Inbridin Koeficient inbridingu - redukce heterozygotu v populaci s inbridingem relativně k populaci s panmixií H0 = 2pq H = 2pq(l-F) Četnosti jednotlivých genotypů: AA: p2 (1 - - F) + pF = p2 + pqF Aa: = 2pq - 2pqF aa: = q2 + pqF Inbridini ??? Kolikrát je vyšší pravděpodobnost objevení recesivního homozygota při příbuzenském sňatku při zadaném F? (např. F = 1/16, q = 0,01) Výpočet F z rodokmene, pravděpodobnost, že jsou alely identické původem. F, = Z(1/2)'(1 + FA) i - počet jedinců na společné dráze (počet společných předků) Inbridini PŘIKLAD 34 V populaci rostlin se smíšeným oplozením platí, že dochází-li k samooplození (samosprášení) v podílu s, zatímco zbývající část rostlin v populaci se rozmnožuje náhodným oplozením (cizosprášením), pak koeficient F velmi rychle dosáhne hodnoty F = s/(2-s) (odvození - viz speciální literatura). U Phlox cuspidata byl stanoven podíl samooplození přibližně =0,78; můžeme tedy vypočítat koeficient inbridingu =0,78/(2-0,78)=0,64. V populaci P. cuspidata v Texasu byly nalezeny dvě alely genu fosfogIukomutázy-2 označované Pgm~2° a Pgm-2b . Ve vzorku 35 rostlin bylo nalezeno 15 Pgm-2a/Pgm-2a, 6 Pgm-2a/Pgm-2b a 14 Pgm-2h/Pgm-2b. Souhlasí tyto údaje s odhadem F=0,64? ( Pamatujte, že zde je pouze jeden stupeň volnosti pro x2, poněvadž z údajů je odhadována pouze alelová četnost; kdyby z těchto údajů bylo odhadováno také F, pak by počet stupňů volnosti byl nula a výpočet by nebyl možný. Zde je F odhadováno nezávisle ze stupně samooplození). *) P - Of L h V <** ^ K,tér*«mu-*t =. Jfjit j^ ? Jaké budou počty při F = 0,64 ? ■-// yffyu J cVy/o^n /= «v». * *H f* */■ <^# ^ ^ . * / * / *. ^ Inbridin: ■ C - fu J &. Kttrs- H«t~l) ^ íS-i^ fi, ý fcr**«n é ptľv> Gp-/s jr z s, ty tyrtyfy^te % * - (?. (? ŕ C? í^ ^ ä ooo n =- OjöJ} Hodnoty X pro pravděpodobnost P - 0,95 až 0,001 pro N = 1 až 30 N 0,95 0,90 0,80 0,70 0,50 0,30 0,10 0,05 0,02 0,01 0,001 í 0,004 0,016 0,064 0,15 0,46 1,07 2,71 3,84 5,41 6,64 10,83 2 0,1O3 0,21 0,45 0,71 1,39 2,41 4,61 5,99 7,82 9,21 13,82 3 0,35 0,58 1 ,01 1,42 2,37 3,67 6,25 7,82 9,84 11,34 16,27 4 0,71 " 1 ,06 1,65 2,20 3,36 4,88 7,78 9,49 11,67 13,28 18,47 5 1,15 * 1,61 2,34 3,00 4,35 6,06- 9,24 11,07 13,39 15,09 20,52 6 1,63 2,20 3,07 3,83 5,35 7,23 10,65 12,59 15,03 16,81 22,46 7 2..1? 2,83 3,82 4,67 6,35 8,38 12,02 14,07 16,62 18,48 24,32 8 2,73 3,49 4,59 5,53 7,34 9,52 13,36 15,51 18,17 20,09 26,13 9 3,32 4,17 5,38 6,39. 8,34 10,66 14,68 16,92 19,68 21,67 27,88 10 3,94 4,87 6,18 7,27 9,34 11,78 15,99 18,31 21,16 23,21 29,59 11 4,57 5,58 6,99 8,15 10,34 12,90 17,28 19,68 22,62 24,73 31 ,26 12 5,23 6,30 7,81 9,03 11,34 14,01 18,55 21 ,03 24,05 26,22 32,91 13 5,89 7,04 8,63 9,93 12,34 15,12 19,81 22,36 25,36 27,69 34,53. H 6,5? 7,79 9,47 10,82 Í3,34 16,22 21,06 23,69 26,87 29,14 36,12 15 7,26 8,55 10,31 11,72 14,34 17,32 22,31 25,00 28,26 30,58 37,70 16 7,96 9,31 11,15 12,62 15,34 18,42 23,54 26,30 29,63 32,00 39,25 17 8,67 10,09 12,00 13,53 16,34 19,51 24,77 27,59 31 ,00 33,41 40,79 18 9,39 10,87 12,86 14,44 17,34 20,6.0 25,99 28,87 32,35 34,81 42,31 19 10,12 . 11,65 13,72 15,35 18,34 21,69 27,20 30,14 33,69 36,19 43,82 20 10,85 12,44 14,58 16,27 19,34 22,78 28,41 31,41 35,02 37, vr 45,32 % *- - Í 99lf- Ý Ot tíh f Ot 0»° Íl a Oj0jj_ f*o,H r-ä^h 9sr JM&&4 \ŕporoty/ e&ftrft, fa\ Inbridin: Inbridini PRÍKLAD 35 V určité populaci Phlox cuspidata je F=0,64, Vypočtěte očekávané gcnotypové četnosti pro gen Adh za použití údajů z příkladu 17. PŘIKLAD 17 V určité populaci Phlox cuspidata byly nalezeny čtyři alely genu pro alkoholdehydrogenazu označené Adh-1, Adh-2, Adh-3 a Adh-4 v četnostech 0,11; 0,84; 0,01 a 0,04. Jaké jsou očekávané Hardyho -Weinbergovy genotypové četnosti? MW Mh1 7 ocWfe Gé-//»ns erhoff) ^c &fr '/<*# 2 40"^ -0 - Sfif 1 I J/f-J/f/1 ^ /r-^ý - -ý I I *■& 4-' W M- oar rtty^tttf •/ s l ŕ a * /- *#,-? - (/ f? f. tJk'*>'~él,H ď&Q f 2-3 3 3 <ŕ 4 1 ^ ^ í ^V^f, 4 £ Inbridini PŘIKLAD 36 Vypočtěte relativní riziko narození recesivně homozygotnich potomků ze sňatku bratrance se sestremcí z druhého kolena (F^l/64), jestliže četnost recesivní alely q =0,01, relativně k riziku při náhodném oplození. ((■l-F) tiit fywřd-ph- fl/GQQsf Ift ľ) %iufr fa ^r> \M$/ uf to /AfTtiovi. ófyfro/át>\ PŘIKLAD 37 Nakreslete rodokmen křížení bratr x sestra opakujícího se po dvě generace (CxD a ExG) a vypočtěte koeficient inbidingu jejich potomka I, za předpokladu, že žádný ze společných předků (A a B) není inbrední. Žádný z předků není inbrední —► FA = 0 F, = 1(1/2)'(1+FA) 6 cest přenosu se 4 společnými předky F, = I(1/2)'(1 + FA) F = 2 (1/2)3+ 4 (l/2)5 = 3/8 tj. 0,375