NABÍDKA BAKALÁŘSKÉ PRÁCE
JAKÉ SÍLY AKTIVUJÍ A UMLČUJÍ TRANSPOSONY?
Genomy eukaryot nejsou neměnnými genetickými entitami. Zejména v poslední době se stále
silněji ukazuje, že se jedná o velmi dynamické systémy, generátory vlastních přestaveb,
schopné citlivě reagovat na změny prostředí. Většina eukaryotních genomů je z velké části
tvořena opakujícími se úseky DNA, tzv. repeticemi. Mezi repetice patří i klíčoví hráči
dynamiky genomů - transponovatelné elementy, tzv. transposony, dříve označované jako
,,skákající geny". Transposony jsou rozptýleny po celém genomu. Ukazuje se, že transposony
jsou aktivovány stresem, což je zřejmé zejména u rostlin, které nemohou opustit stresující
prostředí podobně jako živočichové. Aktivace transposonů stresem vede k rozkolísání
genomu a následně k lepší adaptaci na změněné prostředí. Současně ale mohou některé
transposony v našem genomu fungovat jako časovaná bomba, jejíž aktivace způsobí některé
nemoci.
Předmětem bakalářské práce bude shrnutí prací zabývajících se aktivitou transposonů, jak u
rostlin, tak u živočichů, včetně člověka. Zvláštní pozornost bude věnována aktivaci
transposonů nejrůznějšími stresujícími podmínkami prostředí, známé zejména u rostlin.
Budou popsány mechanismy aktivace transposonů a úloha epigenetického kódu v umlčování
a aktivaci transposonů. Práce se dotkne i obranných mechanismů hostitele (metylace, RNA
interference) a příkladů domestikace transposonů včetně úlohy transposonů v regulačních
sítích buňky. Bude diskutována souvislost aktivity transposonů a některých nemocí člověka,
např. rakoviny.
Zájemci kontaktujte:
RNDr. Eduard Kejnovský, CSc.
Laboratoř vývojové genetiky rostlin
Biofyzikální ústav AVČR
Královopolská 135
612 65 Brno
tel. 541517203
email: kejnovsk@ibp.cz