Výpočet aleloyf ch četností V populaci 100 jedinců byly zjištěny následující počty pro jednotlivé genotypy: AA = 36, Aa = 48, aa = 16. Vypočítejte alelové četnosti p (A) a q (a). AA Aa aa Z 36 48 16 100 A: 72 48 0 120 a: 0 48 32 80 200 p = 120/200 = 0,6 q = 1 - p = 0,4 Výpočet aleloyf ch četností Ze známých genotypových četností vypočítejte četnosti alel. P = 0,36 Q = 0,48 R = 0,16. P_________________Q_________________R 0,36 0,48 0,16 p2 2pq q2 p = P + 1/2Q = 0,36 + 1/2 (0,48) = 0,6 (p2+l/2 2pq) q=l-p = 0,4 Výpočet alelovf ch četností PŘIKLAD 3 Z určité přírodní populace Drosophila melanogaster bylo odchyceno 660 oplozených samiček, které byly zakladateli velké experimentální populace. Asi po 5 měsících (10 generacích) bylo testováno 489 třetích chromozomů vzhledem ke genům kódujícím alozymy: esterázu-6 (alely E6F a E6S), esterázu-C (alely ECF a ECS) a octanoldehydrogenázu (alely Odhľ a Odhs). Pořadí těchto genů na třetím chromozomu je známé: E6 - EC - Odh. Byly zjištěny tyto četnosti alelových kombinací: E6FECFOdtf 152 E6sECFOdhľ 264 E6FECFOdhs 7 E6sECFOdhs 13 . EďEC'OdPf 15 E6sECsOdhľ 29 EďEC^Odh5 1 EďECsOdhs 8 Vypočtěte alelové četnosti a jejich směrodatné odchylky pro všechny geny. V tomto případě je odhad alelových četností v populaci roven alelovým četnostem ve vzorku a odhady variance podle rovnice 1.2 2N = 489 chromozomů Geny E6, EC a Odh - každý má 2 alely F a S Počty: E6F ECF OdhF 152 F S F 15 S F F 264 S S F 29 F F S 7 F S S 1 S F S 13 S S S 8 489 2N = 489 chromozomů Geny E6, EC a Odh - každý má 2 alely F a S Počty: E6F ECF OdhF 152 F S F 15 S F F 264 S S F 29 F F S 7 F S S 1 S F S 13 S S S 8 Vypočtěte alelové četnosti a jejich směrodatné odchylky pro všechny geny. 489 Gen E6: E6-152 +15 + 7 + 1 = 175 P = 175/489 = 0,3579 E6S = '264 + 29 + 13 + 8 = 314 1 = 314/489 = °'6421 s = Vvär Var = p x q / 2N = 0,3579 x 0,6421 / 489 = 4,699xlQ-4 s = 0,0217
= 0,3579 ±0,0217
Výpočet alelovf ch četností
PŘIKLAD 2
Při studiu alozymového polymorfismu u jednoleté rostliny Phlox drummondii byly v určité populaci zjištěny u genu pro alkoholdehydrogenázu tyto genotypové četnosti: AdhVAdh" (0,04), Adh"/Adhb (0,32) ?iAdhb/Adhb (0,64). Vypočtěte alelové četnosti Adha (?>) &Adhb ().
Samostatně