KOMPLEXNÍ CHOROBY 
                                                     
                                                     



Doc. MUDr. Lydie Izakovičová Hollá, Ph.D





Ústav patologické fyziologie LF MU Brno









                                      Spektrum lidských chorob

                              Alelická architektura komplexních nemocí





























                          Molekulární základ komplexních nemocí u člověka

                    Metodologie genetického mapování komplexních znaků (nemocí)











                            Asociace je principem zcela odlišná od vazby

Linkage (vazba)  - je vztah mezi lokusy



Asociace -- je statistický údaj o společném výskytu alel či fenotypů

                   (vztah mezi alelami či fenotypy)



                                             ß



 Alela A je asociována s chorobou D, když osoby, které trpí D mají A více (nebo méně často) než lze
předpokládat z výskytu frekvencí D a A v populaci.



            !!! Problematika výběru kontrolní skupiny!!!







                                         Interakce faktorů















                                Kandidátní geny a patogeneze astmatu







                              Celogenomové analýzy a poziční klonování

                                           Gen pro ADAM33
                              (A Disintegrin And Metalloproteinase 33)



                                           Gen pro DPP10
                                     ( DiPptidyl Peptidase 10)

l      Allen et al (2003)  -  vazebnou analýzou na chromozomu 2q

l      Potvrzení TDT analýzou 144 rodin

l      Sekvenování oblasti o 1,5 MB (r)  105 SNP

                                                                  ß    

                                                  nejsilnější asociace s WTC122

               nejběžnější alela asociována s astmatem a fenotypy

                            (také haplotypy s touto alelou)

l      Case-control studie 1047 dětí z Mnichova

                                                     ß

                             asociace s prick testy, atopií a astmatem



l      Funkce: -  modulace zánětlivého procesu v dýchacích cestách ?

                     -  regulace neuronální (parasymatická ganglia) ?     

                                           Gen pro PHF11
                            ( Plant Homodomain (PHD) Finger protein-11)

l      Cookson et al.  (2003) identifikovali PHF11 na chromozomu 13q

            ß

       podobným přístupem jako u DPP10



l      49 SNP, 4 del/ins a (GGGC) repetice (r) 3 (intron 5, 9 a 3´oblast)

                                                                                ß

                                                                     associace s Ln IgE a astmatem



l      Funkce: - negativní regulace transkripce ?