Adobe Systems Mgr. Kateřina Dadáková, Ph.D. 1 Rostlinné biotechnologie Adobe Systems 2 Biotechnologie Moderní rostlinné biotechnologie zahrnují především rostlinné tkáňové kultury a genové inženýrství. https://doi.org/10.1016/B978-0-12-381466-1.00009-2 Adobe Systems 3 Rostlinné explantáty ̶Ne příliš malý kus mladé zdravé tkáně odebrané ideálně na jaře ̶Výběr vhodného explantátu ̶Pro množení postranní pupen ̶Pro přípravu kalusové kultury nejčastěji děložní lístek nebo hypokotyl ̶Pro izolaci protoplastů list ̶ ISBN-13: 978-0124159204 Adobe Systems 4 Kalusové kultury ̶V místě poranění tvoří rostlina hojivé pletivo (kalus) ̶První úspěšně kultivovaná byla nediferencovaná meristematická tkáň ̶Po objevu hormonů i (částečně) diferencované kalusové kultury ̶ Obsah obrázku text Popis byl vytvořen automaticky http://www.plantphysiol.org/cgi/doi/10.1104/pp.104.900160 Adobe Systems 5 Buněčné suspenzní kultury ̶Vznikají rozsuspendováním kousků kalusu v živném médiu ̶Média obsahují zdroj uhlíku, dusičnany a amonné ionty, další soli obsahující všechny potřebné prvky, vitaminy a hormony ̶Nejčastější média: Murashige and Skoog, Gamborg, Nitsch and Nitsch Adobe Systems 6 Využití rostlinných tkáňových kultur v primárním výzkumu ̶Studium primárního i sekundárního metabolismu ̶Izolace organel ̶Studium morfogeneze, organogeneze a embryogeneze ̶Studium interakcí rostlin a mikrobů ̶ https://doi.org/10.1105/tpc.113.116053 Adobe Systems 7 Využití rostlinných tkáňových kultur pro mikropropagaci ̶Množení in vitro ̶Nejrozšířenější komerční aplikace ̶Zkrácení cyklu, vysoký množitelský koeficient, možnost načasování, dobrý zdravotní stav ̶Nutnost aklimatizace ̶ Adobe Systems 8 Využití rostlinných tkáňových kultur pro skladování a převoz ̶Příprava rostlinného materiálu neobsahujícího mikroorganismy (především viry) ̶Skladování ̶Převoz přes hranice Retno Mastuti: Plant Physiology Adobe Systems 9 Využití rostlinných tkáňových kultur pro tvorbu produktů ̶Rostlinné sekundární metabolity s využitím ve farmacii nebo průmyslu ̶Komerčně ve velkoobjemových reaktorech ̶Využití vysoce výnosných kmenů/mutantů nebo stimulace DOI: 10.3109/07388551.2014.923986 Adobe Systems 10 Selekce s využitím markerů ̶Místo sledování fenotypu sledujeme při šlechtění přímo požadované geny nebo obecně sekvence spojené s daným znakem (markery) ̶Vhodné pro fenotypové znaky kódované malým počtem genů (rezistence k patogenům) http://www.knowledgebank.irri.org/ http://www.knowledgebank.irri.org/ricebreedingcourse/image106.gif Adobe Systems 11 Využití rostlinných tkáňových kultur pro genetickou modifikaci rostlin ̶Genetické transformace buněk, tkání a orgánů ̶Produkce cisgenních a transgenních rostlin (mezidruhových a mezirodových hybridů) ̶ ̶ Adobe Systems 12 Genetické modifikace rostlin Adobe Systems 13 Genetické modifikace rostlin ̶Rekombinantní DNA (z více zdrojových organismů) ̶Bakteriální geny kódující proteiny rezistence (insekticidní proteiny, chaperony, enzymy degradující herbicidy) vložené do DNA plodin ̶Využití RNA interference expresí fragmentů viru hostitelskou rostlinou Obsah obrázku mapa Popis byl vytvořen automaticky Adobe Systems 14 Technologické přístupy ̶Tzv. gene gun (DNA navázaná na částice kovu) ̶Transformace pomocí agrobakterií (přirozeně schopné přenášet genetický materiál) ̶CRISPR/Cas (využití bakteriálního antivirového systému) Adobe Systems 15 Gene gun ̶Izolace požadovaného genu ze zdrojového organismu, sestavení funkčního konstruktu (promotor, gen, markerové geny atp.) ̶Inkorporace konstruktu do vhodného plazmidu ̶Pokrytí kovových (zlato, wolfram) částic plazmidem Obsah obrázku osoba, interiér, ruka, rostlina Popis byl vytvořen automaticky Adobe Systems 16 Gene gun ̶Částice urychlené stlačeným vzduchem pronikají buněčnou stěnou i plasmatickou membránou buněk (obvykle kalus) ̶Náhodná inkorporace transgenu do chromosomové nebo plastidové DNA u některých buněk ̶Selekce transformovaných buněk, regenerace rostlin https://istudy.pk Adobe Systems 17 Transformace pomocí agrobakterií ̶Agrobacterium tumefaciens je fytopatogenní bakterie (nádorová onemocnění) ̶Ti plazmid obsahuje T-DNA, schopnou začlenit se do genomu rostlin ̶ Adobe Systems 18 Transformace pomocí agrobakterií ̶Umělé Ti plazmidy s požadovaným genem a markerovými geny jsou namnoženy v E. coli a vloženy do A. tumefaciens ̶Tzv. helper vector kóduje proteiny, které umožní přenos T-DNA ̶Infekce rostlinných buněk, selekce, regenerace ̶ https://www.open.edu/ Adobe Systems 19 Editace genomu ̶Využívá nukleasy specifické pro určité sekvence (např. CRISPR/Cas9) ̶Změna konkrétního lokusu DNA – knockout konkrétního genu nebo začlenění transgenu ̶První plodiny s editovaným genomem se objevují na trhu v USA a v Kanadě (řepka, sója) https://www.nap.edu Adobe Systems 20 CRISPR/Cas ̶CRISPR/Cas nejméně komplikovaná (stejná nukleasa pro editaci různých sekvencí) ̶Výběr genu a návrh gRNA ̶Klonování gRNA do vhodného vektoru (obsahuje i sekvenci pro Cas9) ̶Vložení do cílové rostliny a selekce ̶ ̶ https://doi.org/10.3389/fpls.2018.00985 Obsah obrázku text Popis byl vytvořen automaticky Obsah obrázku text Popis byl vytvořen automaticky Adobe Systems 21 CRISPR/Cas https://www.nap.edu Tomáš Moravec | 2. 10. 2017 | Vesmír 96, 576, 2017/10 Adobe Systems 22 Přínosy rostlinných biotechnologií ̶Zvýšení produkce plodin ̶Omezení použití pesticidů a umělých hnojiv ̶Zvýšení výživové hodnoty potravin (vitaminy, minerály) ̶Podpora ekonomiky chudých zemí Obsah obrázku tráva, rostlina, exteriér, zelená Popis byl vytvořen automaticky Adobe Systems 23 Rizika rostlinných biotechnologií ̶Ztráta biodiverzity (preference monokulturního pěstování vysoce výnosných odrůd, migrace genů opylením příbuzných druhů) ̶Rozšíření geneticky zvýhodněných invazivních druhů ̶Zdravotní riziko (alergeny) Adobe Systems Další možnosti rostlinných biotechnologií... ̶https://www.ted.com/talks/joanne_chory_how_supercharged_plants_could_slow_climate_change?utm_campa ign=tedspread&utm_medium=referral&utm_source=tedcomshare ̶