BÍ6400
Metody molekulární biolog
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. prof. Mgr. Petr Beneš, Ph.D. Mgr. Jarmila Navrátilová, Ph.D. prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr.
Osnova
Purifikace a separace nukleových kyselin
- Extrakce a purifikace
- Centrifugační techniky
- Separace (elektroforéza) nukleových kyselin Manipulace s nukleovými kyselinami
- Enzymy používané k úpravám nukleových kyselin
- Hybridizace nukleových kyselin
- Klonování DNA
Vektory pro klonování Techniky klonování Exprese in vitro
Amplifikace nukleových kyselin
- Oligonukleotidy
- Polymerázová řetězová reakce, princip, aplikace
- Izotermní amplifikace Stanovení sekvence DNA Transgenika
- Transfekce
- Cílené zásahy do genové exprese Analýza genové exprese
- Studium transkripce
- Analýza promotorů a interakcí protein-DNA
- Analýza epigenetických modifikací DNA a histonů
- Analýza translace
- Analýza mezi proteinových interakcí Molekulární diagnostika
- Detekce polymorfizmu v genomech
- Přímé a nepřímé metody molekulární diagnostiky Proteomické přístupy v molekulární biologii
- Hmotnostní spektrometrie
Doporučená literatura
ŠMARDA, J. - DOŠKÁŘ, J. -PANTŮČEK, R. - RŮŽIČKOVÁ, V. -KOPTÍKOVÁ, J. Metody molekulární biologie. Brno : Masarykova univerzita, 2005. ISBN 80-210-3841-1.
BROWN, T. A.: Klonování genů a analýza DNA. Český překlad M. Fellner a kol. 1. české vyd. Olomouc: Univerzita Palackého 2007. ISBN 978-80-244-1719-6.
METODY
MOLEKULÁRNÍ
BIOLOGIE
Jan Šmarda, Jiri Doškář, Roman Pantůček, Vladislava Růžičková, Jana Koptíková
KLONOVÁNÍGENU A ANALÝZA DNA
Úvod
T. A. BROWN
Další doplňující literatura
• Snustad, D.P. Genetika. Český překlad 2. české vyd. Brno MUNI Press 2017, 864 stran, ISBN 978-80-210-8613-5
• Alberts B. - Bray D. - Johnson a. - Lewis J. - Raff M. - Roberts K. - Walter R: Základy buněčné biologie. Český překlad Espero Publishing, Praha 2005. ISBN 80-902906-2-0.
	GENETIKA D. Peter Snu slad Michael I Simmons Druhé, aktualizované vydáni		
_		i i i ■ i	
Základy
buněčné bjolofi*
Uvodilo mtHckuíirni ^Icflie buňky
Doporučená prakticky orientovaná
literatura
• Green M.R. - SambrookJ.
Molecular cloning: a laboratory     Molecular cloning
A   LABORATORY MANUAL
manual, 4th edition. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, USA (2012).
Sambrook and Russell ď|prI
Požadavky k ukončení kurzu
• Důraz kladen na
- Důležitá fakta, termíny, klasifikace technik, definice
- Pochopení principů metod
- Aplikace vhodných metod pro řešení zadaných problémů
• Písemný test ke zkoušce
- 50 otázek
- 60 min.
- více správných variant, penalizace za nesprávné odpovědi, nutno získat 21 bodů a více.
• Písemný test ke kolokviu (program B-MBB)
- 40 otázek
- 50 min.
- Jedna správná odpověď, nutno získat 20 bodů.
Hodnocení testu ke zkoušce
Za každou správné zodpovězenou (vybrány všechny správné varianty) otázku je 1 bod
S	50% S	33%	S	25%	S	20%
s	50% S	33%	S	25%	S	20%
	S	33%	s	25%	s	20%
s	100%		s	25%	s	20%
N	-100% s	50%			s	20%
	s	50%	s	33%		
	>	-50%	s	33%	s	25%
			s	33%	s	25%
	s	100%	N	-33%	s	25%
	>	-50%			s	25%
	N	-50%	S s	50% 50%	N	-25%
			N	-50%	S	33%
			N	-50%	s s	33% 33%
			S	100%	N	-33%
			N	-50%	N	-33%
			N	-50%		
			N	-50%	S S	50% 50%
					x N N	-50% -50% -50%
	ZNÁMKOVÁNÍ (POUZE ORIENTAČNĚ): 0-20 bodů F 21-26 bodvi E       33% a více					
	27-32 bodli D 33 - 38 bodů C 39 _44 bodů B 45 - 60 bodli A				S N N N	100% -50% -50% -50%
					X	-50%
Program přednášek v IS
Sylabus BÍ6400 Metody molekulární biologie JS2025
18.02.2025
25.02.2025 04.03.2025
11.03.2025 18.03.2025 25.03.2025 01.04.2025 08.04.2025 15.04.2025 22.04.2025 29.04.2025 06.05.2025 13.05.2025 20.05.2025
01_Úvod
02_lzolace nukleových kyselin (R. Pantůček) Teoretický úvod ke cvičení (P. Beneš) 03_Elektroforéza (R. Pantůček) 04_Centrifugace (R. Pantůček) 05_Enzymy (J. Navrátilová) 06_Hybridizace (R. Pantůček) 08_PCR (R. Pantůček)
09_Sekvenování (R. Pantůček) 07_Vektory pro klonování (P. Beneš) 10_Přenosy DNA do buněk (J. Navrátilová) ll_Analýza transkripce (J. Navrátilová) 12_Analýza translace (P. Beneš) 13_Regulace a zásahy do genové exprese (P. Beneš) 14_Principy molekulární diaknostiky (R. Pantůček) 15_Aplikace hmotnostní spektrometrie (Z. Zdráhal)