Adobe Systems Alimentární virové nákazy Alimentary infections of the gastrointestinal tract Adobe Systems Čel: Reoviridae ̶hostitelé: obratlovci, bezobratlí, rostliny, houby, kvasinky, baktérie ̶tropizmus: obratlovci (obratlovci buňky střeva-enterocyty, bezobratlí/hmyz-midgut, rostliny-floém) ̶onemocnění: GIT trakt ̶přenos: fekálně-orální (u obratlovců) ̶neobalený, ikozaedrální symetrie, trojitý kapsid (vnější T13 symetrie a vnitřní T2 symetrie, proteiny VP2, VP6, VP7 - kapsid, velikost virionu 75nm ̶segmentovaný lineární dsRNA genom (třída III.), 18-32kb, 9-12 segmentů kódujících 10-14 proteinů ̶každý segment kóduje 1 protein, vyjímka: jeden ze segmentů kóduje 2 proteiny, tj. 11 segmentů - celkem kódováno 12 proteinů (6 strukturních a 6 nestrukt.) ̶virová RNA polymeráza produkuje mRNA z každého segmentu ̶mRNA lokalizována v cytoplazmě, kde dochází k translaci ̶ Adobe Systems Segmenty RNA u reovirů C:\Users\rudolf\Pictures\Moje naskenované obrázky\2015-03 (březen)\skenování0011.jpg jedinečné sekvence v každém segmentu-správné sestavění do virionu Carter and Saunders, 2013 Adobe Systems Strategie replikace u reovirů Replikace v cytoplazmě hostitelské buňky -vstup do buňky (1) endocytózou nebo (2) přímou penetrací přes membránu: štěpení receptorů VP4 (spike) na VP8 a VP5 a připojení ke kys. sialové a integrínům - způsobeno enzymy střeva (trypsin) -dsRNA genom není nikdy kompletně odhalen (ochrana proti antivirové aktivitě buňky proti dsRNA - proteiny PKR-inhibují buněčnou translaci a indukují apoptózu; MDA – aktivují interferon a kaskádu dalších reakcí) Transkripce/translace -po infekci je genomická dsRNA transkribována do mRNA (early mRNA), které slouží jak pro translaci (produkce proteinů pro replikaci-nestrukturní a enkapsidaci-strukturní) tak pro replikaci Replikace -replikace v cytoplazmě, kde (ss)RNA konvertuje do podoby genomické dsRNA -replikace/transkripce probíhá uvnitř kapsidu, aby nedošlo k nastartování obranných mechanizmů buňky viriony uvolněny po lýze buňky (indukovaná apoptóza) anebo exocytózou - PKR is in the center of cellular response to different stress signals such as pathogens, lack of nutrients, cytokines, irradiation, mechanical stress, or ER stress. Adobe Systems Transkripce u dsRNA virů C:\Users\rudolf\Pictures\Moje naskenované obrázky\2015-03 (březen)\skenování0013.jpg C:\Users\rudolf\Pictures\Moje naskenované obrázky\2015-03 (březen)\skenování0014.jpg 'Early events' 'Late events' - syntéza VP7 a NSP4 na drsném ER -NSP4 má afinitu k pro VP4 -po vazbě dochází k pučení přes mem. ER do vezikulu (dočasný obal) - VP4 tvoří výběžky (spikes) a VP7 vnější vrstvu kapsidu Carter and Saunders, 2013 Adobe Systems C:\Users\rudolf\Pictures\Moje naskenované obrázky\2015-03 (březen)\skenování0015.jpg Replikační strategie dsRNA virů (shrnutí) Carter and Saunders, 2013 Payne, 2017 Adobe Systems Infekce vyvolané reoviry Rotavirus, u lidských rotavirů je známo 10 sérotypů G a 8 sérotypů P (možná kombinace segmentů), převládají 4 kmeny, sérotyp 1 skupiny A u 53% infekcí Rezistentní v prostředí – éter, chloroform, teploty 50°C, přežívají na předmětech a na rukou Epidemiologie: průjmová onemocnění (zejména u novorozenců), zvířecí druhy obvykle nezpůsobují onemocnění u lidí Kosmopolitní výskyt, nejčastější původce akutních gastroenteritid u dětí do 5 let Masivní výskyt: porodnice, kojenecké ústavy, jesle, mateřské školy V ČR evidováno 2-4 tis. onemocnění ročně U nás sezónní výskyt: zima a jarní měsíce Nejvíce postiženou skupinou jsou děti od 6 měsíců do 5 let (u novorozenců a dětí do 2 měsíců probíhá asymptomaticky) U dospělých symptomaticky především rodiče, lidé s imunodeficitem, cestovatelé, nosokomiální nákazy na dětských odděleních (kombinace faktorů - vysoká odolnost viru a malá infekční dávka) Přenos: fekálně-orální, (kapénkově) Primoinfekce: stačí 10 rotavirových částic k vyvolání příznaků, ve stolici akutně nemocných 109 až 1011 virových částic na 1ml stolice Adobe Systems Infekce vyvolané reoviry Patogeneze: virus napadá enterocyty v tenkém střevě a působí také virovým enterotoxinem (NSP4) Inkubační doba: 1-3 dny Klinický obraz: 50% případů asymptomatických Manifestující onemocnění: triáda příznaků (horečka, zvracení, vodnatý průjem až 10x denně), ve stolici ojediněle hlen a krev Nechutenství, meteorismus, bolesti břicha (u dětí), postižení dýchacích cest Po 5-8 dnech náhlý ústup příznaků, po odeznění příznaků viru vylučován dalších 10 dnů Komplikace: dehydratace (úbytek hmotnosti 5-10%), malabsorpční syndrom s protrahovanými průjmy Vzácně: aseptická meningitida, akutní myozitida, nekrotizující enterokolitida, pneumonie, syndrom náhlého úmrtí kojence (SSDI), Crohnova choroba, HUS Diagnostika: latexová aglutinace, ELISA, imunochromatografie, EM Léčba: rehydratace, příjem minerálů, realimentace, probiotika, antipyretika, antiemetika, smecta Prevence: důsledná hygiena, dekontaminace předmětů (nemocnice) 2 perorální živé atenuované vakcíny (Rotarix a Rotateq) http://pathmicro.med.sc.edu/virol/rota-cdc2.jpg Adobe Systems Distribuce rotavirových infekcí ve světě More than 600,000 young children die and approximately 2.4 million hospitalize annually from rotavirus disease, especially in South-East Asia and sub-Saharan Africa... Two safe and effective vaccines are now licensed in 100 countries but used in 17 countries. Rotarix (GSK) vaccine is derived from single attenuated human rotavirus G1P[8], representative of the most common serotype identified worldwide. RotaTeq (Merck) is a pentavalent mixture of naturally attenuated bovine/human rotavirus reassortants representing G1, G2, G3, G4, and P[8] serotypes. Adobe Systems Virová hepatitida A (Benigně) probíhající hepatitida bez přechodu do chronicity Epidemiologie a přenos: vylučování viru stolicí (fekálně-orální přenos-znečištěné ruce, kontamin. voda a potraviny); Celosvětově ročně hlášeno asi 1,5 mil. klinických onemocnění ČR: poslední největší epidemie (kontamin. jahodová dřeň z Polska, několik tis. lidí), dnes stovky případů (2008-bezdomovci, narkomané), epidemie v EU 2012-13 (1300 případů, 11 států EU: produkty z kontaminovaného ovoce), 2016-změna epidemiologie v EU (rizikové chování u homosexuálů) Etiopatogeneze: jaterní postižení vyvolané imunitní reakcí navozenou vir. infekcí (imunita celoživotní) Inkubační doba: 15-50 dní, většinou měsíc Klinický obraz: závisí na věku infikovaného (v rozvojových zemích infekce v časném věku-klinicky nevýznamné-horečka, nauzea, zvracení, průjem), v rozvinutých zemích nákaza dětí i dospělých-průběh klinicky vážnější (žloutenka) Prodromální stádium: nauzea, bolesti břicha, průjem Diagnostika: klinický obraz (bezbolestný ikterus), zvýšené hladiny aminotransferáz (ALT, AST) Sérologie: anti-HAV-IgM (akutní infekce) Léčba: symptomatická na nemocničním lůžku (klid, šetřící dieta, vitaminy, hepatoprotektiva) Prevence: aktivní a pasivní imunizace Aktivní: inaktivovaná vakcína (cestovatelé a vojáci cestující do endemických zemí - Afrika, Jižní Amerika, Střední Východ; zdravotnický personál, rizikové skupiny: narkomané) Možná současná vakcinace proti hepA a hepB Pasivní: podání imunoglobulinu (osoby v těsném kontaktu s nemocným, u nemocných zmírňuje příznaky onemocnění) Adobe Systems Akutní virová hepatitida A v ČR (1985–2013) EPIDAT Adobe Systems Infekce vyvolané noroviry a (sapoviry) Taxonomicky: čel: Caliciviridae Norovirus (viry Norwalk a Norwalk-like) poměrně rezistentní v prostředí Přenos: fekálně-orální (kontaminovaná pitná voda, nevařené potraviny (jahody, maliny, saláty, moučníky, mořští živočichové), infekce po koupání v bazénech, stačí malá inf. dávka (10 PFU), odolné podobně jako rotaviry Epidemiologie: v rozvojových zemích onemocnění malých dětí, v rozvinutých zemích starší děti a dospělí (zimní měsíce - 'winter vomiting'), v USA až polovina gastroenteritid (23 mil. případů ročně) Explozivní vodní alimentární epidemie, nemocnice, léčebny a geriatrická zařízení, zaoceánské lodě Nejčastější původci gastroenteritid větších dětí a dospělých Inkubační doba: 1-2 dny Klinický průběh: bolesti břicha, zvracení, křeče, zimnice, horečka, bolest svalů a hlavy, vodnatá stolice, někdy asymptomatický průběh Krátký, ale prudký průběh, onemocnění rychle odezní (do 48 hodin) Diagnostika: průkaz metodou ELISA v nativní stolici Léčba: rehydratace Prevence: důsledná hygienicko-epidemická opatření (i při přípravě pokrmů), kontrola vodních zdrojů Adobe Systems Zápatí prezentace 13 Noroviry - přenos Adobe Systems Infekce vyvolané astroviry a toroviry Astroviry 8 lidských sérotypů Epidemiologie: nejčastěji postiženy kojenci, imunokompromitovaní pacienti, staří lidé Přenos: fekálně-orální (zdroj: kontaminované mořské pokrmy, voda) Inkubační doba: 1-4 dny Klinický obraz: vodnatý průjem, bolesti břicha, bolest hlavy, teplota, nausea, zvracení Diagnostika: EM (při velkém množství viru ve stolici), IF (sérotypy), ELISA, PCR Toroviry Čel: Coronaviridae (rod Torovirus) Klinický obraz: vodnatý průjem u kojenců (2-12 měsíců) Diagnostika: EM Adobe Systems Hepevirus hepatitidy E Adobe Systems https://pn.bmj.com/content/practneurol/17/4/282/F1.large.jpg Cirkulace viru hepatitidy E Adobe Systems Akutní virová hepatitida E v ČR 1997–2013 EPIDAT Adobe Systems Infekce enteroadenoviry Infekce střevního traktu Přenos: fekálně-orální cestou Sérotypy: Adenovirus 40 a 41 (zvažuje se účast sérotypů 1, 2, 3 a 5) Epidemiologie: vzácné, kolem 100 případů ročně v ČR Klinický průběh: akutní gastroenteritida (děti do 2 let), lehčí průběh než rotavirové infekce Diagnostika: latexaglutinační reakce, ELISA Léčba: symptomatická