My kvůli
                                          globálním změnám
                                             nekončíme

                                      Komplexní růstové cykly
                                    Myxobakterie, streptomycety
                                      Rhodomicrobium vannielii

                                           Streptomycety

•      Skupina řádu Actinomycetales

•      Saprofyti,zřídka patogeni

   člověka (S. somaliensis),

   nebo fytopatogeni  (S. scabies)

•      Produkce biol. aktivních látek 70% všech ATB



•      Základem rodové identifikace je chemotaxonomnie

•      Všichni v b.s. kyselinu L-DAP a glycin







•      Růst: na celofánu, nitrocelulosové membráně

•      Růst na pevném i v tekutém mediu (hrudky)

    (třepačka, aerace; produkce ATB: pevné med.)

•      Světelná mikroskopie – růst na celofánu, sklíčkové kultury, gramovo, DAPI a fluorescenční
barvení



Jednoduchá klasifikace podle vzdušného mycelia

•      přímá vlákna

•      háčkovitá spirálovitá – max. 2 otočky

•      spirálovitá



•      Spirály:

•          četnost

•          délka stopky

•          počet otoček

•          interval otoček

•          průměr otoček

•          směr otoček









•      autolýza – postihuje významnou část populace v průběhu vývojového cyklu



•      S. coelicolor A3(2) – modelový mikroorganismus genetických, fyziologických a biochemických
studií

•      8 667 507 bp – lineární chromosom

•      Nejvyšší počet genů v 1 bakterii (7 825) –2x



S. coelicolor A3(2)

•      Mnoho regulačních genů

 – odpovědi na stres

•      Unikum – v genomu

   duplikovány sady genů

   fungující v jednotlivých

   fázích životního cyklu

•      Unikátní telomera – 5’ konec při replikaci nekompletní – ssDNA

•      Vlásenky z repetic chrání chromozom (Goshi et al.)

•      Nejblíže M. tuberculosis

   a C. diphtheriae







•      Streptomyces avermitilis

   genom sekvenován v říjnu 2001

   9,025,608 bp, 7,575 ORFs

   produkuje protiparazitární látky (avermectin) (hlísti a hmyz subsaharské Afriky)





•      Další projekty sekvenování genomu:

   Streptomyces scabiei and Streptomyces ambofaciens.











 Bleomycin

    - izolován 1966

    Streptomyces verticillus (Umezawa et al)

    - protirakovinové účinky

    - produkce volných radikálů zlom ds DNA

    - maligní nádory kmenových buněk,

      lymfomy, Kaposiho sarkom



































                                         Spory streptomycet

•      Řetízky

•      Pigmentované

•      Oproti G+ bakteriím méně rezistentní vůči působení extrém.hodnot teploty (do 55°C)

    a pH

•      Velmi odolné vůči vysychání

•      Slouží k šíření organismu v prostoru a k překonání nepříznivých životních podmínek







                                      Komplexní životní cyklus

•      Odpovědi na prostředí

•      Multinukleoid, segmantace

•      Přesná regulace diferenciace V.M.

•      Micro arrays – identifikace hydrofobních proteinů – chapliny = kostra pro vzdušné hyfy.
Sekretovány z cytoplazmy a ukládány do buněčné stěny. 8 druhů

    Chapliny – kovalentní vazba na PG, hydrofobní a odolná vrstva – studium cytoskeletu S.
coelicolor

    Studium – exprese a funkční specializace jednotl.druhů chaplinů, jejich polymerizace, interakce
se složkami buněč.stěny a morfogeneze



                                      Rhodomicrobium vannielii

•      pučící bakterie

•      anaerobní fototrofi, aerobní chemotrofi

•      Střídání:

           rostoucí a klidové formy

           přisedlé a pohyblivé formy

                                               Pojmy











Rhodomicrobium vannelii – typy buněk:

•      Ovoidní buňky 2-3 µm – 1 µm,  spojené vlákny 2-30 µm, která se mohou větvit (myceliální
stadium) – dostatek světla, nižší tlak CO[2

]•      V časné exponenciální fázi – nestélkaté peritrichálně obrvené buňky, méně světla, vyšší tlak
CO[2

]•      Nepohyblivé hranaté exospory – vyčerpání živin























Každá mateřská buňka je při formování exospor oddělena od těchto struktur vláknem.

Exospory vznikají jedna po druhé.







                                            myxobakterie



•      http://www.jic.ac.uk/SCIENCE/molmicro/Strepmanual/Manual.htm

•      http://openwetware.org/wiki/Streptomyces:Other_Bits/An_Introduction_to_Streptomyces

•      http://microbiologybytes.wordpress.com/category/parasitology/

•      http://www.biomedcentral.com/1471-2180/5/51

•      http://biology.kenyon.edu/courses/biol114/Chap11/Chapter_11A.html











•      http://www.science.mcmaster.ca/biology/faculty/elliotm/elliotm_research.htm

•      http://www.natur.cuni.cz/~zdenap/linksMS.html

•      http://www.microbelibrary.org/ASMOnly/details.asp?id=1988&Lang

•      http://www.nature.com/nature/journal/v417/n6885/full/417141a.html

•     
http://the-half-decent-pharmaceutical-chemistry-blog.chemblogs.org/archives/2007/01/21/sunday-s-family-reunion-the-antitumor-antibiotics

•      http://www.pubmedcentral.nih.gov/picrender.fcgi?artid=414022&blobtype=pdf