Bi7722 Metody analýzy mikroorganizmů II
Verze 2012
1) Repetitorium metod analýzy mikroorganismů. Metody kultivační, metody nekultivační.
2) Amplifikační metody v molekulární diagnostice mikroorganismů. Amplifikace cílové sekvence
DNA, amplifikace sondy a signálu neseného sondou.
3) PCR v reálném čase. Detekce amplifikačních produktů v reálném čase. TaqMan sondy,
hybridizační sondy, vlásenkové sondy a molekulární majáčky.
4) Enzymy používané při manipulaci s nukleovými kyselinami. Restrikční mapy. Detekce
polymorfismů v genomech. Molekulárně typizační metody v mikrobiologii. DNA fingerprinty.
Analýza proteinů a proteinové fingerprinty.
5) Způsoby provedení hybridizace. Hybridizace v roztoku a na pevné fázi. Fluorescentní in situ
hybridizace. Využití metod hybridizace v analýze mikroorganismů.
6) Mikročipy, jejich konstrukce a jejich použití v mikrobiologii.
7) Sekvenování nukleových kyselin a analýza DNA sekvencí.
8) Příprava rekombinantních DNA molekul pro diagnostické účely. Sondy NK, jejich
charakterizace a použití. Značení a způsoby detekce sond.
9) Využití rekombinantní DNA při studiu mikroorganismů.
10) Analýza mikrobiálních komunit – metagenomika.
11) Využití internetových zdrojů při studiu mikroorganismů
12) Validace laboratorních mikrobiologických metod. Akreditace laboratoří.