Komplexní růstové cykly
                                    Myxobakterie, streptomycety
                                     Rhodomicrobium vannielii

                                           Streptomycety

•           Skupina řádu Actinomycetales

•           Saprofyti, zřídka patogeni

   člověka (S. somaliensis),

   nebo fytopatogeni (S. scabies)

•           Produkce biol. aktivních látek 70% všech ATB



•           Základem rodové identifikace je chemotaxonomnie

•           Všichni v b.s. kyselinu L-DAP a glycin







•            Růst: na celofánu, nitrocelulosové membráně

•            Růst na pevném i v tekutém mediu (hrudky)

    (třepačka, aerace; produkce ATB: pevné med.)

•            Světelná mikroskopie – růst na celofánu, sklíčkové kultury, gramovo, DAPI a
fluorescenční barvení



Jednoduchá klasifikace podle vzdušného mycelia

•            přímá vlákna

•            háčkovitá spirálovitá – max. 2 otočky

•            spirálovitá



•            Spirály:

•                četnost

•                délka stopky

•                počet otoček

•                interval otoček

•                průměr otoček

•                směr otoček









•           autolýza – postihuje významnou část populace v průběhu vývojového cyklu



•           S. coelicolor A3(2) – modelový mikroorganismus genetických, fyziologických a
biochemických studií

•            8 667 507 bp – lineární chromosom

•            Nejvyšší počet genů v 1 bakterii (7 825) –2x



S. coelicolor A3(2)

•            Mnoho regulačních genů

 – odpovědi na stres

•            Unikum – v genomu

   duplikovány sady genů

   fungující v jednotlivých

   fázích životního cyklu

•            Unikátní telomera – 5’ konec při replikaci nekompletní – ssDNA

•            Vlásenky z repetic chrání chromozom (Goshi et al.)

•            Nejblíže M. tuberculosis

   a C. diphtheriae







•           Streptomyces avermitilis

   genom sekvenován v říjnu 2001

   9,025,608 bp, 7,575 ORFs

   produkuje protiparazitární látky (avermectin) (hlísti a hmyz subsaharské Afriky)





•           Další projekty sekvenování genomu:

   Streptomyces scabiei and Streptomyces ambofaciens.











 Bleomycin

    - izolován 1966

    Streptomyces verticillus (Umezawa et al)

    - protirakovinové účinky

    - produkce volných radikálů zlom ds DNA

    - maligní nádory kmenových buněk,

      lymfomy, Kaposiho sarkom



































                                        Spory streptomycet

•           Řetízky

•           Pigmentované

•           Oproti G+ bakteriím méně rezistentní vůči působení extrém.hodnot teploty (do 55°C)

    a pH

•           Velmi odolné vůči vysychání

•           Slouží k šíření organismu v prostoru a k překonání nepříznivých životních podmínek







                                     Komplexní životní cyklus

•    Odpovědi na prostředí

•    Multinukleoid, segmentace

•    Přesná regulace diferenciace V.M.

•    Micro arrays – identifikace hydrofobních proteinů – chapliny = kostra pro vzdušné hyfy.
Sekretovány z cytoplazmy a ukládány do buněčné stěny. 8 druhů

    Chapliny – kovalentní vazba na PG, hydrofobní a odolná vrstva – studium cytoskeletu S.
coelicolor

    Studium – exprese a funkční specializace jednotl.druhů chaplinů, jejich polymerizace, interakce
se složkami buněč.stěny a morfogeneze

                                     Rhodomicrobium vannielii

•           pučící bakterie

•           anaerobní fototrofi, aerobní chemotrofi

•           Střídání:

           rostoucí a klidové formy

           přisedlé a pohyblivé formy

                                               Pojmy











Rhodomicrobium vannelii – typy buněk:

•             Ovoidní buňky 2-3 µm – 1 µm,  spojené vlákny 2-30 µm, která se mohou větvit
(myceliální stadium) – dostatek světla, nižší tlak CO[2]

•             V časné exponenciální fázi – nestélkaté peritrichálně obrvené buňky, méně světla,
vyšší tlak CO[2]

•             Nepohyblivé hranaté exospory – vyčerpání živin























Každá mateřská buňka je při formování exospor oddělena od těchto struktur vláknem.

Exospory vznikají jedna po druhé.







                                           myxobakterie



•           http://www.jic.ac.uk/SCIENCE/molmicro/Strepmanual/Manual.htm

•           http://openwetware.org/wiki/Streptomyces:Other_Bits/An_Introduction_to_Streptomyces

•           http://microbiologybytes.wordpress.com/category/parasitology/

•           http://www.biomedcentral.com/1471-2180/5/51

•           http://biology.kenyon.edu/courses/biol114/Chap11/Chapter_11A.html











•            http://www.science.mcmaster.ca/biology/faculty/elliotm/elliotm_research.htm

•            http://www.natur.cuni.cz/~zdenap/linksMS.html

•            http://www.microbelibrary.org/ASMOnly/details.asp?id=1988&Lang

•            http://www.nature.com/nature/journal/v417/n6885/full/417141a.html

•
http://the-half-decent-pharmaceutical-chemistry-blog.chemblogs.org/archives/2007/01/21/sunday-s-fam
ily-reunion-the-antitumor-antibiotics

•            http://www.pubmedcentral.nih.gov/picrender.fcgi?artid=414022&blobtype=pdf