Biologická role CpG a non-CpG metylace u rostlin

CG:  zajišťuje stabilní epigenetický obraz

       (non-CpG metylace a

           ostatní epigenetické modifikace).



Mutanty A. thaliana, nefunkční enzymy, které udržují CpG – globální pokles metylace cytosinů,

    fenotypické defekty – přetrvávají i po obnovení

    funkcí enzymů.

Úbytek metylace mimo CpG – většinou bez fenotypu, po obnovení funkcí příslušných enzymů se
metylační stav vrací k normálu



















































microRNA
endogenní malé molekuly RNA, kódovány lokusy ODLIŠNÝMI od těch, jež regulují. 21 nt, vazba na
parciálně komplementární místa na 3´netranslatovaném konci cílové mRNA          represe
transkripce.
Vznik z vlásenkového prekursoru (70 bp).
Živočichové – jeden prekursor společný pro několik miRNA,
rostliny – každá miRNA má svůj prekursor.
U rostlin – maturované miRNA jsou metylované (HEN1),
      ochrana před degradací



Typické heterochromatinové oblasti

§   Centromery – sekvence odpovědné za organizaci kinetochoru, řídí pohyb chromozomů při dělení
buňky.

§   Pericentromery – spojují sesterské centromery, oddělují centromery od ramen chromozomu.

§   Telomery – nukleoproteinové struktury na koncích lineárních chromozomů (ochrana, replikace a
stabilizace konce chromozomu).









RNAi a heterochromatin - rostliny

§  90 – 95% endogenních siRNA odpovídá transpozonům a vysoce metylovaným repetitivním sekvencím
(transkripce PŘES centrum obrácené repetice,v důsledku inzerce repetice do transpozonu,..).



§  FWA (kóduje protein kontrolující kvetení), exprimován v endospermu, ve vegetativních tkáních
umlčen (TGS-metylace promotoru). Inzerce transgenu FWA: umlčen ve „wild type“, exprimován v
mutantních rostlinách (dcl3, rdr2, ago4) – pozdně kvetoucí fenotyp.