmyzem uvázlým na vodní hladině ̶V zajetí pak krmíme larvami hmyzu, žížalami, drobnými rybkami, rybím file či granulovaným krmivem Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 37 Životní cyklus Xenopus laevis as a model system to study gene function. On the left,... | Download Scientific Diagram This Is How a Tadpole Transforms Into A Frog | The Dodo - YouTube Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 38 Životní cyklus Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 39 Vývojová biologie První naklonovaný živočich? Žába! ̶John Gurdon (1962) https://www.youtube.com/watch?v=NXLy4er_MmQ&ab_channel=DeepthiV The animal cap is a region of the Xenopus blastula and early gastrula stage embryo (6–12 h after fertilization). It is “animal” because the upper, pigmented half of the egg and embryo is referred to as the animal hemisphere (as opposed to the lower, vegetal hemisphere). The animal hemisphere is so named both because it contributes most to the final body (the vegetal hemisphere being mostly for yolk storage) and because those cells that it is made of are the most motile, or animated, during development. The animal cap is a “cap” because it forms the roof of a large cavity—the blastocoel—throughout blastula and gas- trula stages. When excised and depending somewhat on the technique and stage of excision, it has the shape of a rather untidy skullcap. The animal cap, if left in situ, normally contributes to the skin and nervous system of the tadpole. When excised and cultured in normal amphibian media (simple saline solutions), it develops into a ball of skin tissue or “atypical epi- dermis.” The basis of the animal cap assay is that the excised animal cap can be diverted from its epidermal fate to other fates by (a) juxtaposition with other tissues, (b) inclusion of soluble growth factors or other reagents in the medium, or (c) by preinjecting the embryo with RNA or DNA encoding developmentally active genes Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 40 Vývojová biologie Xenopus laevis as a model system to study gene function. On the left,... | Download Scientific Diagram Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 41 Vývojová biologie ̶Role PCP v raném vývoji embryí obratlovců Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 42 Vývojová biologie ̶Role PCP v raném vývoji embryí obratlovců Ad Fig.1: Posterior origin and planar propagation of the PCP cue. (A) Schematic of the experiment. Mediolateral incisions (MLI) were made at stage 11.5 (MLI11.5) or stage 13 (MLI13). (B–D″) Representative neural plates (NP) double immunostained for Vangl2 and Sox3. (B–B″) Control unmanipulated embryo (CTRL, stage 15, N=3). (C–C″) MLI11.5 embryo (N=6). Asterisks in C′ mark the cells with lack of Vangl2 polarization. (D–D″) MLI13 embryo (N=5). Boxed regions in B, C and D are magnified in B′, B″, C′, C″, D′ and D″. Yellow line delimits the NP. Grey line indicates MLI. Arrows show Vangl2 crescent orientation. N, number of embryos examined. Scale bar in B, 100 µm, also refers to C and D. (E) Ratio of the frequencies of polarized cells in the anterior and posterior NP (A/P ratio). n, number of cells per group. This is representative of three to four independent experiments. Means and s.d. are shown. Two-tailed Student’s t-test, ***P=0.00038 Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 43 Další informace a zajímavosti ̶Přehled veškerých informací: https://www.xenbase.org/entry/ ̶ Adobe Systems Další zástupci obojživelníků využívaných v laboratořích ̶Drápatka tropická (Xenopus tropicalis) ̶Výhody: diploidní, vzrůstem menší (tedy skladnější), samice kladou více vajíček ̶Nevýhody: až příliš malá (včetně vajíček) – složitější manipulace, teplota vody pro chov vyšší (27-30°C) Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 44 Obsah obrázku stůl Popis byl vytvořen automaticky Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 45 Plazi (Reptilia) C:\Users\avcr\Desktop\plazi.jpg Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 46 Úvod ̶Nadřád/Podtřída: Lepidosauria ̶Řád: Squamata (šupinatí plazi – ještěři, hadi) ̶Nadřád/Podtřída: Testudines (želvy) ̶Nadřád/Podtřída: Archosauria ̶Řád: Crocodilia (krokodýli) ̶ ̶Heterogenní skupina živočichů, tvoří jednu třetinu všech suchozemských živočichů ̶V laboratořích spíše méně obvyklí ̶Poikilotermové, tělo kryto šupinami, kladou vejce (vzácně živorodí) ̶Pro ještěry a hady typická ekdyze (svlékání), mnozí ještěři jsou pak vybaveni parietálním okem ̶ •Krokodýli jsou příbuznější ptákům než zbytku plazů •Svlečka – exuvie •Parietální oko – třetí oko: vnímání intenzity světla a doby osvícení Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 47 Málo prostudovaní s unikátními vlastnostmi a specifiky Specifické a mnohdy náročné podmínky chovu Vývoj in ovo mimo tělo samice Vývoj embryí ve vajíčku enormně dlouhý (půl roku i déle) Vývoj embryí ve vajíčkách i v rámci jedné snůšky asynchronní Zaškrtnutí Zavřít Výhody vs. Nevýhody plazů jako experimentálního modelu Adobe Systems Alligator mississippiensis (Aligátor severoamerický) Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 48 ̶Způsob chovu: ̶Nejčastěji na farmách ̶V případě poklesu teplot se přestávají krmit a jsou schopní hibernace (brumace) ̶Životní cyklus: ̶Samice klade až 50 vajec, které se v hnízdě inkubují cca 65 dní ̶Pohlaví mláďat je dáno teplotou v průběhu inkubace Při teplotách nad 34°C a více – samci Při teplotách 30°C a méně - samice ̶Vylíhlá mláďata se zdržují v blízkosti matky až tři roky, pohlavní dospělosti dosahují v osmi letech ̶ Adobe Systems Anolis carolinensis (Anolis rudokrký) ̶Genom kompletně osekvenován (2014), cca 17 tisíc protein-kódujících genů ̶Způsob chovu: ̶Malý, snadno chovatelný (v teráriu se zdrojem světla, tepla a UV zářením), jako potrava drobný hmyz ̶ ̶Životní cyklus: ̶Samice klade cca 10 vajec měsíc po páření, juvenilové se líhnou po 30-45 dnech inkubace Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 49 Adobe Systems Python sebae (Krajta písmenková) Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 50 ̶Škrtič, v zajetí se dožívá až 20 let, měří až 6 metrů, váhově může dosáhnout i devadesáti kilo ̶Pro laboratorní účely méně praktický zástupce hadů ̶Způsob chovu a manipulace ̶V teráriu, zdroj světla a tepla, potrava nejčastěji hlodavci ̶Životní cyklus: ̶Samice klade jednou do roka 40-100 vajec, ty jsou v době kladení již ve stádiu organogeneze, následuje 80-90 dní inkubace, pak se mláďata líhnou Adobe Systems Další zástupci plazů využívaných v laboratořích ̶Chameleon jemenský (Chamaeleo calyptratus ) ̶ ̶ Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 51 Adobe Systems Další zástupci plazů využívaných v laboratořích ̶Gekončík noční (Eublepharis macularius), Gekon panenský (Lepidodactylus lugubris) ̶ ̶ ̶ Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 52 Adobe Systems Další zástupci plazů využívaných v laboratořích ̶Chameleon jemenský (Chamaeleo calyptratus ) ̶Gekončík noční (Eublepharis macularius), Gekon panenský (Lepidodactylus lugubris) ̶ ̶Agama vousatá (Pogona vitticeps) ̶ ̶Užovka červená (Pantherophis guttatus) ̶ ̶ Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 53 Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 54 Vývojová biologie I ̶Studie popisující mechanizmus vzniku morfologických rozdílů (ve velikosti těla, tvaru končetin a orgánů, očí, tvaru a počtu zubů) v rámci evoluce jednotlivých plazích druhů Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 55 Vývojová biologie II ̶Popis vývojových procesů u nemodelových organismů a zařazení do kontextu dosavadních poznatků ̶Sledování buněk neurální lišty u plazů na modelovém druhu chameleona jemenského Diaz et al, 2019 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30980777/ Abstract: Here, we present veiled chameleons (Chamaeleo calyptratus) as a model system for studying neural crest cell development in squamates. Chameleons exhibit various morphological specializations associated with an arboreal lifestyle that may have been facilitated through neural crest cells acting as a conduit for evolutionary change. While the comparative biology of neural crest cells has been studied for a century and a half beginning with their discovery by Wilhelm His in 1868, most of our understanding of their development and function has come from a small number of species. Thus, critical gaps exist in our understanding of how neural crest cells mediate evolution and development. This is particularly true with respect to squamate reptiles (lizards, snakes, amphisbaenians), which account for approximately one-third of all living tetrapods. -whole mount imunohistochemistry (HNK1, Tuj1) Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 56 Vývojová biologie III ̶Využití přirozených vlastností plazů (jedových žláz hadů a z nich vytvořených organoidů) pro produkci látek potenciálně použitelných v medicíně Post et al, 2020 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31978343/ Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 57 Kur domácí (Gallus gallus f. domestica) Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 58 Úvod ̶Pro výzkumné účely se využívá pouze embryí vyvíjejících se uvnitř vajíčka opatřeného tvrdou vápenatou skořápkou ̶Třída: ptáci (Aves) ̶Podtřída: letci (Neognathae) Řád: hrabaví (Galliformes) Čeleď: bažantovití (Phasianidae) ̶ developing egg.jpg Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 59 Vývoj embryí in ovo mimo tělo samice Samice snáší nižší počet vajec (cca 5 vajec/týden) S embryi lze po otevření skořápky manipulovat, po manipulaci lze vývoj průběžně kontrolovat Vysoká úmrtnost embryí po manipulaci Embryo lze odebírat v přesně stanoveném stádiu Potenciální chov a generace vlastních (i transgenních) kuřat v laboratorních podmínkách náročný Kuřecí genom osekvenován (2004) Práce s kuřecími embryi nesterilní Zaškrtnutí Zavřít Výhody vs. Nevýhody kura/kuřete jako experimentálního modelu Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 60 Způsob chovu (inkubace) a manipulace ̶Vývoj embrya v oplodněném vejci v laboratoři začíná vložením vajec do inkubátoru (38°C, konstantní vlhkost) ̶Vejce musí být položeno na stranu, nesmí stát (A) ̶Po 1,5 dni (cca 36 hodinách = HH 10) odsáváme bílek (embryo klesne) (B), vystříháme drobný otvor do skořápky (C), který následně přelepíme a vejce vracíme zpět do inkubátoru ̶Po cílené manipulaci (injikaci, implantaci, transplantaci) přelepíme otvor a inkubujeme do odběru (D) ̶ Obsah obrázku hra, sport, fotka, oranžová Popis byl vytvořen automaticky Obsah obrázku hra, sport, fotka, oranžová Popis byl vytvořen automaticky Obsah obrázku hra, sport, fotka, oranžová Popis byl vytvořen automaticky Obsah obrázku hra, sport, fotka, oranžová Popis byl vytvořen automaticky Obsah obrázku vsedě, ovoce, polovina, oranžová Popis byl vytvořen automaticky Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 61 Životní cyklus aka Hamburger Hamilton Stages Obsah obrázku text Popis byl vytvořen automaticky Vývoj kuřecího embrya - 21 dní (po stádium 46 podle HH) -co se dospělých zvířat týče, tak: •Kohouti pohlavně dozrávají v sedmi měsících •Slepice snášejí vejce od 6 měsíců, ale až v jednom roku jsou schopné vejce vysedět a postarat se o vylíhlá kuřata Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 62 Vývojová biologie I ̶Tvorba chimér (transplantací části křepelčí neurální lišty na stejné místo stejně starého kuřecího embrya) jako nástroj sledování osudu buněk Le Douarin et al, 2004/1969 The quail-chick chimera system The avian embryo was particularly instrumental in the study of cell migration and histogenesis after the quail-chick marking system has been devised in 1969 (Le Douarin, 1969, Le Douarin, 1973). It was originally based on an observation that I did on the structure of the interphase nucleus of the quail, in which a large amount of heterochromatic DNA is associated with the nucleolus. This distribution of heterochromatin is rare in the animal kingdom and different from that seen in chick where heterochromatin is dispersed in small clumps within the nucleoplasm. This makes the cells of the two species easy to distinguish on sections stained for DNA with the Feulgen-reaction and suggested to me the idea of constructing chimeras between these two species of birds, by associating quail and chick cells in the embryo in ovo (Fig. 1). Chimeras resulting from the replacement of definite regions of the embryo of one species by their counterparts from stage-matched embryos of the other, develop normally, suggesting that this experimental system can provide reliable information on the behaviour and fate of the grafted cells. This is why it has been and still is widely applied to study the ontogeny of the NC (see Le Douarin, 1982, Le Douarin and Kalcheim, 1999 for reviews). Ad Fig. The quail-chick marker system (A,B): two means for recognizing quail from chick cells. (A) Feulgen staining of DNA shows a large mass of heterochromatin in the centre of the nucleus, which is associated with the nucleolus in quail cells (left). In chick cells, the heterochromatin is evenly distributed (right). (B) Staining of quail cells (half a somite on the right) grafted into a chick embryo with a monoclonal antibody raised against a quail nuclear antigen (produced by Carlson and Carlson, University of Michigan). Different types of grafts from chick to quail (or vice versa) embryos at the same developmental stages. The graft may involve the placodal ectoderm, the neural fold at the head level or the neural tube including the neural folds prior to the onset of NCC emigration. (D,E) NCC migrating from a neural tube quail graft at the trunk level (D) or from a neural fold (right) graft at the cephalic level. Note that a unilateral NC fold graft expands on both sides during migration. Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 63 Vývojová biologie II ̶Využití kuřecího modelu pro studium původu defektů při formování nervové trubice Dady et al, 2014 Abstract In higher vertebrates, the primordium of the nervous system, the neural tube, is shaped along the rostrocaudal axis through two consecutive, radically different processes referred to as primary and secondary neurulation. Failures in neurulation lead to severe anomalies of the nervous system, called neural tube defects (NTDs), which are among the most common congenital malformations in humans. Mechanisms causing NTDs in humans remain ill-defined. Of particular interest, the thoracolumbar region, which encompasses many NTD cases in the spine, corresponds to the junction between primary and secondary neurulations. Elucidating which developmental processes operate during neurulation in this region is therefore pivotal to unraveling the etiology of NTDs. Here, using the chick embryo as a model, we show that, at the junction, the neural tube is elaborated by a unique developmental program involving concerted movements of elevation and folding combined with local cell ingression and accretion. This process ensures the topological continuity between the primary and secondary neural tubes while supplying all neural progenitors of both the junctional and secondary neural tubes. Because it is distinct from the other neurulation events, we term this phenomenon junctional neurulation. Moreover, the planar-cell-polarity member, Prickle-1, is recruited specifically during junctional neurulation and its misexpression within a limited time period suffices to cause anomalies that phenocopy lower spine NTDs in human. Our study thus provides a molecular and cellular basis for understanding the causality of NTD prevalence in humans and ascribes to Prickle-1 a critical role in lower spinal cord formation. Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 64 Vývojová biologie II ̶Využití kuřecího modelu pro studium vývoje a formování končetin a využití znalostí tohoto procesu pro studium účinku růstových faktorů či toxikologické studie ectopic limb Riddle et al, 1993 Killinger, 2018 Abstract (Sonic hedgehog Mediates the Polarazing Activity of the ZPA) The zone of polarizing activity (ZPA) is a region at the posterior margin of the limb bud that induces mirror-image duplications when grafted to the anterior of a second limb. We have isolated a vertebrate gene, Sonic hedgehog, related to the Drosophila segment polarity gene hedgehog, which is expressed specifically in the ZPA and in other regions of the embryo, that is capable of polarizing limbs in grafting experiments. Retinoic acid, which can convert anterior limb bud tissue into tissue with polarizing activity, concomitantly induces Sonic hedgehog expression in the anterior limb bud. Implanting cells that express Sonic hedgehog into anterior limb buds is sufficient to cause ZPA-like limb duplications. Like the ZPA, Sonic hedgehog expression leads to the activation of Hox genes. Sonic hedgehog thus appears to function as the signal for anteroposterior patterning in the limb. Anterio – posteriorní – ZPA – Shh Proximo – distální – APR - Fgf Adobe Systems Další zástupci ptáků využívaných v laboratořích ̶Křepelka japonská (Coturnix japonica) ̶ ̶Křepelka polní (Coturnix coturnix) Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 65 Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 66 Další informace a zajímavosti ̶Databáze exprese genů ve vyvíjejícím se kuřecím embryu: http://geisha.arizona.edu/geisha/ ̶Roslin Institut https://www.ed.ac.uk/roslin/national-avian-research-facility Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 67 Myš domácí (Mus musculus var. alba) Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 68 Úvod ̶Pohlavní dimorfismus: samice drobnější, pohlavní otvor blíž análnímu otvoru (cca 5 mm), samci robustnější, pohlavní otvor od análního otvoru cca 15 mm Žena Muž ̶Třída: savci (Mammalia) ̶Řád: hlodavci (Rodentia) Čeleď: myšovití (Muridae) Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 69 Savec, nejpodobnější člověku (20 párů chromozomů, 99% genů stejných) Mnoho fyziologických odlišností „Skladná“, snadný a levný chov Nutnost zabít matku při odběru embryí Krátká doba březosti, rychlé dosažení pohlavní zralosti Rychlé stárnutí Možnost vytvoření transgenních myších modelů Některé genetické modifikace embryonálně letální Zaškrtnutí Zavřít Výhody vs. Nevýhody myši jako experimentálního modelu Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 70 Způsob chovu a manipulace I ̶Nenáročný, v klecích s podestýlkou, granule, čerstvá voda, světelný režim 12/12, 22±2°C, enrichment, pravidelná výměna steliva a vody (1x týdně) ̶Rozlišujeme: ̶Otevřený (konvenční) chov: pohyb zvířat, materiálu a pečujících osob volný, pouze se zvýšenými hygienickými opatřeními ̶Bariérový chov: prostor s chovem zvířat je oddělen od vnějšího prostředí bariérou, přes kterou prochází jak pracovníci, tak zvířata, veškerý materiál (potrava, podestýlka, apod.) se sterilizují, nutná zvýšená hygiena, zvířata jsou testována na přítomnost patogenů (SPF – specified pathogen free) ̶Izolátorový chov: prostor pro zvířata je trvale oddělen bariérou jak od vnějšího prostředí, tak od chovatelů, typicky pro imunodeficientní myši, axenické (germ-free) a gnotobiotické myši (s definovaným složením střevní mikroflóry) ̶ IVC chov – z anglického „individually ventilated cages“ – brání rozšířené případné infekce Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 71 Způsob chovu a manipulace I ̶Isogenní = geneticky definované kmeny (isogenicita=genetická totožnost všech jedinců) ̶inbrední kmeny: vznik příbuzenskou plemenitbou po více než 20 generací (bratr a sestra nebo rodič a potomek), geneticky identičtí jedinci ̶koizogenní (=mutantní) kmeny: od původního kmene se liší jen v jednom genu, ve kterém došlo k mutaci ̶kongenní kmeny: vznik křížením dvou kmenů a následným zpětným křížením, výskyt specifických genů jednoho kmene na pozadí kmene druhého ̶Neisogenní = geneticky nedefinované kmeny ̶outbrední linie: geneticky heterogenní populace, vyhýbáme se příbuzenskému křížení, tak aby koeficient inbreedingu zůstával co nejnižší, vhodné pro behaviorální pokusy ̶ ̶Nejčastěji využívané kmeny laboratorních myší: C57BL/6J (inbrední), BALB/c (produkce monoklonálních protilátek), C3H/HeJ, FVB/NJ ̶ ̶ IVC chov – z anglického „individually ventilated cages“ – brání rozšířené případné infekce Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 72 Způsob chovu a manipulace https://www.youtube.com/watch?v=Gs-ebUnPQEc Adobe Systems Životní cyklus I ̶Gestace – 19-21 dní, odstav mláďat v 3-4 týdny ̶Pohlavní dospělost – 6-7 týdnů ̶Generační doba – 2-3 měsíce ̶Estrus – polyestrální, cyklus se opakuje každých 4-5 dní ̶Samice dvojitá děloha (uterus duplex) ̶Počet mláďat ve vrhu 4-10 ̶Průměrná délka života – až 2 roky ̶ Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 73 •Estrus: periodické, fyziologické změny v těle i chování samic placentálních samic, které jsou navozeny působením pohlavních hormonů a slouží k zajištění reprodukce, pouze u samic lioopů a u člověka je nahrazen menstruačním cyklem •Estrální cyklus vs menstruace: pokud nedochází k oplození, při menstruaci dochází k odloučení endometria společně s krví z těla ven, v estrálním cyklu se děložní výstelka pouze snižuje, ale neudlučuje; v případě menstruace též dochází k růstu nového folikulu hned po skončení cyklu, po estru nastupuje tzv. anestrus, období klidu •Polyestrická zvířata – cyklus se opakuje několikrát do roka (prase, skor, kůň či hlodavci) •Diestrická zvířata – cyklus se opakuje dvakrát ročně (feny malých plemen) •Monoestrická zvířata – přichází do říje jen jednou ročně (typické pro divoká zvířata) Dělohy •uterus duplex: zajícovití, někteří hlodavci •uterus bicornis: fena, kočka, klisna, prasnice, kráva •uterus simplex: primáti Adobe Systems Životní cyklus II - embryogeneze ̶E9: rozeznatelný hrudní končetinový pupen ̶E10: rozezeznatelný pánevní a ocasní končetinový pupen, z prvního faryngeálního oblouku vzniká mandibula ̶E11: formování základů patrových plotének z výběžku maxily ̶E12: lze rozeznat jednotlivé články prstů, ty stále spojeny, formování základů zubů ̶E13: rozvětvování plic, apotóza interdigitálních prostor (mezi prsty) ̶E14: patrové ploténky se narovnávají a srůstají ̶E15: otevírají se oční víčka ̶E16: osifikace, oční víčka i nosní dutina se opět zavírají zápatí prezentace 74 E9 E10 E11 E12 E13 E14 E15 E16 Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 75 Vývojová biologie Studium preimplantačního vývoje oocytů ̶Různá témata pokrývající jak samotný proces oplození, tak jednotlivé kroky rýhování buněk embrya ̶ Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 76 Vývojová biologie Nobelova cena za fyziologii a medicínu (2007): Capechi, Evans, Smithies ̶objev principů vnesení genových modifikací do myšího modelového organizmu s využitím embryonálních kmenových buněk Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 77 Vývojová biologie Obsah obrázku text Popis byl vytvořen automaticky Genetically modified mouse models have become a key tool in basic and biomedical research. The ability to engineer the mouse genome has greatly transformed biomedical research in the last decade. Crucial for this technology is the ability to control the expression of genes of interest. It is possible to increase or decrease gene expression, or eliminate the expression of a gene completely. Transgenic and gene knockout/knockin technologies have become important experimental tools for assigning functions to genes at the level of whole complexity of organism, creating models of genetic disorders, evaluating effects drugs and toxins, thus helping to answer fundamental issues in basic and applied research. The Czech Centre for Phenogenomics (CCP), through its membership in INFRAFRONTIER and IMPC, is a partner in a collective global network that aims to comprehensively and systematically analyze the effect of loss of function gene mutations in mice. The goal is to produce a comprehensive ‘encyclopedia‘ of gene function, that will help identify causative factors of human diseases as well as novel targets for therapeutic intervention. Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 78 Vývojová biologie Myší modely lidských vývojových onemocnění – ciliopatie ̶Vývojové defekty způsobené chybnou činností cilií ̶Pro studium podstaty těchto defektů a možné léčby vytvořeny transgenní myši nesoucí mutace v různých genech souvisejících s fyziologií cílií Ciliopatie -vývojové defekty/onemocnění způsobené mutacemi v genech podílejících se na správné činnosti/funkci organel cilií -u člověka manifestováno nejčastěji: rozštěpy patra, kognitivními defekty, hluchotou, encephalocéliemi, onemocněním jater, obezitou, polydaktyliemi, polycystickými ledvinami, retinopatiemi, situs inversus, skeletálními defekty Tmem107 -transmembránový protein lokalizovaný v tranzitní zóně cilí, z této pozice kontroluje proteinové složení té které cílie -Tmem10ý mutant vytvořen cílenou genovou rekombinací, která má za následek snížení počtu cílií a disrupci Hh signalizace v několika cílových orgánech Odkaz na článek: https://journals.sagepub.com/doi/pdf/10.1177/0022034517732538 Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 79 Další informace a zajímavosti https://www.mousephenotype.org/ https://www.jax.org/ ̶Příručka správné manipulace s laboratorními myšmi http://www.usp.br/bioterio/Artigos/Procedimentos%20experimentais/Handling-3.pdf ̶ Adobe Systems Další zástupci hlodavců využívaných v laboratořích ̶Křeček zlatý, syrský (Mesocricetus auratus) ̶ Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 80 Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 81 Prase domácí (Sus scrofa f. domestica) Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 82 Úvod ̶Domestikováno mezi 9.-7. tisíciletím př.n.l., primárně chováno na maso, jako experimentální zvíře využíváno od čtyřicátých let minulého století ̶Třída: savci (Mammalia) ̶Řád: sudokopytníci (Artiodactyla) Čeleď: prasatovití (Suidae) Guttierez et al, 2015 Zdroj: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fgene.2015.00293/full Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 83 Úvod ̶Model pro studium mnoha humánních chorob (včetně alkoholismu, melanomů, aterosklerózy, hypertenze apod.), chirurgických postupů a vývojových procesů Kuzmuk and Schook, 2010 Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 84 Ze všech modelových organizmů jednoznačně nejpodobnější člověku (anatomicky i co do velikosti genommu) Náročný a nákladný na chov Možnost vytvoření transgenních modelů Nutnost zabít matku při odběru embryí, dlouhá doba březosti (115 dní) Zaškrtnutí Zavřít Výhody vs. Nevýhody prasete jako experimentálního modelu Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 85 Vývojová biologie Příprava transgenních prasat ̶díky podobnosti s člověkem velký předpoklad testování potenciální léčby (nejen) pro dědičně podmíněná onemocnění ̶Transgeneze též umožňuje upravit genom prasat tak, aby bylo možné je použít při xenotransplantacích (snaha o snížení rejekce xenograftu) ̶ ̶Huntingtonova choroba Centrum Pigmod (ÚŽFG AV ČR) – příprava transgenních mini prasat nesoucích stejné mutace v genu HTT jako pacienti trpící Huntingtonovou chorobou Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 86 Vývojová biologie ̶ ̶Studium dentice prasat – dvě generace zubů (stejně jako člověk) – velká podobnost Putnova et al, 2017 https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fphys.2017.00029/full Adobe Systems Bi1130 - Modelové organizmy ve vývojové biologii - obratlovci 87 Děkujeme Vám za pozornost