Čt 
11.11. 
 
   
Pá 
12.11 
 
St 
24.11 
   
Čt 
25.11. 
 
St 
1.12. 
 
8:00‐ 
      9:00 
9:00‐ 
    10:00 
12:00‐ 
    13:00 
11:00‐ 
    12:00 
10:00‐ 
    11:00 
13:00‐ 
   14:00
14:00‐ 
    15:00
15:00‐ 
   16:00
16:00‐ 
   17:00
17:00‐ 
    18:00 
 
 
Izolace DNA ze vzorků půdy 
Příprava 
PCR 
produktu ‐ 
klonování 
Přečištění PCR produktu 
z gelu 
Ligace PCR produktu do 
plasmidu pGEM 
 
 
Oběd 
Inokulace 
rostlin 
tabáku  
 
Odběr 
listů po 24 
hodinách 
Nested‐
PCR DNA 
izolované 
z půdy 
 
Oběd 
 
Elektroforéza produktů 
restrikční analýzy 
 
Transformace plasmidu pGEM do 
kompetentních buněk E. coli JM109 
Odběr listů po 8 hodinách 
Nested‐PCR DNA izolované z půdy 
 
Restrikční analýza vzorků půdy 
Izolace RNA ze vzorku listů 
 
Příprava vzorku pro 2D elektroforézu – 
izolace proteinů 
 
Izolace PAL z listů 
Izolace askorbát 
peroxidázy z listů 
Oběd  Příprava vzorku pro 2D elektroforézu – 
měření koncentrace – rehydratace stripů 
 
Spuštění 
fokusace 
vzorků 
Inokulace 
vybraných 
klonů E. 
coli JM109 
 
Druhý rozměr 2D elektroforézy (PAGE) + barvení koloidní 
coomasie 
   
Pá 
3.12 
 
   
St 
8.12 
 
St 
15.12 
   
 
8:00‐ 
      9:00 
9:00‐ 
    10:00 
12:00‐ 
    13:00 
11:00‐ 
    12:00 
10:00‐ 
    11:00 
13:00‐ 
   14:00
14:00‐ 
    15:00
15:00‐ 
   16:00
16:00‐ 
   17:00
17:00‐ 
    18:00 
 
Western blotting 
Oběd 
Stanovení aktivity askorbát peroxidázy 
 
Reverzní 
transkripce  Real‐Time PCR cDNA 
 
Vyhodnocování získaných výsledků (2D elektroforéza – PDQuest, 
Real‐Time PCR – relativní a absolutní kvantifikace) 
Izolace 
plasmidu 
z E. coli 
JM109