Terénní predeterminace, nativní preparáty, bioindikace • Terénní predeterminace •Barva: tmavě zelená: sinice, světle zelená: zelené řasy, hnědá: rozsivky, červená/oranžová: zelené řasy s karotenoidy •Vlákna? •Slizké (spájivky) versus drsné (zelené řasy-Cladophora, Oedogonium) •Jak dobře drží na substrátu? •Chara •Nostoc • • • • •http://galerie.sinicearasy.cz/ • https://www.asturnatura.com/especie/chara-vulgaris Obsah obrázku tráva, exteriér, rostlina, stojící Popis byl vytvořen automaticky Nostoc commune Nativní preparát •Před fixací prohlédnout ideálně do 48 hodin •Fotodokumentace •Zaznamenání stavu organismů •Poměr živých rozsivek a prázdných schránek •Kolonie? •Odhadní stupnice •Počítání v Cyrusově komůrce Počet buněk na 1ml • • • • Na rastru počítací komůrky je vyryta mřížka složená ze základních čtverců o velikosti 250 × 250 µm umístěných ve 40 řadách ve vodorovném i ve svislém směru (tj. celkem 1 600 čtverců). Plocha komůrky odpovídá 100 mm2, hloubka 0,1 mm a objem 10 mm3 Počet buněk na 1 ml: 10 000 x Vfin Vinic x n x P a x a = počet jedinců nebo buněk v n čtvercích Vinic = objem centrifugovaného vzorku v ml Vfin = objem zahuštěného vzorku v ml n = počet vyšetřených čtverců P = plocha jednoho čtverce v mm2 . Kolonie a coenobia jsou považovány za jednoho jedince Taxonomie v algologii •Holistický přístup •Optická mikroskopie •SEM •TEM •Molekulárně biologická data (databáze NCBI https://www.ncbi.nlm.nih.gov) •Ekologická data, barviva, křížící experimenty • •Používané zkratky: •Phormidium sp. •Phormidium cf. nigrum •Phormidium aff. nigrum • Biologické hodnocení kvality vody •Použití bioindikátorů •Schopnost odrážet změny prostředí •Schopnost určit stupeň degradace vodního prostředí •Evropská rámcová směrnice o vodách (2000) – přesně definované požadavky na hodnocení vod v rámci EU: vyhodnocování na základě odchylek od referenčního stavu toku •Referenční tok – antropogenně nenarušený •Směrnice zahrnuje makrofyta, ryby, fytobentos, bezobratlé •Fytobentos: nárostové společenstvo řas • • • • • Rozsivky jako bioindikátory • velmi krátký generační čas- vysoká frekvence dělení • schopny indikovat změny prostředí v krátkém čase • •Rozsivky jsou schopné indikovat: • •organické znečištění •acidifikaci •trofii toku •přítomnost těžkých kovů •případně radiaci •klimatické změny v paleoekologických studiích • Hodnotící metriky-rozsivkové indexy •Metriky založené na autekologii druhů •přesně definované ekologické valence druhů •všech 17 se dá spočítat v programu OMNIDIA (Lecointe et al 1999) •11000 taxonů s přiřazenými indikačními hodnotami •Většina indexů vychází z indexu dle Zelinky a Marvana (1961) • • TDI •Trophic diatom index (Kelly and Whitton 1995) •Interpretace struktury rozsivkových nárostů v závislosti na koncentraci živin v řekách •Schopnost odlišit eutrofní vody od organicky znečištěných •Součástí výpočtu je stanovení procenta tolerantních druhů k znečištění (suma valv taxonů se širokou ekologickou valencí) • Index = å aj vj sj • -------------- • å aj vj • •aj= relativní početnost druhu j ve vzorku •vj= indikační hodnota druhu j •sj= citlivost k znečištění • hodnoty indexu v rozmezí 1 (velmi čistá voda) – 5 (velmi znečištěná voda) • • LBI •Lange Bertalot index •Rozsivky rozděleny do 3 kategorií: • 1) tolerantní k znečištění • 2) středně tolerantní k znečištění • 3) citlivé k znečištění • • å aj vj • Index = --------------- • å aj • •aj= relativní početnost druhu j ve vzorku •vj= indikační hodnota druhu j • hodoty indexu v rozmezí 1 (velmi znečištěná voda) - 3 (velmi čistá voda) • SSI •SSI –Sensitive Species index • •Hodnota indexu odpovídá procentu druhů citlivých k znečištění, které se vyskytují ve vzorku. Druhy s hodnotou 3 jsou citlivé (senzitivní). • •Tabulka stejná jako pro výpočet LBI indexu • •Čím vyšší hodnota, tím čistější voda TSI •TSI –Tolerant Species index • •Hodnota indexu odpovídá procentu druhů tolerantních k znečištění, které se vyskytují ve vzorku. • •Čím vyšší hodnota, tím špinavější voda • • GDI •Generic diatom index (Coste and Ayphassorho 1991) •Minimalizuje chyby způsobené chybnou determinací druhů •Determinace jen na rodovou úroveň •Překvapivě přesný (ale nutnost revize) • å aj vj sj • Index = -------------- • å aj vj • •aj= relativní početnost rodu j ve vzorku •vj= indikační hodnota rodu j •sj= citlivost k znečištění • hodnoty indexu v rozmezí 1 (velmi znečištěná voda) – 5 (velmi čistá voda) •(opačně než u TDI) • • ______________________________________________________________ druh počet relativní početnost ______________________________________________________________ Achnanthes minutissima 257 0.643 Fragilaria vaucheriae 42 0.105 Synedra pulchella 29 0.073 Gomphonema parvulum 14 0.035 Synedra tenera 8 0.020 Cymbella affinis 7 0.018 Cocconeis pediculus 6 0.015 Cymbella silesiaca 5 0.013 Fragilaria capucina 4 0.010 Gomphonema minutum 4 0.010 Nitzschia capitellata 4 0.010 Navicula gregaria 3 0.008 Nitzschia palea 3 0.008 Navicula lanceolata 2 0.005 Nitzschia microcephala 2 0.005 Nitzschia rosenstockii 2 0.005 Nitzschia supralitorea 2 0.005 Synedra fasiculata var truncata 2 0.005 Achnanthes lanceolata 1 0.003 Caloneis bacillum 1 0.003 Cymbella sp1 1 0.003 Fragilaria construens f. venter 1 0.003 _______________________________________________________________ celkem valv 400 celkem druhů 22 Ukázkový vzorek pro výpočet indexů Co nás čeká příště •25.4. 16:00 • •Kultivační média •Kultivace na agaru • •Výroba trvalých naphraxových preparátů •Kvantifikace rozsivek