Laboratoř molekulární diagnostiky mikroorganismů

• Molekulární podstata produkce toxinů u Staphylococcus aureus (školitelka: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.)

• Nové možnosti fágové terapie (školitel: prof. RNDr. Jiří Doškař, CSc.)

• Struktura a funkce genomu Staphylococcus aureus (školitel: prof. RNDr. Jiří Doškař, CSc.) 

• Molekulární biologie stafylokokových bakteriofágů (školitel: doc. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.)

• Mobilní genetické elementy a jejich role při vzniku stafylokokových infekcí a toxikóz (školitelka: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.)

• Molekulární podstata stafylokokových epidermolýz u novorozenců (školitelka: doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc.)

• Mobilní genetické elementy bakterií a jejich význam v evoluci patogenních kmenů (školitel: prof. RNDr. Jiří Doškař, CSc.)

• Mechanizmy rezistence bakterií k bakteriofágům  (školitel: prof. RNDr. Jiří Doškař, CSc.)

• Integrázy bakteriofágů a jejich praktické využití (školitel: doc. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.)

• Možnosti aplikace MALDI-TOF MS pro detekci bakteriálních toxinů (Doc. RNDr. Vlaďka Růžičková CSc., pro Tereza Vavrdová)

• téma pro Adélu Indrákovou (??školitel: doc. RNDr. Roman Pantůček)

• téma pro Michala Zemana (??školitel: prof. RNDr. Jiří Doškař, CSc.)

Laboratoř buněčné diferenciace

• Role RNAi a miRNA v nádorových onemocněních (školitel: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.)

• Využití odlišností zdravých a nádorových buněk při hledání protinádorových terapií (školitel: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.)

• Význam PPAR v protinádorové terapii (školitel: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.)

• Charakteristika proteinu B-Myb a jeho srovnání s dalšími členy rodiny proteinů Myb (školitel: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.)

• Funkce lysozomů v regulaci programované buněčné smrti (školitel: Mgr. Petr Beneš, Ph.D.)

• Význam cyklooxygenázy 2 pro invazivitu, angiogenezi a metastatický rozsev nádorů (školitel: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.)

• Mikroprostředí nádoru a jeho vztah k malignímu onemocnění (školitelka: Mgr. Jarmila Navrátilová, Ph.D.)

• Současné možnosti genových terapií (školitel: Prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.)

• Úloha proteinu CD105 v rozvoji nádorových onemocnění (Mgr. Petr Beneš Ph.D.)

• Matricelulární proteiny jako molekulární efektory metastázovani (Mgr. Lucia Knopfová)

• Specifické rysy mikroprostředí nádoru a jejich vliv na účinnost protinádorových terapií (Prof. RNDr. Jan Šmarda CSc.)

• Lysozomy a lysozomální proteázy v procesech buněčné smrti: význam pro buňky nádorové (Mgr. Blanka Jančeková)

Laboratoř nádorové biologie

• Metody RNA interference a jejich využití při studiu izoforem proteinu p73 (školitelka: doc. RNDr. Renata Veselská, Ph.D., M.Sc.)

• Možnosti identifikace a izolace nádorových kmenových buněk u vybraných typů sarkomů (školitelka: doc. RNDr. Renata Veselská, Ph.D., M.Sc.)

• Molekulární mechanismy protinádorového účinku antifolátů (školitel: Mgr. Jakub Neradil, Ph.D.)

• Úloha centrosomů v tumorigenezi (školitelka: doc. RNDr. Renata Veselská, Ph.D., M.Sc.)

• Využití retinoidů při diferenciační terapii malignit (školitelka: doc. RNDr. Renata Veselská, Ph.D., M.Sc.)

• Identifikace a funkční testy nádorových kmenových buněk (školitel: RNDr. Jakub Neradil, Ph.D.)

• Nádorové markery u gliomů (školitelka: Doc. RNDr. Renata Veselská, Ph.D.)

• CXCR4 jako marker nádorových kmenových buněk (školitelka: Doc. RNDr. Renata Veselská, Ph.D.)

• Působení LOX/COX inhibitorů na buňky sarkomů in vitro a in vivo (školitelka: Ing. Miroslava Krzyžánková, Dr. rer. nat.)

• Význam hypoxie v nádorovém mikroprostředí (RNDr. Petr Chlapek Ph.D.)

• Signální dráhy sebeobnovy nádorových kmenových buněk (a strategie jejich inhibice) (RNDr. Jakub Neradil Ph.D.)

• ABC transportéry a jejich význam v tumorigenezi (Mgr. Jan Škoda)

• Úloha MET onkogenu v tumorigenezi sarkomů (Doc. RNDr. Renata Veselská Ph.D.)

Laboratoř molekulární genetiky rostlin

• Funkční mechanizmy genů odolnosti k Blumeria graminis f.sp. hordei (školitelka: doc. RNDr. Jana Řepková, CSc.)

• Perspektivy využití DNA markerů u Hordeum vulgare (školitelka: doc. RNDr. Jana Řepková, CSc.)

• Srovnávací genomika trav, současné trendy a aplikace poznatků (školitelka: doc. RNDr. Jana Řepková, CSc.)

• Studium genomů významných kulturních druhů čeledě Fabaceae (školitelka: Doc. RNDr. Jana Řepková, CSc.)

• Význam modelových druhů čeledě Fabaceae pro aplikovaný výzkum a šlechtění (školitelka: Doc. RNDr. Jana Řepková, CSc.)

• Přínosy genového inženýrství rostlin pro fytoremediaci (školitelka: Doc. RNDr. Jana Řepková, CSc.)

• Potenciál genového inženýrství rostlin v odolnosti k patogenům (školitelka: Doc. RNDr. Jana Řepková, CSc.) 

• Cannabis sativa v éře genomiky a biologické léčby (Doc. RNDr. Jana Řepková CSc., pro Kateřina Tejkalová)

• Možnosti celogenomového sekvenování při studiu genomů rodu Triforium (Doc. RNDr. Jana Řepková CSc.)

Integrované laboratoře molekulární cytogenetiky

• Analýza embryonálních dětských nádorů pomocí techniky DNA čipů (školitelka: RNDr. Vladimíra Vranová, Ph.D.)

• Variabilita počtu kopií a jeji význam v lékařské genetice (školitel: doc. RNDr. Petr Kuglík, CSc.)

• Molekulárně genetické aberace melanocytárních lézí (školitel: Doc. RNDr. Petr Kuglík, CSc.)

• Význam miRNA u karcinomu děložního hrdla (školitelka: RNDr.Vladimíra Vranová, Ph.D.)

• Mutace a polymorfizmy v genech ovlivňující sportovní výkony (Doc. RNDr. Petr Kuglík CSc.)

• Význam a možnosti celogenomového sekvenování u monoklonálních gamapatií (Mgr. Jan Smetana)

• Molekulární klasifikace mnohočetného myelomu v postgenomové éře (Mgr. Aneta Mikulášová)

• Význam a možnosti celogenomového sekvenování u pacientů s mentální retardací (RNDr. Vladimíra Vallová Ph.D.)

• Možnosti preimplantačního vyšetření strukturních chromosomových aberací (Mgr. Kateřina Kašíková)

Laboratoř biologické a molekulární antropologie

• Využití genetických metod při určování příbuznosti u příslušníků historických populací (školitelka: doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.)

• Problémy kontaminace a sterility při výzkumu aDNA historických populací (školitelka: doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.)

• Výzkum mitochondriální DNA u historických populací (školitelka: doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.)

• Způsoby ověřování autenticity aDNA u výzkumů historického kosterního materiálu (školitelka: doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.)

• Co nám říká neandrtálská DNA o Homo sapiens neanderthalensis. Mitochondriální DNA versus jaderná DNA (školitelka: doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.)

• Význam real time PCR pro studium historické DNA (školitelka: doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.)

• Metody a možnosti genetického určení pigmentace jedince (kůže, vlasy, oči) (školitelka: Doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.)

• Genetické metody určení skupiny ABO systému z lidského kosterního materiálu (školitelka: Doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.)

• Srovnání vlastností purifikačních a koncentračních komerčních kitů pro účely analýzy aDNA (školitelka: Doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.)

• Morová onemocnění způsobená Yersinií pestis u historických populací a možnosti jejich diagnostiky moderními genetickými metodami (na příkladech výzkumů) (doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.)

• Výskyt tuberkulózy u neolitických a eneolitických populací z ekologického a diagnostického hlediska (doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.)

• Začlenění genetického pohledu do výzkumu variability člověka (historický přehled) (doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.)

• Poruchy metabolismu purinových bází, jejich projevy a možnosti diagnostiky u středověkých a novověkých populací (doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.)

• Možnosti určení věku u lidských kosterních pozůstatků (forenzních případů a historických populací) genetickými metodami (doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.)

• Pohled na druhy rakovinných nádorů diagnostikovaných u historických populací z hlediska dědičnosti (doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.)

• Syndrom získaného selhání imunity jako model vzniku evolučních adaptací lidského organismu (doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.)

• Vzácné krevní skupiny a jejich význam pro adaptace organismu na extrémní podmínky životního prostředí (doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.)

• Umělé deformace lebky a jejich vliv na funkci mozku člověka (doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.)

• Diagnostika genetických onemocnění u historických populací (Mgr. Kateřina Boberová, Ph.D.)

• Technologie nové generace sekvenování (Next Generation Sequencing) a její využití při analýze aDNA (Mgr. Kateřina Boberová, Ph.D.)

• Využití genealogických databází pro studium DNA historických populací (Mgr. Kateřina Boberová, Ph.D.)

• Využití nových postupů sekvencování pro analýzu aDNA (Mgr. et Mgr. Kristýna Pížová)

• Lidský zub jako konzervátor aDNA (Mgr. Dana Fialová)

• Příčiny větších výtěžků aDNA z lidských zubů oproti jiným lidským tkáním (Mgr. Dana Fialová)

• Downův syndrom z hlediska současné antropologie a genetiky (PhDr. Marcela Křiváková, Ph.D.)

Loschmidtovy laboratoře

• Struktura, funkce a evoluce halogenalkandehalogenáz (školitel: Doc. Mgr. Jiří Damborský, Dr.)