FORENZNI ANTROPOLOGIE CVIČENI Bi7352c PROTOKOL Jméno: Ročník: Datum: 9.10.2012 Číslo a název cvičení: Analýza obrazu ve forenzní antropologii a určení biologického původu A) SigmaScan 5.0 Měření objektů na digitálním záznamu mikroskopické struktury a) Otevřete program SigmaScan a v něm snímek „SigmaScan.jpg". b) Měření musí předcházet kalibrace! Nakalibrujte snímek podle měřítka na snímku: Image>Calibrate>Distance and Area. Pro kalibraci za pomoci měřítka zvolte „2 Point -Rescalling", kurzorem klikněte na dva konce měřítka, které je součástí snímku. V políčku „Old Distance" se objeví původní hodnota vzdálenosti. Do políčka „New Distance" vepište skutečnou hodnotu v jednotkách, ve kterých chcete dostávat výsledky měření. c) Určete parametry, které chcete změřit: Measurement>Settings. V záložce „Measurements" program umožňuje zvolit parametry, které bude na objektech měřit. d) Zaškrtněte „Distance" e) Změřte šířku objektu na 5 libovolných místech, t.j. za pomoci nástroje „Trace" zakreslete průměr objektu na 5 místech, program automaticky zaznamenává vzdálenost do Worksheetu (je otevřen „za oknem s fotkou"). f) Zapište výslednou průměrnou tloušťku: Výsledek -_ B) Práce s histologickým atlasem Projděte si atlas histologických výbrusů na adrese www.sci.muni.cz/atlaskosti 1) Popište následující snímky (typ kostní tkáně-primární vs. sekundární, konfigurace lamel aj.) a na základě práce s atlasem zjistěte původ kostní tkáně Jméno: Datum: Jméno: Datum: C) Histomorfometrie Postup: a) Definování objektů pro měření - otevřete program SigmaScan a v něm snímek, který budete analyzovat. b) Na horní liště zvolte nástroj „Overlay Draw Mode" a obtáhněte okraje Haversových kanálků (minimálně 10 objektů!). Vyplňte obtažené objekty: Image> Overlay Filters>Fill Holes c) Nakalibrujte snímek podle měřítka na snímku stejně jako v úkolu A. d) Určete parametry, které budou automaticky změřeny: Measurement>Settings (Area - obsah zakreslených objektů, Major Axis Length - délka, Minor Axis Lenght - šířka, Perimeter -obvod.) e) Automaticky změřte objekty: Measurement - Measure Objects f) Požadované míry objektů jsou uvedeny ve worksheetu programu. Zkopírujte je a v Excelu vypočítejte medián jednotlivých parametrů. g) Opakujte výše uvedené kroky, tentokrát pro osteony na snímku (minimálně 4-5 objektů) tak, abyste získali hodnoty všech proměnných v následujících diskriminačních rovnicích (nejlépe na znovu otevřeném původním snímku). h) Určete klasifikační skóre pro oba typy klasifikačních rovnic uvedených na konci protokolu i) Porovnejte klasifikační skóre a určete biologický původ kosti na snímku. POZNÁMKY Pozor na měřítka - všechny parametry musí být ve stejných jednotkách 3 Jméno: Datum: 1) Hodnoty mediánu pro (č. snímku......................): Minimální průměr Haversova kanálku (DHKmin) Maximální průměr Haversova kanálku (DHKmax) Obsah Haversova kanálku (SHK) Obvod Haversova kanálku (PHK) Obsah osteonu (SO) Minimální průměr osteonu (DOmin) Maximální průměr osteonu (DOmax) Minor Axis Length (um) Major Axis Length (um) Area (um2) Perimeter Klasifikační skóre (rovnice 2 - zvířecí vs. lidské): Klasifikační skóre zvířecí vs. lidské Klasifikační skóre (rovnice 1 - určení taxonomické skupiny): SI člověk S2 Bos taurus a Equus caballus S3 Sus scrofa S4 Canis familiaris Vyšší taxonomické určení skupiny 1-4: (Nej vyšší hodnota S1-S4) 2) Hodnoty mediánu pro (č. snímku.....................): Minimální průměr Haversova kanálku (DHKmin) Maximální průměr Haversova kanálku (DHKmax) Obsah Haversova kanálku (SHK) Obvod Haversova kanálku (PHK) Obsah osteonu (SO) Minimální průměr osteonu (DOmin) Maximální průměr osteonu (DOmax) Minor Axis Length (um) Major Axis Length (um) Area (um2) Perimeter 4 Jméno: Datum: Klasifikační skóre (rovnice 2 - zvířecí vs. lidské): Klasifikační skóre zvířecí vs. lidské Klasifikační skóre (rovnice 1 - určení taxonomické skupiny): SI člověk S2 Bos taurus a Equus caballus S3 Sus scrufa S4 Canis familiaris Vyšší taxonomické určení skupiny 1-4: (Nej vyšší hodnota S1-S4) Rovnice 1: 51 = 103,502+ l,270xDHKmin + 0,232x DOmin -O.OOlx SO -0,048xSHK+0,483x DHKmax+0,261xDOmax+0,827x PHK 52 = 87,7787+ 0,8684xDHKmin + 0,278lx DOmin -0,0010x SO -0,0417xSHK-0,0227x DHKmax+0,2691xDOmax+0,8764x PHK 53 = 72,4070+ 0,7065xDHKmin + 0,3196x DOmin -0,0010xSO -0,0350xSHK-0,1542x DHKmax+0,2481xDOmax+0,7621x PHK 54 = 50,4210+ 0,6333xDHKmin + 0,2025x DOmin -0,0008xSO -0,0324xSHK+0,1187x DHKmax+0,2058xDOmax+0,6378x PHK Rovnice 2: D = -6,218167+0,155732xDHKmin-0,002607xSHK+0,152404xDHKmax-0,019254xDOmin+0,000022xSO D>0 lidské D<0 zvířecí 5