Workshop MOLBIOL Roche
Termíny konání 17.5.2011 s reprízou 18.5.2011 jsou závazné a je třeba se
jim přizpůsobit.
Kapacita jednoho seminárního dne je 3x7 osob, t.j. pro oba termíny
dohromady:
LF    14 osob
PřF   14 osob
VUT   14 osob

Návrhy témat pro workshop Roche na VUT Brno – délka trvání 1-2 dny (dle počtu zájemců):


1.      Ukázka automatické izolace DNA – Roche umožní izolaci DNA např. z krve na automatickém
izolátoru nukleových kyselin (MagNA Pure Compact, izolační kit MPC total NA isolation kit I).
Výstupem bude vyeluovaná. DNA, u které bude možné proměřit koncentraci NK, výtěžek a čistotu (pokud
pracoviště zabezpečí spektrofotometr na kvantifikaci NK.

Od partnera (VUT) se očekává zabezpečení centrifugy a vzorků (krev), ze kterých bude DNA izolována,
a spektrofotometru.



2.      Demonstrační real-time qPCR detekce trombofilních mutací – Roche dodá real-time PCR
přístroj LightCycler 2.0, dále kit pro molekulární PCR detekci trombofilních mutací (kit pro Leiden
nebo Protrombin). V rámci experimentu se naprogramuje PCR profil dle doporučení výrobce kitu,
napipetuje se PCR reakce do reakčních kapilár (master mix, kontrolní DNA, beztemplátová kontrola) a
uskuteční se real-time qPCR detekce s vyhodnocením genotypu pomocí analýzy křivek tání (což je
v dnešní době standard v oblasti molekulární PCR diagnostiky).


3.      Automatické analýza a počítání buněk na přístroji Casy TT – od partnera (VUT) se očekává
zabezpečení rozkultivovaných adherentních buněk a přístup k laminárnímu boxu (tkáňová laboratoř) a
vybavení pro tripsinizaci buněk (pasážování). Po trypsinizaci se uskuteční spočítání buněk na
přístroji Casy TT (zabezpečí Roche) a naředění suspenze buněk na koncentrace potřebné pro
experiment na přístroji xCELLigence (viz bod 5.)


4.      xCELLigence experiment (analýza buněk v reálném čase na modelu RTCA DP) – na přístroji RTCA
DP (zabezpečí Roche) se uskuteční titrační experiment, kde do E-plate 16 destičky (zabezpečí Roche)
se nasadí různé koncentrace buněk (předtím spočítané na Casy TT – viz bod 4) a bude se monitorovat
proliferace buněk v reálném čase. Od partnera (VUT) se očekává zabezpečení přístupu do laminárního
boxu a CO[2] inkubátor (37°C, 95% vlhkost).