Metody analýzy mikroorganismů II
1. Seznámení s předmětem


Literatura
•Šmarda J., Doškař J., Pantůček R. a spol.
•Metody molekulární biologie, Brno, MU 2005
•Mackay I.M. Real-time PCR in microbiology, Caister Academic Press, Norfolk, UK, 2007

Navazující předměty
•Navazuje na SMAMI
•Molekulární biotechnologie – cvičení
•Molekulární biotechnologie

Metody analýzy mikroorganismů
•3 éry


1. éra
•Pasteur, Koch
•Morfologické metody,
•Kultivace na pevných a v tekutých mediích
•Příprava čisté kultury

2. éra
•Biochemické metody
•Fyziologické metody

3. éra
•Molekulárně biologické metody
•Nekultivační metody

Nové metody molekulární biologie
•Využívá základní biologický výzkum


Mirobiologická laboratoř
•Je nezbytnou součástí každé biologické laboratoře


Nové metody s využívají
•Pro identifikaci a charakterizaci mikroorganismů
•Pro detekci patogenů
•Vybraných genů včetně sledování genové exprese
•Identifikaci nových organismů

Významně přispěly
•K novému taxonomickému zařazení mikroorganismů


Zařazení mikroorganismů v živém systému
•3 domény : Bakterie, Archea, Eukarya
•Srovnání sekvence rRNA
•Cytologické hledisko dělení buněk na prokaryota a eukaryota zůstává.
•Prokaryotickým typem buněk se vyznačují zástupci domény Bacteria a Archea.

Molekuly rRNA
•Jsou nejstarší biologické molekuly
•Vyskytují se ve všech organismech (translace)
•Mají konzervativní sekvence na všech stupních evoluce
•Podobnost mezi sekvencemi ukazuje na společný původ a fylogenetickou příbuznost
•Rozdíly v sekvencích vedly k rozdělení mikroorganismů do 3 domén

Sekundární struktura rRNA
•Obr.