Úvod ke cvičením Mikrobiologie Podzim 2009 Cytologie a morfologie bakterií Sylabus cvičení • Příprava a sterilizace živných medií • Očkování a uchovávání mikroorganismů • Makroskopické a mikroskopické pozorování • Počítání životaschopných bakterií - sporulace • Izolace půdních mikroorganismů • Mikrobiologický rozbor vody • Barvení a pozorování pouzder a spor • Kvasinky • Bakterie a jejich citlivost na antibiotika • Základní biochemické testy Morfologie • Buňky • Charakteristických shluků buněk • Extracelulárních útvarů (spory, konidie, sporangia, pouzdra..) • Bakteriální kolonie Morfologie buňky • PREPARÁT - co chceme vidět? – podle toho preparát a typ mikroskopie tvar buňky – fázový kontrast, barvený fixovaný prep. pohyb buňky – fázový kontrast, fluorescence barvené struktury – pomáhají identifikaci (PHB, síra typ buněčné stěny – Gramovo a acidorezistentní b. U jednoho bakteriálního rodu různý vzhled char. tvaru buňky! • Př: tyčky bacilů •Haemophilus Posuzujeme-li vzhled buňky určitého bakteriálního druhu, je třeba si uvědomit: 1) Prochází tento druh růstovými cykly? - v každém z nich má pak buňka jinou morfologii! Př: Chlamydia Bdellovibrio, Streptomyces, Caulobacter, myxobakterie…. Mění se nejen vzhled buňky, ale buňka v cyklech prochází typickou změnou vnitřních struktur. Morfologie buňky vprostřed buněčného cyklu 2) Vytváří posuzovaný druh endospory? - v preparátu pak mohou měnit tvar buněk! Endospory vs. exospory 3) Stárnutím mění buňky tvar 4) Závislost tvaru buňky na vnějším prostředí - živiny, tlak, osmolarita… 5) pleomorfní buňky – př. rody Mycobacterium, Corynebacterium, Haemophillus, Mycoplasma Morfologie charakteristických shluků buněk • typické shluky napomáhají identifikaci Morfologie bakt. kolonií • potřeba zvážit typ media, ne kterém kolonie hodnotíme! kultivace - zda vůbec kultivovatelné?? - sledování typu kolonií Př: sledování morfologie kolonií – univerzální media, jiný vhled na selektivním – zda vůbec růst či ne? barevná reakce?) S-, R- a M-formy sledování pohybu terasovité kolonie (Př: Proteus) Kontaminace na misce! Cytologie BAKTERIÁLNÍ BUŇKA x vs. eukaryotní • nutno porovnat pro pochopení fyziologie Zvláštnosti prokaryotické buňky • živý, otevřený systém schopný regulace a autoreprodukce • jádro neodděleno od CPL membránou, větš. kruhová (i lineární) DNA • haploidní buňky (1 alela) množící se nepohlavně • bez buněčných organel, jediná membrána je cytoplasmatická • ribosomy se liší od ribosomů eukaryotních buněk – menší, volně v CPL vyjma Archea: 5S, 16S a 23S rRNA translace začíná N-formylmethioninem geny pro RNA bez intronů specifické struktury a vlastnosti bakt. buňky: peptidoglykan (až na mykoplasmata) steroly v membránách zcela výjimečně bičík – globul. bílk. flagelin, pohyb rotací anaerobiosa, schopnost vázat N tvorba kyseliny PHB (zásob.l.) pokud fotosyntéza - anoxigenní Př: klasifikace: rod Aeromonas • Aeromonas • Aeromonas hydrophila • Aeromonas hydrophila ssp. hydrophila • Aeromonas hydrophila ssp. hydrophila CCM 7232 ^T • Aeromonas hydrophila ssp. hydrophila CCM 1271 CCM 1275 Česká sbírka mikroorganismů (CCM) • uchovává kultury bakterií a hub pro - základní a aplikovaný výzkum - průmyslové využití, biotechnologii - referenční kmeny pro klinické laboratoře humánního a veterinárního zaměření - výuku • 2 500 kmenů bakterií (~ 280 rodů, 930 druhů) • 600 kmenů vláknitých hub (~ 200 rodů, 560 druhů) Bezpečnost a zásady práce