rabidovsis thaliana - huseníček volní - čeleď: Brassicaceae (Brukvovité) - rozšíření: kosmopolitní, od nížin až do hor, zejména na výslunných stráních - poprvé popsána Johannesem Thalem v 16. století - celkový vzhled dospělé rostliny - k pokusným účelům poprvé využita F. Laibachem začátkem 20. století - jako model v genetice od 40. let 20. století -její význam jako genetického modelu stále roste Vvhodv A. thaliana iako genetického modelu: velmi krátká generační doba - lze získat několik generací do roka - kvete za 5-8 týdnů od vyklíčení, semena dozrávají do 2-3 měsíců od vyklíčení - genotypy rané x pozdní Astronautka Cady Coleman provádí pokus s rostlinkami Arabidopsis v průběhu letu na STS-93 (raketoplán Columbia, 1999). Paul A-L, Daugherty CJ, Bihn EA, Chapman DK, Norwood KL, Ferl RJ: Transgene expression patterns indicate that spaceflight affects stress signal perception and transduction in Arabidopsis. Plant Physiol 2001,126:613-621. Rostlinky reagují na stres ve stavu bez tíže odlišně od reakce na Zemi - pozorováno na změně exprese vneseného transgenu, zbarvení rostlin. Rostliny jsou schopny se stresem ve stavu bez tíže vyrovnat. When grown in spaceflight, the amyloplasts in the protonemata of the moss Ceratodon purpureus were found to be clustered in the subapical region, Transgenic Arabidopsis plants containing the alcohol dehydrogenase (Adh) gene promoter linked to the GUS reporter gene were used to address the possibility that spaceflight induces the hypoxia response in plants. This system also allowed the authors to assess whether responses to spaceflight produced similar gene expression patterns to those produced by terrestrial hypoxia. The patterns of gene expression associated with spaceflight were not identical to those induced by terrestrial hypoxia. This indicates either that normal hypoxia-response signaling is impaired during spaceflight or that spaceflight inappropriately induces Adh::GUS activity for reasons other than hypoxia, rather than being randomly distributed as would be projected if gravity were the major force determining the position of amyloplasts. The authors hypothesize that a microtubule-based mechanism is responsible for this phenomenon. Lizal; 3.10.2005 The plants are grown in solid media-filled test tubes and housed a middeck unit called the Plant Growth Facility. Lizal; 3.10.2005 Výhody A thaliana iako genetického modelu: velmi krátká generační doba - lze získat několik generací do roka - kvete za 5-8 týdnů od vyklíčení, semena dozrávají do 2-3 měsíců od vyklíčení - genotypy rané x pozdní nenáročnost na prostor - lze pěstovat velký počet jedinců na malé ploše (až 10 rostlin na cm2) možnost pěstování na umělých médiích - identifikace mutantů v biochemických drahách - skríning rostlin na úspěšnou transgenozi Vvhodv A. thaliana iako genetického modelu: - velký počet potomků - z jedné rostliny lze získat až několik tisíc semen - schopnost samosprášení i cizosprášení - nejmenší genom mezi vyššími rostlinami - v roce 2000 ukončen projekt sekvencování genomu Arabidopsis - 125 Mbp, 25 498 genů - malý počet chromozomů (n = 5) -------------1 - rozsáhlá kolekce mutantních linií a přírodních ekotypů vysoce účinná transformační metoda přípravy transgenních rostlin a T-DNA mutantů Kultivační nod m in k kultivace v přirozených podmínkách - v přírodě - ve skleníku kultivace v řízených podmínkách - v kultivační místnosti = vegetační období po celý rok - umělé osvětlení - krátký den - dlouhý den - nepřetržitý osvit - teplota 22 - 24°C Mutace u A. thaliana 1945 E. Reinholz - 1. kolekce indukovaných mutantů 1. použitým mutagenem u A. thaliana byly paprsky X klasická mutageneze - fyzikální mutageny (paprsky X, y aj.) - chemické mutageny (MMS, EMS) - nemutagenní látky u A. thaliana - např. etanol, některé herbicidy (azid sodný, maleinhydrazid) inzerční mutageneze - pomocí metod genového inženýrství, - „mutagenem je DNA" Pozorovaní vvbranvch mutantních linií Col {Columbia) - standardní rostlina Změnv zbarvení chm3 {chlorominuta) - dělohy a listy světle zelené, starší listy tmavší Ic {lucida) - dělohy a listy žlutozelené chl {chlorina) - dělohy a listy světle žlutozelené * Změny tvaru listů a v době kvetení pm {pumilio) - úzké listy s jedním zubem na okraji, pozdní kvetení iv {involuta) - listy drobné, složené podél hlavního žebra, velmi rané kvetení Změna celkového vzhledu rostliny cn {convoluta) - dělohy, řapíky a stonky stočené kolem své osy proti směru hodinových ručiček, listy v růžici taktéž stočené cp2 {compacta) - polozakrslé rostliny ** Pozměněná stavba trichomů gl2 {glabra) - rudimentované a chybějící trichomy sti {stichel) - nevětvené (jednočetné) trichomy * chl, gl2 ** cp2, sti standardní 3-četné trichí glabra - trichomy rudimentované nebo chybí stichel- 1-četné trichomy Pozorovaní vvbranvch mutantních linií Col {Columbia) - standardní rostlina Změnv zbarvení chm3 {chlorominuta) - dělohy a listy světle zelené, starší listy tmavší Ic {lucida) - dělohy a listy žlutozelené chl {chlorina) - dělohy a listy světle žlutozelené * Změny tvaru listů a v době kvetení pm {pumilio) - úzké listy s jedním zubem na okraji, pozdní kvetení iv {involuta) - listy drobné, složené podél hlavního žebra, velmi rané kvetení Změna celkového vzhledu rostliny cn {convoluta) - dělohy, řapíky a stonky stočené kolem své osy proti směru hodinových ručiček, listy v růžici taktéž stočené cp2 {compacta) - polozakrslé rostliny ** Pozorovaní vvbranvch mutantních linií Přiřaďte fenotyp jednotlivým číslům. Pozorovaní vvbranvch mutantních linií Col (Columbia) - standardní rostlina Změnv zbarvení chm3 (chlorominuta) - dělohy a listy světle zelené, starší listy tmavší Ic (lucida) - dělohy a listy žlutozelené chl (chlorina) - dělohy a listy světle žlutozelené * č. 1 č. 3 č. 7 Změny tvaru listů a v době kvetení pm (pumilio) - úzké listy s jedním zubem na okraji, pozdní kvetení iv (involuta) - listy drobné, složené podél hlavního žebra, velmi rané kvetení Změna celkového vzhledu rostliny cn (convoluta) - dělohy, řapíky a stonky stočené kolem své osy proti směru hodinových ručiček, listy v růžici taktéž stočené cp2 (compacta) - polozakrslé rostliny ** č. 6 Standard Col f ě^ chm3 {chlorominuta) Ic {lucida) Standard Col SEíí V-'' ^"artare^a^ g«« iv (involutd) cp2 (compacta) cn (convoluta) Soubor Úpravy Zobrazit Oblíbené Nástroje Nápověda Zpět Vpřed Zastavit Aktualizovat Domů http://www.arabidopsis.org/ 1 r^Prejít TAIR DB Genes Markers Clones Community Publication Schemas More.... News TAIR News Newsgroup Conferences & Events More.... StŮCkS UPDATE Ahmit ARPr J&> About TAIR | Sitemap | Contact | Help | Order | Login | Logout The Arabidopsis Information Resource / talr 1 site search OB search Tools SeqViewer new MapViewer BLAST update FASTA Patmatch update Gene Hunter More.... External Links Stock Centers & Resources Nomenclature Sequence Analysis Microarrays More.... Arabidopsis Info About Arabidopsis Genome Initiative update Functional Genomics Cereon SNPs Gene Families update Marker Submission HEW More.... Bietikimj News TAIR Piotein Annotation Dma [Dec 19,2001] Information and bulk data files from gene product annotation FTP Sequences update Genes Maps UPDATE How Pmmmch [Dec 12,2001] A complete overhaul ofPatMatch program. See release notes for details. il "l< Internet ► a ! Přejít 7V4SC Nottingham Arabídopsis Stock Centre řítod; Catalogue Search catalogue How to order Price information Check order progress InsertWatch InsertBlast Seed donation form Trans criptomic s GARJSTet - UK Arabídopsis functional genomics network Genomics UK CropNet - Crop plant bioinforrnatics network Training events NASC's presentations and posters at the 2001 GAPJSTet meeting Arabidopsis Genome Resource GARNet services GARNet meeting [Search AGR GO Submit RI data TÍT rnar> I Interactive TÍT man Soubor Úpravv Zobrazit Oblíbené Nástroje Nápověda n 4-Zpět T Vpřed Zastavit Aktualizovat Domů Hledat Oblíbené Média 0 Historie » Adresč http: //www. arabidopsis. conn/ CATALOG I CALENDER | COMMUNITY | GROUPS | LIBRARY | NEWS | RESOURCES | TEACHING SEARCH | CHANNEL | GOVERNMENT | JOBS | MISC. | PROJECTS | SOFTWARE | VENDORS SUBMIT FEEDBACK 4 PREVIOUS F E AT U R E SEARCH SITE 2001 ARABfDQPStS CATALOG Company Stuff T| (lehle)] WELCOME LEHLE SEEDS Your Source For Everything Arabidopsis FLASH BULLETINS NEWS WORTHY PATENTS PUBLI CATIONS REVIEW Welcome* ♦♦ Click tabs above to see weekly features. Newsworthy Highlight.... Weeks of 07-Jan-02to 21-Jan-02 Image comparing fruit of tomato grown under low salinity Oeft) with those of transgenic salt tolerant tomato grown under 200 mM NaCl. ľlmanp hu F. Rlnrvumlrl I jhnrjfnnj at- IIniifurčitú NEXT F E AT U RE ► ^ISI EMAIL THIS PAGE TO A FRIEND ARTIGEN SCIENCE. news! s LEHLE SEEDS ARABIDOPSIS CHANNEL ASPB&CSPP Joint Meeting Plant Biology 2001 Briefing Archives "rrr Internet tfStart |j (j| £ & m M Č&'Í^W'Q® 15:1! Pozorovaní monohvbridního štěDení recesivně letálního znaku albina Mutace albina patří mezi chlorofylově defektní mutace. Chlorofylově defektní mutace: chlorina xantha albina Charakteristika noužité mutace albina: albina S96 X12kr M2 klíční rostlinky bílé, bez chlorofylu; homozygotně letální Pozorování monohvbridního steDení řece í %. semena Wm • *• ^ výsev ^^ Aa presazem na novou zeminu F: A G: AA A Aa 2. g sivně letálního znaku albína IF: A | 3 : a 1 [G: AA : Aa : aa 1 : 2 : 1 1. generace Mullerův embryonální test ce G: 1 : 2 Pozorovaní monohvbridního štČDení recesivně letálního znaku albína Schéma zkrácené verze Dokusu semena ••&• Aa <ÔÄ> 1. generace