Projekt ITS
Jan Böhm
RECETOX
February 17, 2023
Jan Böhm (RECETOX)
□        S> - =
February 17, 2023
vT) c\
1/6
O co jde?
Oficiální zadání
Atopic dermatitis - The step of isolating microbial DNA from samples (skin and buccal mucosa swabs) is crucial for a comprehensive determination of the microbiome, especially in the case of possible occurrence of barely lysing bacteria on the skin. We isolated skin and buccal mucosa swab samples without enzymes or with a combination of enzymes to define how the lysis of the human skin microbiome is affected by enzyme treatments.
Jan Bohm (RECETOX)
□        S> - =
February 17, 2023
2/6
Jaké jsou cíle?
• Data připravit na analýzu.
• Vizualizovat rozdíly mezi výsledky v závislosti na použitých enzymech.
• Tyto rozdíly identifikovat a pokud to bude možné, zjistit zda rozdíly jsou statisticky významné.
• Výsledky odevzdat ve formě reportu.
Jan Bôhm (RECETOX)
February 17, 2023 3/6
Co se naučíte?
• Zdokonalíte se s Qř.
o Preprocessing microbiálních dat. o Práce s mnohodimenzionálními daty
• Práce s kompozičními daty.
• Vhodné testy, vizualizace
• Průběžná tvorba dokumentace a reportu.
Jan Bôhm (RECETOX)
February 17, 2023 4/6
Proč je to dobrý projekt?
• Užitečná práce.
• Zajímavý problém.
9 Šablona pro report, manuál pro grafický design.
• Máme data, můžete začít hned pracovat.
• Jasně stanovený cíl.
9 Můžete se hodně naučit.
Jan Bóhm (RECETOX)
□        dš1 ► ■<     ►      =        =     •0 0,0 February 17, 2023 5/6
r seethe raam
YOľR GUT tfPCRCfcWE 15 OT0F BALANCE.
ONE MOMENT
I THINK tfXJ MEAN
...RIGHT?
NO. HERE, 5UALLDU THIS.
TriflT5 ft UOLF
POvOU NEEP A OA5S0FUATER?
Zdroj: https://xkcd.com/1471/
Jan Bôhm (RECETOX)
□       [3i        -        =        s    -o Q, O February 17, 2023 6/6