FORENZNÍ ANTROPOLOGIE CVIČENÍ Bi7352c PROTOKOL Jméno: Ročník: Datum: 23.10.2012 Číslo a název cvičení: Odhad pohlaví a etnické příslušnosti za pomoci softwaru Fordisc A) Odhad pohlaví a etnické příslušnosti na základě naměřených kraniometrických rozměrů i. naměřte níže uvedené rozměry ii. odhadněte pohlaví a populační afinitu změřené lebky v programu Fordisc 3.0 na základě porovnání s FDB referenčním souborem podle postupu uvedeného na konci protokolu iii. zaznamenejte populaci s největší afinitou, včetně uvedených statistik iv. odhadněte pohlaví a populační afinitu změřené lebky v programu Fordisc 3.0 na základě porovnání s Howellsovým referenčním souborem zaznamenejte populaci s největší afinitou, včetně uvedených statistik v. interpretujte získané výsledky GOL Maximum cranial length g-op UFBR* Upper Facial Breadth fmt-fmt XCB Maximum Cranial Breadth eu-eu NLH Nasal Height n-ns ZYB Bizygomatic Breadth zy-zy NLB Nasal Breadth al-al BBH Basion Bregma Height ba-b OBH Orbital Height BNL Cranial Base Length ba-na DKB Interorbital Breadth d-d BPL Basion Prosthion Length ba-pr FRC Frontal Chord n-b MAB Maxillo-Alveolar Breadth ecm-ecm PAC Parietal Chord b-l MAL Maxillo-Alveolar Length pr-alv OCC Occipital Chord l-o AUB Biauricular Breadth au-au FOL Foramen Magnum Length ba-o UFHT/NPHUpper Facial Height n-pr FOB Foramen Magnum Breadth WFB Minimum Frontal Breadth ft-ft MDH Mastoid Length lebka číslo: Group Posterior Probabilities Typ F (Typicality) Group Posterior Probabilities Typ F (Typicality) Jméno: Datum: 2 B) Odhad pohlaví a etnické příslušnosti na kraniometrických rozměrech získaných z virtuálního modelu i. Podle níže uvedeného návodu vypočtěte rozměry potřebné pro odhad pohlaví a populační příslušnosti (viz tabulka) programem Fordisc 2.0. Pokud nejste schopni odhadnout polohu některého z kraniometrických bodů, rozměry jím definované vynechejte. ii. odhadněte pohlaví a populační afinitu změřené lebky v programu Fordisc 2.0 na základě porovnání s FDB referenčním souborem podle postupu uvedeného na konci protokolu iii. zaznamenejte populaci s největší afinitou, včetně uvedených statistik iv. odhadněte pohlaví a populační afinitu změřené lebky v programu Fordisc 2.0 na základě porovnání s Howellsovým referenčním souborem zaznamenejte populaci s největší afinitou, včetně uvedených statistik v. interpretujte získané výsledky GOL Maximum cranial length g-op UFBR* Upper Facial Breadth fmt-fmt XCB Maximum Cranial Breadth eu-eu NLH Nasal Height n-ns ZYB Bizygomatic Breadth zy-zy NLB Nasal Breadth al-al BBH Basion Bregma Height ba-b OBH Orbital Height BNL Cranial Base Length ba-na DKB Interorbital Breadth d-d BPL Basion Prosthion Length ba-pr FRC Frontal Chord n-b MAB Maxillo-Alveolar Breadth ecm-ecm PAC Parietal Chord b-l MAL Maxillo-Alveolar Length pr-alv OCC Occipital Chord l-o AUB Biauricular Breadth au-au FOL Foramen Magnum Length ba-o UFHT/NPHUpper Facial Height n-pr FOB Foramen Magnum Breadth WFB Minimum Frontal Breadth ft-ft MDH Mastoid Length lebka číslo: Group Posterior Probabilities Typ F (Typicality) Group Posterior Probabilities Typ F (Typicality) Jméno: Datum: 3 Postup virtuálního měření 3D modelu lebky za pomoci programu Landmark Import modelu ve formátu ply • Otevřete program Landmark a vytvořte nový projekt: File > New. Do projektu importujte 3D model lebky uložený jako soubor „cviceni 6_lebka.ply“: File > Import > Into project. • V levém panelu klikněte pravým tlačítkem na importovaný model a zvolte možnost „Load into A“, model by se měl zobrazit v podokně A. Kliknutím na lištu s označením A se toto podokno zvětší. Pro hbitější odezvu programu můžete zrušit průhlednost modelu View > Surface > Transparent . Editace bodů • Zvolte Edit > Add single point (nebo na horní liště klikněte na ikonu s červeným bodem se žlutou šipkou) a pomocí Shift + levé tlačítko myši postupně přidávejte na povrch modelu význačné body v místě jejich definic. Body jsou postupně zaznamenány a očíslovány (od s0), pro přehlednost si pořadí můžete zapsat do vedlejší tabulky. S umístěným bodem můžete případně dále hýbat pomocí Edit – Select single point (ikona ruky držící červený bod) a opět přes Shift + levé tlačítko myši pohybujte bodem. Aktivní bod je žlutě zbarven. označení bod s0 S1 s2 s3 s4 s5 s6 s7 s8 s9 s10 s11 s12 s13 s14 s15 s16 s17 s18 s19 s20 Export souřadnic bodů Po umístění všech potřebných bodů exportujte souřadnice. • Klikněte pravým tlačítkem myši na název modelu v levém panelu > Export a zvolte „(*.pts) Raw landmarks points“. Převod dat do programu PAST • Otevřete exportovaný soubor (měl by se automaticky otevřít v poznámkovém bloku) a smažte jeho hlavičku (údaje nad souřadnicemi). Upravený soubor otevřete v programu PAST: File > Import text file > zaškrtněte „Includes“ a „First column of row labels a Whitespace“. • Přetransformujte souřadnice jednotlivých bodů tak, aby byly vedle sebe v jednom řádku: označte všechny tři sloupce pomocí Shift+levé tlačítko myši >Edit > Group columns to Multivar, zvolte „3“. Data budou zapsána v jednom řádku, vždy tři souřadnice jednoho bodu vedle sebe a navazující další bod. Pro lepší orientaci je dobré si sloupce pojmenovat podle bodů: na liště zatrhněte „Edit labels“ a přepište písmena označující sloupce (tj. místo A napište název prvního bodu, místo D název druhého atd.). Výpočet rozměrů • Označte řádek obsahující data, zvolte Geomet > Distance from landmarks (2D/3D) > Dimensions: 3D a pomocí šipek měňte body, mezi kterými program počítá vzdálenost. Potřebné vzdálenosti (rozměry) si zapište do tabulky. Jméno: Datum: 4 Postup odhadu pohlaví a populační afinity v Programu Fordisc 2.0 1) Odhad pohlaví Při analýze ve Fordiscu 2.0 se doporučuje nejdříve odhadnout pohlaví nezávisle na populační příslušnosti. Volba „Sex only“ není přítomná ve Fordiscu 3.0, ten tak umožňuje určit afinitu pouze ke konkrétnímu pohlaví konkrétní etnické skupiny. • Zadejte všechny naměřené/vypočtené hodnoty do příslušných polí v záložce „Cranial“. Použitý referenční soubor odpovídá souboru FDB ve Fordiscu 3. • Zaškrtněte volbu „Sex only“. Tato volba sloučí všechny muže a všechny ženy z referenčních populací do dvou celků a umožní odhadnout pohlaví nezávisle na populační příslušnosti. • Proveďte analýzu zmáčknutím „Process“. 2) Výsledek diskriminační analýzy Výsledek diskriminační analýzy je uveden ve druhé tabulce výsledků, včetně statistických hodnot „typicality“ a „ posterior probabilities“, popisujících vlastnosti odhadu. Levou ikonou panelu ikon můžete zobrazit histogram diskrimačního skóre analýzy. 3) Odhad etnické příslušnosti s využitím forenzní databáze • Volbou „Back to the data entry“ se vraťte zpět do zadávacího okna. • Zrušte volbu „Sex only“ a z nabízených referenčních skupin zvolte všechny daného pohlaví. • Opakujte analýzu – „Process“ 4) Výsledek • Součástí výsledků je populační afinita analyzované lebky, opět včetně hodnot „typicality“ a „ posterior probabilities“. Bodový graf kanonického skóre můžete zobrazit volbou „Show canonical plot“. 5) Odhad etnické příslušnosti s využitím Howellsovy ref. populace • Volbou „Back to the data entry“ se vraťte zpět do zadávacího okna. • Aktivujte záložku Howells, zaškrtněte referenční skupiny odpovídající pohlaví zjištěnému v kroku 1. • Získané výsledky odpovídají strukturou výsledkům z předchozího kroku. Jméno: Datum: 5 Postup odhadu pohlaví a populační afinity v Programu Fordisc 3.0 1) Počáteční analýza • V záložce „Options“ zvolte volbu "Individual scores" • Proveďte analýzu se všemi zadanými mírami a všemi referenčními populacemi z vybraného referenčního souboru (pro všechny body analýzy používejte jen jeden ze souborů – FDB nebo Howells). 2) Kontrola zadaných hodnot • Na konci výsledků je tabulka, porovnávající vámi naměřené hodnoty s průměrnou hodnotou referenčního souboru a s hodnotami jednotlivých populací. Počet plusů, resp. mínusů u každé z měr označuje odchylku vámi naměřené hodnoty od průměru referenčního souboru. Pokud je počet znamének vyšší než 2, zkontrolujte, jestli je daný rozměr naměřen a zadán správně. 4) Kontrola velikosti referenčních populací a počtu proměnných Pro zvýšení spolehlivosti analýzy by velikost jednotlivých referenčních populací měla dosahovat minimálně trojnásobku počtu proměnných (rozměrů). • V první tabulce výsledků je uveden počet proměnných, které byly analyzovány (mění se v závislosti na zvolených populacích) a také počet jedinců v jednotlivých referenčních populacích. Pokud je v některém případě velikost populace nižší než trojnásobek počtu použitých měr, zredukujte počet proměnných (odznačte je v zadávacím panelu), například podle přesnosti měření nebo redundance jimi nesené informace. Druhou možností je redukce populací na základě předběžných znalostí o analyzované lebce – pokud např. víte, že to určitě nebyl Asiat. 5) Analýza Proveďte novou analýzu. V tabulce výsledků, shrnující afinitu vámi analyzované lebky k jednotlivým referenčním skupinám zjistíte, která populace je nejvzdálenější, Tuto populaci odznačte v zadávacím okně a analýzu opakujte od bodu 4. Před dalším postupem nezapomeňte znovu aktivovat všechny zadané proměnné – odznačením populace jste totiž mohli ovlivnit počet proměnných vstupujících do analýzy a také mohlo jít o malou populaci, kvůli které jste v předchozím kroku omezili počet proměnných. Můžete odznačovat i více nepodobných populací současně, na konečném výsledku se to neprojeví. 6) Výsledek • Kroky 3 a 4 opakujte, dokud nezredukujete počet referenčních populací na 2-4. Vždy zkontrolujte velikost populací k počtu proměnných. Zaznamenejte výsledek, včetně hodnot pravděpodobností. 3) Kontrola odlehlých případů Pro správný průběh analýzy je nejprve potřeba odstranit z referenčního souboru odlehlé případy, tj. případy, které jsou příliš vzdálené zbytku své referenční skupiny. • V rozšířených výsledcích Results > Extended, najděte tabulku „CROSSVALIDATED Distances to Reference Group Centroids“, ID případů označených červeně, zapište v záložce „OPTIONS“ do pole „Exclude IDs: tyto případy budou vyloučeny z dalších analýz.