Tomáš Pavlík
pavlik@iba.muni.cz
Úvod do matematické biologie 2.10.2007
i   DNA mikročipy
Control Call
-x\!ci menial '-ul
mRNA erlractfld Írom ceil
Reveres transcription,
fluoresce-nlly labeled
wilh Cy3 (Greer)
and Cví'.Rl-ji
Technologie DNA mikročipů Výhody
-   Zkoumáme odlišnosti v dění v buňkách různého původu
-   Rychlý experiment
-   Tisíce genů zároveň
Nevýhody
-   Vícekrokový experiment
-   Nepřesnosti v datech data
cDNA micfosrray
Combine equal amount and ■lyhn'dire onto microaray
■ u     u   i ■ ■_     ■ D
IBA
(g
-"    Analýza dat z DNA mikročipů
Analýza dat z microarrays:
COv.--Q
-   luciiu.irva^                       ^ "    Y)
zajímavých genů
-  klasifikace shluková analýza
-  propojení expresních + klinických dat
Spojení s databázemi - vyhledávání informací o genech, jejich spojení a možných vlivech na chod buňky
IBA

VJS.       "Ä
Analýza přežití
Klasická analýza přežití
- studujeme čas předcházející události, která nás zajímá (úmrtí, progrese nemoci, ...); nechceme pouze počty událostí

El
i   Analýza přežití - uplatnění v praxi
Klinické studie -jedna z fází vývoje nového léku
Pne-Clínital
molecular      Ta[9et+r         Bi-he™a'_>Screening
targets           validation        ««y
Leads
Animal models Drug metabolism Safety assessment Pharmacy Process chemistry
•   Analýza přežití v registrech pacientů s vážným onemocněním -vyhodnocování léčby pacientů s těžkými chorobami
Možnosti pro matematický rozvoj - vícestavová analýza přežití („pacienti se mohou vracet mezi živé")
IBA

(g
Analýza přežití v epidemiologii
Epidemiologie nádorů v CR - Projekt SVOD
- Celkové přežití - přežívání pacientů v rámci CR celkově
- Relativní přežití - přežívání pacientů vztažené na přežívání celé populace ČR
- Hodnocení trendů v populaci - ? zlepšení nebo zhoršení ?
1
- Vliv preventivních opatření