SIGNÁLY A SOUSTAVY V MATEMATICKÉ BIOLOGII prof. Ing. Jiří Holčík, CSc. holcik@iba.muni.cz KDE A KDY SE BUDEME VÍDAT? LITERATURA þ Holčík, J.: přednáškové prezentace webová stránka předmětu þ Holčík, J.: Úvod do systémů a signálů (Elektronické studijní texty) webová stránka předmětu þ Jiřina,M., Holčík, J.: Úvod do systémů a signálů (Elektronické studijní texty) webová stránka předmětu LITERATURA þ Proakis J. G. Manolakis D. K. Digital Signal Processing (4th Edition), CRC; 1 edition, 2006 þ Kamen, E.W., Heck, B.S. Fundamentals of Signals and Systems Using the Web and Matlab (3rd Edition), Prentice Hall (2006) þ Lathi,B.P. Signal Processing and Linear Systems, Oxford Univ. Press, Oxford 1998 þ Carlson G.E. Signal and Linear System Analysis: with MATLAB, 2e, John Wiley & Sons, Inc., 1998, þ Oppenheim,A.V., Willsky, A.S., Hamid,S.: Signals and Systems (2nd Edition) Prentice-Hall Signal Processing Series, Prentice Hall; 1996 LITERATURA þ Kalouptsidis N. Signal Processing Systems: Theory and Design. John Wiley & Sons, Inc., 1997 þ Chen C.T. Linear System Theory and Design (Oxford Series in Electrical and Computer Engineering) Oxford University Press, USA; 3rd ed. 1998 þ Oppenheim A V., Schafer R W., Buck J R. Discrete-Time Signal Processing (2nd Edition) (Prentice-Hall Signal Processing Series), Prentice Hall; 1999 þ Brockwell,P.J., Davis,R.A.: Introduction to Time Series and Forecasting, Springer; 2 edition (2003), þ Engelberg, S. Random Signals and Noise: A Mathematical Introduction, CRC Press, Inc., 2007 Ukončení předmětu Požadavky: þ ústní zkouška è učená rozprava o některém z témat, která budou náplní předmětu I. ZAČÍNÁME ZÁKLADNÍ KONCEPT ZÁKLADNÍ KONCEPT reálný objekt ZÁKLADNÍ KONCEPT reálný objekt (zdroj informace) ZÁKLADNÍ KONCEPT reálný objekt (zdroj informace) ZÁKLADNÍ KONCEPT reálný objekt (zdroj informace) ZÁKLADNÍ KONCEPT reálný objekt (zdroj informace) ZÁKLADNÍ KONCEPT reálný objekt (zdroj informace) ZÁKLADNÍ KONCEPT reálný objekt (zdroj informace) ZÁKLADNÍ KONCEPT reálný objekt (zdroj informace) ZÁKLADNÍ KONCEPT K čemu ta informace bude? ZÁKLADNÍ KONCEPT þ abychom dokázali říct, co to je za objekt (rozpoznání, klasifikace,…); þ abychom dokázali posoudit jeho stav (O.K., hypertenze, epilepsie, exitus, úroveň chemického zamoření dané lokality, …); þ abychom dokázali předpovědět jeho budoucnost (lze léčit a vyléčit, ocenit finanční nároky léčení po dobu přežití, les do 20 let odumře, sociální složení obyvatelstva v daném časovém rozpětí, …); ZÁKLADNÍ KONCEPT Jak tu informaci zjistíme? ZÁKLADNÍ KONCEPT Musíme něco „změřit“. ZÁKLADNÍ KONCEPT Musíme něco „změřit“. A co? ZÁKLADNÍ KONCEPT Musíme něco „změřit“. A co? To na začátku bohužel moc nevíme. ZÁKLADNÍ KONCEPT Musíme něco „změřit“. A co? To bohužel moc nevíme. ZÁKLADNÍ KONCEPT Musíme něco „změřit“. Za jakých podmínek? ZÁKLADNÍ KONCEPT Musíme něco „změřit“. Za jakých podmínek? Pozorování × experiment POZOROVÁNÍ je založeno na pasivním sledování procesů a souvisejících skutečností, pokud možno v jejich přirozeném stavu, co nejméně ovlivněném pozorovatelem. Pozorování poskytuje informace o vnějších projevech a vztazích systému (tvar, rozměry, podobnost, fyzikální či chemické vlastnosti, časová následnost, ...). Význam pozorování klesá v situacích, kdy nabývají na důležitosti příčiny pozorovaných jevů, příp. charakter a podstata uvnitř zkoumaného objektu. Experiment vychází z aktivního přístupu ke zkoumání objektu. Spočívá na záměrně vyvolaných změnách podmínek existence a funkce daného objektu, které mají přimět zkoumaný objekt projevit se za různých, uměle navozených situací. Výchozím předpokladem pro uspořádání experimentu je formulace hypotézy o analyzovaném objektu. Experiment Hypotézy a pak i následné experimenty, jsou dvojího typu: è vyhledávací (heuristické) - „co se stane, uděláme-li toto?“ è ověřovací (verifikační) - stane se toto, když uděláme toto?“ ZÁKLADNÍ KONCEPT Musíme něco „změřit“. A když něco změříme, co dostaneme? ZÁKLADNÍ KONCEPT Musíme něco „změřit“. A když něco změříme, co dostaneme? Nějaká data, údaje, …. A z čeho se ta data skládají? þ nesou informaci o tom měřeném objektu (informace je nehmotná) na nějakém nosiči (hmotném – to bývá nějaká hmotná – fyzikální, chemická, biologická, … veličina); INFORMACE þ poznatek (znalost) týkající se jakýchkoliv objektů, např. faktů, událostí, věcí, procesů nebo myšlenek včetně pojmů, které mají v daném kontextu specifický význam (ISO/IEC 2382-1:1993 „Informační technologie – část I: Základní pojmy“) þ název pro obsah toho, co se vymění s vnějším světem, když se mu přizpůsobujeme a působíme na něj svým přizpůsobováním. Proces přijímání a využívání informace je procesem našeho přizpůsobování k nahodilostem vnějšího prostředí a aktivního života v tomto prostředí (WIENER); þ poznatek, který omezuje nebo odstraňuje nejistotu týkající se výskytu určitého jevu z dané množiny možných jevů; !!! NEHMOTNÁ !!! A z čeho se ta data skládají? þ nesou informaci o měřeném objektu (informace je nehmotná) na nějakém nosiči (hmotném – to bývá nějaká hmotná – fyzikální, chemická, biologická, … veličina); þ nesou jednak užitečnou informaci, která se příčinně (deterministicky) váže k měřenému reálnému objektu (!!!!), jednak balast, který se na tu informaci připojil někde po cestě od objektu k měřicímu zařízení ZÁKLADNÍ KONCEPT CÍL VŠECH MOŽNÝCH ANALÝZ Odhalit ten příčinný (deterministický) vztah navzdory tomu všemu, co nám to odhalení kazí. A z čeho se ta data skládají? Ø pacient má i jiné orgány a ty se pletou do výsledku vyšetření; A z čeho se ta data skládají? A z čeho se ta data skládají? A z čeho se ta data skládají? A z čeho se ta data skládají? CHARAKTER DAT Anamnéza + výsledky základního vyšetření 52 letá pacientka: RA: matka kardiačka, zemřela v 78 letech na IM. AA: alergie na Ketazon a náplast. OA: obezita, 3 roky má hypertenzi, před 19 roky hluboká flebotromboza dolní končetiny po úraze Achillovy šlachy. GA: porody 0, interupce 0, antikoncepce 0, menses pravidelné. FA: Tenormin 100 1x1, Rhefluin 1x1, Enap 10 2x1, Lipanthyl 100 mg 1x1. NO: Pacientka je 14 dní dušná s progresí poslední tři dny. Je bez zvýšených teplot, nekašle. Má pálivé bolesti na hrudníku po styku s chladným vzduchem trvající asi 20 minut. Nyní je bez bolestí. Občas má křeče v lýtkách. Pro dušnost byla hospitalizována na int. oddělení. Obj. nález: pacientka obezní, TK 150/80..140/80, TF 120/min..80/min reg. Nález na hrudníku, břichu i DK bez patol.nálezu. TT 36,6 oC. RTG srdce a plic: nález v normě. KO: leukocyty: 9,7..5,0..5,7, jinak KO v normě. FW 3..10/1 hod. EKG: negat. TIII, V1-4. D-dimery: hladiny zvýšené. Antitrombin III 82,5%. Hraniční hodnoty proteinu C a proteinu S, rezistence na aktiv. protein C., antifosfolipidové protilátky neprokázány. Saturace Hb02: 0,912..0,942..0,867..0,869, pH 7,386..7,436..7,301..7,369. Biochem. vyš.: triacylglyceroly 2,5 mmol/l (zvýšená hladina), troponin I do 0,22 ug/ml (v normě). Sonografie venozního systému dolních končetin: bez známek flebotrombozy hlubokého žilního systému DKK. Echokardiografie: LK nezvětšená, EF asi 60%, lehká trikuspifální insuficience, nadhraniční velikost PK, známky lehké plicní hypertenze, bez průkazu trombů. CHARAKTER DAT RTG srdce a plic CHARAKTER DAT EKG - elektrokardiogram CHARAKTER DAT Po zakódování lze vyjádřit stav pacientky v určitém čase vektorem (strukturovaným záznamem) hodnot různých veličin a různého charakteru (číselná hodnota, výčtová hodnota, kód, logická hodnota, …) CHARAKTER DAT Po zakódování lze vyjádřit stav pacientky v určitém čase vektorem (strukturovaným záznamem) hodnot různých veličin a různého charakteru (číselná hodnota, výčtová hodnota, kód, logická hodnota, …) CHARAKTER DAT þ a co s daty jako je elektrokardiogram, resp. RTG snímek? CHARAKTER DAT þ a co s daty jako je elektrokardiogram, resp. RTG snímek? CHARAKTER DAT þ a co s daty jako je elektrokardiogram, resp. RTG snímek? Signál - definice Signál - definice þ Signál je jev fyzikální, chemické, biologické, ekonomické či jiné materiální povahy, nesoucí informaci o stavu systému, který jej generuje. Signál - definice þ Signál je jev fyzikální, chemické, biologické, ekonomické či jiné materiální povahy, nesoucí informaci o stavu systému, který jej generuje, a jeho dynamice. Signál - definice þ Signál je jev fyzikální, chemické, biologické, ekonomické či jiné materiální povahy, nesoucí informaci o stavu systému, který jej generuje, a jeho dynamice. þ Je-li zdrojem informace živý organismus, pak hovoříme o biosignálech bez ohledu na podstatu nosiče informace. Signál - definice þ Signál je jev fyzikální, chemické, biologické, ekonomické či jiné materiální povahy, nesoucí informaci o stavu systému, který jej generuje, a jeho dynamice. þ Je-li zdrojem informace živý organismus, pak hovoříme o biosignálech bez ohledu na podstatu nosiče informace.